Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
J3KT08 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
J3KT08 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
J3KT08 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
J3KT08 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms