RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322263.8

TULP1-202, Transcript of tubby like protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TULP1, Length 1,941 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1-202ENST00000322263 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.02■■■■■ 5.44
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TULP1-202ENST00000322263 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
TULP1-202ENST00000322263 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.51■■■■■ 4.08
TULP1-202ENST00000322263 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.48■■■■■ 4.07
TULP1-202ENST00000322263 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.28■■■■■ 4.04
TULP1-202ENST00000322263 ABCC9O60706 1549 aa40.05■■■■■ 4
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TULP1-202ENST00000322263 NACADO15069 1562 aa39.62■■■■□ 3.93
TULP1-202ENST00000322263 SCRIBQ14160 1630 aa39.28■■■■□ 3.88
TULP1-202ENST00000322263 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.24■■■■□ 3.87
TULP1-202ENST00000322263 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.91■■■■□ 3.82
TULP1-202ENST00000322263 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.48■■■■□ 3.75
TULP1-202ENST00000322263 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.69
TULP1-202ENST00000322263 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.05■■■■□ 3.68
TULP1-202ENST00000322263 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.99■■■■□ 3.67
TULP1-202ENST00000322263 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.88■■■■□ 3.65
TULP1-202ENST00000322263 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
TULP1-202ENST00000322263 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.82■■■■□ 3.64
TULP1-202ENST00000322263 SMARCA4P51532 1647 aa37.65■■■■□ 3.62
TULP1-202ENST00000322263 WIZO95785 1651 aa37.64■■■■□ 3.62
TULP1-202ENST00000322263 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.35■■■■□ 3.57
TULP1-202ENST00000322263 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
TULP1-202ENST00000322263 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.13■■■■□ 3.53
TULP1-202ENST00000322263 SMARCA2P51531 1590 aa36.94■■■■□ 3.5
TULP1-202ENST00000322263 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.92■■■■□ 3.5
TULP1-202ENST00000322263 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
TULP1-202ENST00000322263 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.84■■■■□ 3.49
TULP1-202ENST00000322263 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
TULP1-202ENST00000322263 TRIM41Q8WV44 630 aa36.56■■■■□ 3.44
TULP1-202ENST00000322263 HMGXB3Q12766 1538 aa36.54■■■■□ 3.44
TULP1-202ENST00000322263 NCAPD3P42695 1498 aa36.53■■■■□ 3.44
TULP1-202ENST00000322263 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.25■■■■□ 3.39
TULP1-202ENST00000322263 ABCC8Q09428 1581 aa36.2■■■■□ 3.39
TULP1-202ENST00000322263 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.95■■■■□ 3.34
TULP1-202ENST00000322263 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.92■■■■□ 3.34
TULP1-202ENST00000322263 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
TULP1-202ENST00000322263 CFTRP13569 1480 aa35.82■■■■□ 3.32
TULP1-202ENST00000322263 SYNJ1O43426 1573 aa35.76■■■■□ 3.32
TULP1-202ENST00000322263 PRDM2Q13029 1718 aa35.76■■■■□ 3.31
TULP1-202ENST00000322263 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.64■■■■□ 3.3
TULP1-202ENST00000322263 TOP2BQ02880 1626 aa35.6■■■■□ 3.29
TULP1-202ENST00000322263 EEA1Q15075 1411 aa35.58■■■■□ 3.29
TULP1-202ENST00000322263 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.56■■■■□ 3.28
TULP1-202ENST00000322263 SOGA1O94964 1423 aa35.56■■■■□ 3.28
TULP1-202ENST00000322263 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.42■■■■□ 3.26
TULP1-202ENST00000322263 CUX1P39880 1505 aa35.41■■■■□ 3.26
TULP1-202ENST00000322263 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.4■■■■□ 3.26
TULP1-202ENST00000322263 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.34■■■■□ 3.25
TULP1-202ENST00000322263 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.29■■■■□ 3.24
TULP1-202ENST00000322263 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.27■■■■□ 3.24
TULP1-202ENST00000322263 NESP48681 1621 aa35.23■■■■□ 3.23
TULP1-202ENST00000322263 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.14■■■■□ 3.22
TULP1-202ENST00000322263 GOLGA3Q08378 1498 aa35.12■■■■□ 3.21
TULP1-202ENST00000322263 KIF21BO75037 1637 aa35.11■■■■□ 3.21
TULP1-202ENST00000322263 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.09■■■■□ 3.21
TULP1-202ENST00000322263 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.04■■■■□ 3.2
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TULP1-202ENST00000322263 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.01■■■■□ 3.2
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TULP1-202ENST00000322263 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.99■■■■□ 3.19
TULP1-202ENST00000322263 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
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TULP1-202ENST00000322263 CEP162Q5TB80 1403 aa34.9■■■■□ 3.18
TULP1-202ENST00000322263 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.87■■■■□ 3.17
TULP1-202ENST00000322263 CUX2O14529 1486 aa34.84■■■■□ 3.17
TULP1-202ENST00000322263 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.83■■■■□ 3.17
TULP1-202ENST00000322263 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.81■■■■□ 3.16
TULP1-202ENST00000322263 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
TULP1-202ENST00000322263 PRXQ9BXM0 1461 aa34.79■■■■□ 3.16
TULP1-202ENST00000322263 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
TULP1-202ENST00000322263 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.68■■■■□ 3.14
TULP1-202ENST00000322263 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.67■■■■□ 3.14
TULP1-202ENST00000322263 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.67■■■■□ 3.14
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TULP1-202ENST00000322263 CUL7Q14999 1698 aa34.39■■■■□ 3.1
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TULP1-202ENST00000322263 ARAP1Q96P48 1450 aa34.16■■■■□ 3.06
TULP1-202ENST00000322263 IFT140Q96RY7 1462 aa34.16■■■■□ 3.06
TULP1-202ENST00000322263 PBRM1Q86U86 1689 aa34.14■■■■□ 3.06
TULP1-202ENST00000322263 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.09■■■■□ 3.05
TULP1-202ENST00000322263 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.08■■■■□ 3.05
TULP1-202ENST00000322263 APLP2Q06481 763 aa34.05■■■■□ 3.04
TULP1-202ENST00000322263 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.03■■■■□ 3.04
TULP1-202ENST00000322263 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
TULP1-202ENST00000322263 GRIN2BQ13224 1484 aa33.99■■■■□ 3.03
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