RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273861.4

SLC10A4-201, Transcript of solute carrier family 10 member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC10A4, Length 1,790 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4-201ENST00000273861 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.26■■■■■ 6.12
SLC10A4-201ENST00000273861 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.8■■■■■ 5.08
SLC10A4-201ENST00000273861 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.74
SLC10A4-201ENST00000273861 ABCC9O60706 1549 aa44.6■■■■■ 4.73
SLC10A4-201ENST00000273861 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.13■■■■■ 4.65
SLC10A4-201ENST00000273861 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.99■■■■■ 4.63
SLC10A4-201ENST00000273861 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.85■■■■■ 4.61
SLC10A4-201ENST00000273861 NACADO15069 1562 aa43.7■■■■■ 4.59
SLC10A4-201ENST00000273861 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.44■■■■■ 4.54
SLC10A4-201ENST00000273861 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.84■■■■■ 4.45
SLC10A4-201ENST00000273861 SCRIBQ14160 1630 aa42.81■■■■■ 4.44
SLC10A4-201ENST00000273861 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.55■■■■■ 4.4
SLC10A4-201ENST00000273861 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.12■■■■■ 4.33
SLC10A4-201ENST00000273861 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.89■■■■■ 4.3
SLC10A4-201ENST00000273861 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.36■■■■■ 4.21
SLC10A4-201ENST00000273861 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
SLC10A4-201ENST00000273861 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.08■■■■■ 4.17
SLC10A4-201ENST00000273861 SMARCA4P51532 1647 aa41.07■■■■■ 4.17
SLC10A4-201ENST00000273861 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
SLC10A4-201ENST00000273861 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
SLC10A4-201ENST00000273861 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
SLC10A4-201ENST00000273861 WIZO95785 1651 aa40.71■■■■■ 4.11
SLC10A4-201ENST00000273861 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.66■■■■■ 4.1
SLC10A4-201ENST00000273861 SMARCA2P51531 1590 aa40.53■■■■■ 4.08
SLC10A4-201ENST00000273861 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.53■■■■■ 4.08
SLC10A4-201ENST00000273861 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.42■■■■■ 4.06
SLC10A4-201ENST00000273861 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
SLC10A4-201ENST00000273861 NCAPD3P42695 1498 aa40.32■■■■■ 4.04
SLC10A4-201ENST00000273861 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
SLC10A4-201ENST00000273861 HMGXB3Q12766 1538 aa40.23■■■■■ 4.03
SLC10A4-201ENST00000273861 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.86■■■■□ 3.97
SLC10A4-201ENST00000273861 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.84■■■■□ 3.97
SLC10A4-201ENST00000273861 CFTRP13569 1480 aa39.25■■■■□ 3.87
SLC10A4-201ENST00000273861 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.2■■■■□ 3.87
SLC10A4-201ENST00000273861 PRDM2Q13029 1718 aa39.08■■■■□ 3.85
SLC10A4-201ENST00000273861 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.05■■■■□ 3.84
SLC10A4-201ENST00000273861 NESP48681 1621 aa38.97■■■■□ 3.83
SLC10A4-201ENST00000273861 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.97■■■■□ 3.83
SLC10A4-201ENST00000273861 ABCC8Q09428 1581 aa38.79■■■■□ 3.8
SLC10A4-201ENST00000273861 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.75■■■■□ 3.79
SLC10A4-201ENST00000273861 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.74■■■■□ 3.79
SLC10A4-201ENST00000273861 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.66■■■■□ 3.78
SLC10A4-201ENST00000273861 TRIM41Q8WV44 630 aa38.62■■■■□ 3.77
SLC10A4-201ENST00000273861 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.58■■■■□ 3.77
SLC10A4-201ENST00000273861 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.57■■■■□ 3.77
SLC10A4-201ENST00000273861 SYNJ1O43426 1573 aa38.52■■■■□ 3.76
SLC10A4-201ENST00000273861 TOP2BQ02880 1626 aa38.47■■■■□ 3.75
SLC10A4-201ENST00000273861 CUX1P39880 1505 aa38.46■■■■□ 3.75
SLC10A4-201ENST00000273861 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.45■■■■□ 3.75
SLC10A4-201ENST00000273861 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.33■■■■□ 3.73
SLC10A4-201ENST00000273861 ERCC6Q03468 1493 aa38.32■■■■□ 3.72
SLC10A4-201ENST00000273861 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
SLC10A4-201ENST00000273861 TOPBP1Q92547 1522 aa38.28■■■■□ 3.72
SLC10A4-201ENST00000273861 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.25■■■■□ 3.71
SLC10A4-201ENST00000273861 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.12■■■■□ 3.69
SLC10A4-201ENST00000273861 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
SLC10A4-201ENST00000273861 WDR62O43379 1518 aa38.11■■■■□ 3.69
SLC10A4-201ENST00000273861 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
SLC10A4-201ENST00000273861 SOGA1O94964 1423 aa37.94■■■■□ 3.66
SLC10A4-201ENST00000273861 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.86■■■■□ 3.65
SLC10A4-201ENST00000273861 EEA1Q15075 1411 aa37.85■■■■□ 3.65
SLC10A4-201ENST00000273861 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.82■■■■□ 3.65
SLC10A4-201ENST00000273861 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.82■■■■□ 3.65
SLC10A4-201ENST00000273861 CUX2O14529 1486 aa37.81■■■■□ 3.64
SLC10A4-201ENST00000273861 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.79■■■■□ 3.64
SLC10A4-201ENST00000273861 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
SLC10A4-201ENST00000273861 WDR97A6NE52 1622 aa37.77■■■■□ 3.64
SLC10A4-201ENST00000273861 KIF27Q86VH2 1401 aa37.75■■■■□ 3.63
SLC10A4-201ENST00000273861 IFT140Q96RY7 1462 aa37.71■■■■□ 3.63
SLC10A4-201ENST00000273861 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.63■■■■□ 3.61
SLC10A4-201ENST00000273861 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.56■■■■□ 3.6
SLC10A4-201ENST00000273861 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
SLC10A4-201ENST00000273861 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.49■■■■□ 3.59
SLC10A4-201ENST00000273861 IGF1RP08069 1367 aa37.47■■■■□ 3.59
SLC10A4-201ENST00000273861 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.46■■■■□ 3.59
SLC10A4-201ENST00000273861 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.42■■■■□ 3.58
SLC10A4-201ENST00000273861 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.39■■■■□ 3.58
SLC10A4-201ENST00000273861 KIF21BO75037 1637 aa37.39■■■■□ 3.58
SLC10A4-201ENST00000273861 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.38■■■■□ 3.57
SLC10A4-201ENST00000273861 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
SLC10A4-201ENST00000273861 PRXQ9BXM0 1461 aa37.37■■■■□ 3.57
SLC10A4-201ENST00000273861 PBRM1Q86U86 1689 aa37.34■■■■□ 3.57
SLC10A4-201ENST00000273861 GRIN2BQ13224 1484 aa37.3■■■■□ 3.56
SLC10A4-201ENST00000273861 CUL7Q14999 1698 aa37.29■■■■□ 3.56
SLC10A4-201ENST00000273861 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.26■■■■□ 3.56
SLC10A4-201ENST00000273861 GOLGA3Q08378 1498 aa37.25■■■■□ 3.55
SLC10A4-201ENST00000273861 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.22■■■■□ 3.55
SLC10A4-201ENST00000273861 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.19■■■■□ 3.54
SLC10A4-201ENST00000273861 ADAMTS12P58397 1594 aa37.1■■■■□ 3.53
SLC10A4-201ENST00000273861 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.08■■■■□ 3.53
SLC10A4-201ENST00000273861 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.07■■■■□ 3.53
SLC10A4-201ENST00000273861 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.53
SLC10A4-201ENST00000273861 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
SLC10A4-201ENST00000273861 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.03■■■■□ 3.52
SLC10A4-201ENST00000273861 SYNJ2O15056 1496 aa36.91■■■■□ 3.5
SLC10A4-201ENST00000273861 GRIN2AQ12879 1464 aa36.83■■■■□ 3.49
SLC10A4-201ENST00000273861 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
SLC10A4-201ENST00000273861 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.78■■■■□ 3.48
SLC10A4-201ENST00000273861 CEP162Q5TB80 1403 aa36.76■■■■□ 3.47
SLC10A4-201ENST00000273861 FBLN2P98095 1184 aa36.7■■■■□ 3.47
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