Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMD6Q96NE9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMD6Q96NE9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMD6Q96NE9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FRMD6Q96NE9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMD6Q96NE9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMD6Q96NE9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FRMD6Q96NE9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMD6Q96NE9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMD6Q96NE9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMD6Q96NE9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMD6Q96NE9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMD6Q96NE9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMD6Q96NE9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMD6Q96NE9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMD6Q96NE9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMD6Q96NE9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMD6Q96NE9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMD6Q96NE9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMD6Q96NE9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD6Q96NE9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD6Q96NE9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMD6Q96NE9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMD6Q96NE9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMD6Q96NE9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMD6Q96NE9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMD6Q96NE9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMD6Q96NE9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMD6Q96NE9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMD6Q96NE9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMD6Q96NE9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMD6Q96NE9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMD6Q96NE9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMD6Q96NE9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMD6Q96NE9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMD6Q96NE9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMD6Q96NE9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMD6Q96NE9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMD6Q96NE9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMD6Q96NE9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FRMD6Q96NE9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMD6Q96NE9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMD6Q96NE9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FRMD6Q96NE9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FRMD6Q96NE9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMD6Q96NE9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMD6Q96NE9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMD6Q96NE9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMD6Q96NE9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMD6Q96NE9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMD6Q96NE9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMD6Q96NE9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMD6Q96NE9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMD6Q96NE9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMD6Q96NE9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMD6Q96NE9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMD6Q96NE9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMD6Q96NE9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMD6Q96NE9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMD6Q96NE9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms