Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ1

CD300LF, CMRF35-like molecule 1, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300LFQ8TDQ1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD300LFQ8TDQ1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CD300LFQ8TDQ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD300LFQ8TDQ1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD300LFQ8TDQ1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD300LFQ8TDQ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD300LFQ8TDQ1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD300LFQ8TDQ1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD300LFQ8TDQ1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD300LFQ8TDQ1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD300LFQ8TDQ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD300LFQ8TDQ1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD300LFQ8TDQ1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD300LFQ8TDQ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD300LFQ8TDQ1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD300LFQ8TDQ1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD300LFQ8TDQ1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD300LFQ8TDQ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD300LFQ8TDQ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD300LFQ8TDQ1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD300LFQ8TDQ1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD300LFQ8TDQ1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD300LFQ8TDQ1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD300LFQ8TDQ1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CD300LFQ8TDQ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD300LFQ8TDQ1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD300LFQ8TDQ1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD300LFQ8TDQ1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD300LFQ8TDQ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD300LFQ8TDQ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD300LFQ8TDQ1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD300LFQ8TDQ1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CD300LFQ8TDQ1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD300LFQ8TDQ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD300LFQ8TDQ1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD300LFQ8TDQ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD300LFQ8TDQ1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD300LFQ8TDQ1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD300LFQ8TDQ1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD300LFQ8TDQ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD300LFQ8TDQ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD300LFQ8TDQ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD300LFQ8TDQ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD300LFQ8TDQ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD300LFQ8TDQ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD300LFQ8TDQ1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD300LFQ8TDQ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD300LFQ8TDQ1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD300LFQ8TDQ1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CD300LFQ8TDQ1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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