Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN8

CLEC9A, C-type lectin domain family 9 member A, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC9AQ6UXN8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC9AQ6UXN8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC9AQ6UXN8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC9AQ6UXN8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC9AQ6UXN8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC9AQ6UXN8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC9AQ6UXN8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC9AQ6UXN8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC9AQ6UXN8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC9AQ6UXN8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC9AQ6UXN8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC9AQ6UXN8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC9AQ6UXN8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC9AQ6UXN8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC9AQ6UXN8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC9AQ6UXN8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC9AQ6UXN8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC9AQ6UXN8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC9AQ6UXN8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC9AQ6UXN8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLEC9AQ6UXN8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLEC9AQ6UXN8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLEC9AQ6UXN8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLEC9AQ6UXN8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLEC9AQ6UXN8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLEC9AQ6UXN8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLEC9AQ6UXN8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLEC9AQ6UXN8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLEC9AQ6UXN8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLEC9AQ6UXN8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLEC9AQ6UXN8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLEC9AQ6UXN8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLEC9AQ6UXN8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLEC9AQ6UXN8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLEC9AQ6UXN8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLEC9AQ6UXN8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLEC9AQ6UXN8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLEC9AQ6UXN8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLEC9AQ6UXN8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC9AQ6UXN8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC9AQ6UXN8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC9AQ6UXN8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC9AQ6UXN8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC9AQ6UXN8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC9AQ6UXN8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC9AQ6UXN8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC9AQ6UXN8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC9AQ6UXN8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC9AQ6UXN8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC9AQ6UXN8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC9AQ6UXN8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC9AQ6UXN8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC9AQ6UXN8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC9AQ6UXN8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC9AQ6UXN8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC9AQ6UXN8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC9AQ6UXN8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC9AQ6UXN8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC9AQ6UXN8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC9AQ6UXN8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC9AQ6UXN8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC9AQ6UXN8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC9AQ6UXN8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC9AQ6UXN8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC9AQ6UXN8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC9AQ6UXN8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC9AQ6UXN8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC9AQ6UXN8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC9AQ6UXN8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLEC9AQ6UXN8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC9AQ6UXN8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC9AQ6UXN8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC9AQ6UXN8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC9AQ6UXN8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC9AQ6UXN8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC9AQ6UXN8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC9AQ6UXN8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC9AQ6UXN8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC9AQ6UXN8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC9AQ6UXN8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC9AQ6UXN8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC9AQ6UXN8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1107 ms