Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
RTL5Q5HYW3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RTL5Q5HYW3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
RTL5Q5HYW3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
RTL5Q5HYW3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RTL5Q5HYW3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RTL5Q5HYW3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RTL5Q5HYW3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RTL5Q5HYW3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RTL5Q5HYW3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RTL5Q5HYW3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RTL5Q5HYW3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RTL5Q5HYW3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
RTL5Q5HYW3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RTL5Q5HYW3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RTL5Q5HYW3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RTL5Q5HYW3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTL5Q5HYW3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTL5Q5HYW3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTL5Q5HYW3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTL5Q5HYW3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RTL5Q5HYW3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RTL5Q5HYW3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RTL5Q5HYW3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RTL5Q5HYW3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RTL5Q5HYW3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RTL5Q5HYW3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RTL5Q5HYW3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RTL5Q5HYW3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RTL5Q5HYW3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RTL5Q5HYW3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RTL5Q5HYW3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RTL5Q5HYW3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RTL5Q5HYW3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RTL5Q5HYW3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RTL5Q5HYW3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RTL5Q5HYW3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RTL5Q5HYW3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RTL5Q5HYW3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RTL5Q5HYW3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RTL5Q5HYW3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RTL5Q5HYW3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RTL5Q5HYW3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RTL5Q5HYW3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RTL5Q5HYW3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RTL5Q5HYW3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
RTL5Q5HYW3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RTL5Q5HYW3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RTL5Q5HYW3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RTL5Q5HYW3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RTL5Q5HYW3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RTL5Q5HYW3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RTL5Q5HYW3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RTL5Q5HYW3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RTL5Q5HYW3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RTL5Q5HYW3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RTL5Q5HYW3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RTL5Q5HYW3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RTL5Q5HYW3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RTL5Q5HYW3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RTL5Q5HYW3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RTL5Q5HYW3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RTL5Q5HYW3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RTL5Q5HYW3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RTL5Q5HYW3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RTL5Q5HYW3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RTL5Q5HYW3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RTL5Q5HYW3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RTL5Q5HYW3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RTL5Q5HYW3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RTL5Q5HYW3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RTL5Q5HYW3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RTL5Q5HYW3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RTL5Q5HYW3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RTL5Q5HYW3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RTL5Q5HYW3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RTL5Q5HYW3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RTL5Q5HYW3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RTL5Q5HYW3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RTL5Q5HYW3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RTL5Q5HYW3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RTL5Q5HYW3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RTL5Q5HYW3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RTL5Q5HYW3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RTL5Q5HYW3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RTL5Q5HYW3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RTL5Q5HYW3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RTL5Q5HYW3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RTL5Q5HYW3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RTL5Q5HYW3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RTL5Q5HYW3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RTL5Q5HYW3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RTL5Q5HYW3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RTL5Q5HYW3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RTL5Q5HYW3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RTL5Q5HYW3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RTL5Q5HYW3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTL5Q5HYW3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTL5Q5HYW3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RTL5Q5HYW3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms