Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDR1P51861 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDR1P51861 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDR1P51861 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CDR1P51861 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDR1P51861 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDR1P51861 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDR1P51861 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDR1P51861 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDR1P51861 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDR1P51861 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDR1P51861 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CDR1P51861 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDR1P51861 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDR1P51861 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDR1P51861 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDR1P51861 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDR1P51861 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDR1P51861 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDR1P51861 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDR1P51861 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDR1P51861 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CDR1P51861 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDR1P51861 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDR1P51861 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDR1P51861 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CDR1P51861 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDR1P51861 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDR1P51861 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDR1P51861 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDR1P51861 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDR1P51861 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDR1P51861 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDR1P51861 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDR1P51861 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDR1P51861 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDR1P51861 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDR1P51861 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDR1P51861 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDR1P51861 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDR1P51861 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDR1P51861 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDR1P51861 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDR1P51861 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDR1P51861 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDR1P51861 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDR1P51861 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDR1P51861 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDR1P51861 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CDR1P51861 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDR1P51861 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDR1P51861 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDR1P51861 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDR1P51861 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDR1P51861 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDR1P51861 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDR1P51861 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDR1P51861 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDR1P51861 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDR1P51861 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDR1P51861 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDR1P51861 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDR1P51861 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDR1P51861 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDR1P51861 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDR1P51861 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDR1P51861 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDR1P51861 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDR1P51861 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDR1P51861 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDR1P51861 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDR1P51861 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDR1P51861 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDR1P51861 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDR1P51861 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDR1P51861 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDR1P51861 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDR1P51861 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDR1P51861 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDR1P51861 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDR1P51861 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDR1P51861 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDR1P51861 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CDR1P51861 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDR1P51861 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDR1P51861 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDR1P51861 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDR1P51861 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDR1P51861 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDR1P51861 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDR1P51861 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDR1P51861 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDR1P51861 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDR1P51861 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDR1P51861 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CDR1P51861 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDR1P51861 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDR1P51861 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDR1P51861 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDR1P51861 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms