Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDR1P51861 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDR1P51861 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDR1P51861 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CDR1P51861 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDR1P51861 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDR1P51861 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDR1P51861 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDR1P51861 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDR1P51861 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDR1P51861 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDR1P51861 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CDR1P51861 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDR1P51861 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDR1P51861 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDR1P51861 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDR1P51861 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDR1P51861 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDR1P51861 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDR1P51861 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDR1P51861 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDR1P51861 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CDR1P51861 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDR1P51861 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDR1P51861 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDR1P51861 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CDR1P51861 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDR1P51861 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDR1P51861 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDR1P51861 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDR1P51861 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDR1P51861 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDR1P51861 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDR1P51861 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDR1P51861 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDR1P51861 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDR1P51861 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDR1P51861 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDR1P51861 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDR1P51861 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDR1P51861 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDR1P51861 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDR1P51861 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDR1P51861 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDR1P51861 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDR1P51861 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDR1P51861 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDR1P51861 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDR1P51861 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CDR1P51861 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDR1P51861 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDR1P51861 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDR1P51861 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDR1P51861 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDR1P51861 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDR1P51861 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDR1P51861 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDR1P51861 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDR1P51861 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDR1P51861 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDR1P51861 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDR1P51861 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDR1P51861 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDR1P51861 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDR1P51861 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDR1P51861 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDR1P51861 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDR1P51861 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDR1P51861 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDR1P51861 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDR1P51861 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDR1P51861 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDR1P51861 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDR1P51861 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDR1P51861 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDR1P51861 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDR1P51861 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDR1P51861 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDR1P51861 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDR1P51861 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDR1P51861 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDR1P51861 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDR1P51861 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CDR1P51861 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDR1P51861 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDR1P51861 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDR1P51861 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDR1P51861 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDR1P51861 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDR1P51861 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDR1P51861 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDR1P51861 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDR1P51861 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDR1P51861 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDR1P51861 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CDR1P51861 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDR1P51861 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDR1P51861 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDR1P51861 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDR1P51861 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms