Protein–RNA interactions for Protein: P49585

PCYT1A, Choline-phosphate cytidylyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1AP49585 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCYT1AP49585 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCYT1AP49585 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCYT1AP49585 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCYT1AP49585 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCYT1AP49585 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCYT1AP49585 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCYT1AP49585 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCYT1AP49585 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCYT1AP49585 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCYT1AP49585 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCYT1AP49585 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCYT1AP49585 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCYT1AP49585 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCYT1AP49585 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCYT1AP49585 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCYT1AP49585 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCYT1AP49585 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCYT1AP49585 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCYT1AP49585 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCYT1AP49585 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCYT1AP49585 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCYT1AP49585 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCYT1AP49585 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCYT1AP49585 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCYT1AP49585 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCYT1AP49585 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCYT1AP49585 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCYT1AP49585 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PCYT1AP49585 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCYT1AP49585 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCYT1AP49585 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCYT1AP49585 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCYT1AP49585 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCYT1AP49585 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCYT1AP49585 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCYT1AP49585 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCYT1AP49585 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCYT1AP49585 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCYT1AP49585 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCYT1AP49585 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCYT1AP49585 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCYT1AP49585 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCYT1AP49585 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCYT1AP49585 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCYT1AP49585 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCYT1AP49585 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCYT1AP49585 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCYT1AP49585 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCYT1AP49585 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCYT1AP49585 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PCYT1AP49585 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms