Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QR89 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QR89 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QR89 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
J3QR89 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QR89 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QR89 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QR89 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QR89 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QR89 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QR89 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QR89 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QR89 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QR89 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QR89 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QR89 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QR89 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QR89 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QR89 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QR89 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QR89 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QR89 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QR89 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QR89 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QR89 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QR89 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QR89 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QR89 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QR89 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QR89 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QR89 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QR89 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QR89 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QR89 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QR89 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QR89 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QR89 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QR89 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QR89 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QR89 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QR89 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QR89 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QR89 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QR89 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QR89 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QR89 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QR89 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QR89 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QR89 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QR89 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QR89 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QR89 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QR89 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QR89 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QR89 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QR89 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QR89 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QR89 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QR89 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
J3QR89 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
J3QR89 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3QR89 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3QR89 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3QR89 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QR89 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QR89 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QR89 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QR89 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QR89 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QR89 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QR89 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QR89 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QR89 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QR89 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QR89 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QR89 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QR89 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QR89 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QR89 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QR89 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QR89 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QR89 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QR89 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QR89 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QR89 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QR89 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QR89 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QR89 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QR89 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QR89 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QR89 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QR89 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QR89 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QR89 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QR89 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QR89 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR89 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR89 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR89 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR89 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms