Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 NUDT22-209ENST00000539325 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.5■□□□□ 0.397e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.397e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ANO10-209ENST00000436073 497 ntTSL 417.45■□□□□ 0.387e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.377e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 UBE2E1-209ENST00000484048 786 ntTSL 317.33■□□□□ 0.367e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.367e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.367e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 OCA2-203ENST00000431101 996 ntTSL 317.24■□□□□ 0.358e-7■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.357e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.357e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GGH-204ENST00000518966 574 ntTSL 217.18■□□□□ 0.347e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RNASEH2A-204ENST00000593017 1487 ntTSL 217.15■□□□□ 0.349e-8■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TXNDC16-202ENST00000554399 504 ntTSL 417.12■□□□□ 0.337e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 EMID1-209ENST00000484039 770 ntTSL 517.09■□□□□ 0.337e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.337e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.327e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.317e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 DDB2-216ENST00000622878 556 ntTSL 416.97■□□□□ 0.317e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.37e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 LRRFIP1-207ENST00000465870 1626 ntTSL 316.87■□□□□ 0.297e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PML-212ENST00000564725 4620 ntTSL 1 (best)16.87■□□□□ 0.297e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ANO10-208ENST00000428831 641 ntTSL 516.82■□□□□ 0.287e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PML-213ENST00000565239 783 ntTSL 316.79■□□□□ 0.287e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 OCA2-204ENST00000445578 750 ntTSL 316.72■□□□□ 0.278e-7■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.277e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CCDC28B-205ENST00000483009 615 ntTSL 516.71■□□□□ 0.277e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MSI2-205ENST00000577241 710 ntTSL 316.7■□□□□ 0.267e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 IDH3B-203ENST00000462967 959 ntTSL 216.67■□□□□ 0.267e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.267e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PPIG-203ENST00000414307 1062 ntTSL 1 (best)16.63■□□□□ 0.257e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SERPINF1-205ENST00000571360 478 ntTSL 316.62■□□□□ 0.258e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.247e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.247e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.247e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.247e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.237e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RETREG2-205ENST00000443757 558 ntTSL 416.43■□□□□ 0.227e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.227e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.217e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 KLF11-204ENST00000448523 559 ntTSL 416.38■□□□□ 0.217e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TCHP-208ENST00000549550 465 ntTSL 316.3■□□□□ 0.27e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GSTCD-204ENST00000484843 2228 ntTSL 216.27■□□□□ 0.27e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CABLES2-202ENST00000453274 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.26■□□□□ 0.197e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.197e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SERPINF1-206ENST00000571870 739 ntTSL 216.2■□□□□ 0.188e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.187e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FUK-203ENST00000464499 4439 ntTSL 216.17■□□□□ 0.187e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.187e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GNB3-207ENST00000541978 962 ntTSL 216.09■□□□□ 0.177e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GNB3-206ENST00000541257 761 ntTSL 516.07■□□□□ 0.167e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.167e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.147e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.137e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.81■□□□□ 0.127e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.127e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.117e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RCL1-207ENST00000445485 1878 ntTSL 215.75■□□□□ 0.117e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 POU6F2-208ENST00000520104 1290 ntTSL 515.71■□□□□ 0.117e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.17e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.097e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.097e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 APOLD1-205ENST00000588943 461 ntTSL 415.61■□□□□ 0.097e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SMUG1-225ENST00000635546 1115 ntTSL 515.6■□□□□ 0.097e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MTG2-206ENST00000467101 2814 ntTSL 1 (best)15.6■□□□□ 0.097e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.097e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.087e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.087e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-209ENST00000587525 3765 ntTSL 1 (best)15.53■□□□□ 0.087e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.077e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 C15orf38-AP3S2-204ENST00000560224 659 ntTSL 215.45■□□□□ 0.067e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-249ENST00000637777 728 ntTSL 515.44■□□□□ 0.067e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.067e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SMAD7-202ENST00000545051 2211 ntTSL 215.35■□□□□ 0.057e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.057e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FBRSL1-203ENST00000537804 261 ntTSL 515.33■□□□□ 0.047e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.047e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 OXNAD1-205ENST00000486267 675 ntTSL 215.27■□□□□ 0.047e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.038e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.027e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.027e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 LEF1-208ENST00000505293 552 ntTSL 415.11■□□□□ 0.017e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -07e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FHOD1-210ENST00000569888 780 ntTSL 214.96□□□□□ -0.016e-16■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 IFT140-205ENST00000561954 826 ntTSL 314.93□□□□□ -0.027e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.037e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 P3H1-211ENST00000472802 646 ntTSL 214.87□□□□□ -0.038e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 METTL22-217ENST00000569597 404 ntTSL 214.83□□□□□ -0.047e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 NECAB3-205ENST00000473892 438 ntTSL 214.81□□□□□ -0.047e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.047e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PTPN7-215ENST00000492451 560 ntTSL 514.72□□□□□ -0.057e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.057e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SMAD7-203ENST00000585986 563 ntTSL 414.69□□□□□ -0.067e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.077e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 DUS2-206ENST00000564975 833 ntTSL 214.58□□□□□ -0.087e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GSTCD-210ENST00000515255 1373 ntTSL 214.57□□□□□ -0.087e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ANKRD13D-213ENST00000512231 2768 ntTSL 214.55□□□□□ -0.087e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.097e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CLPTM1-208ENST00000588274 805 ntTSL 214.51□□□□□ -0.097e-11■■■■■ 260.8
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