Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 LINC02320-201ENST00000557778 454 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.457e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 ARHGEF1-217ENST00000598812 588 ntTSL 522.02■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 AC091959.3-201ENST00000506502 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.173e-11■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.53e-11■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 HBG2-203ENST00000380259 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.487e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 HBG2-202ENST00000380252 694 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.557e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.817e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 AC087380.1-201ENST00000420465 1001 ntTSL 37.88□□□□□ -1.157e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 HBE1-203ENST00000396895 578 ntTSL 55.68□□□□□ -1.57e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 RIC8A-207ENST00000527468 571 ntTSL 222.01■■□□□ 1.117e-11■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.927e-11■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.183e-7■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 CHST11-204ENST00000549016 573 ntTSL 412.13□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 31.6
GTF2F1P35269 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.22■□□□□ 0.513e-53■■■■■ 31.5
GTF2F1P35269 ZEB2-221ENST00000479735 543 ntTSL 421.95■■□□□ 1.11e-7■■■■■ 31.5
GTF2F1P35269 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 31.5
GTF2F1P35269 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.833e-7■■■■■ 31.5
GTF2F1P35269 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.023e-7■■■■■ 31.5
GTF2F1P35269 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 31.5
GTF2F1P35269 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 31.5
GTF2F1P35269 FOXP1-209ENST00000475937 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.53e-7■■■■■ 31.5
GTF2F1P35269 FOXP1-203ENST00000327590 5685 ntTSL 28.51□□□□□ -1.053e-7■■■■■ 31.5
GTF2F1P35269 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 31.5
GTF2F1P35269 INSR-205ENST00000598216 2961 ntTSL 1 (best)12.58□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 31.5
GTF2F1P35269 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 31.5
GTF2F1P35269 CD81-203ENST00000464784 794 ntTSL 525.1■■□□□ 1.618e-7■■■■■ 31.5
GTF2F1P35269 CD81-213ENST00000527343 720 ntTSL 320.08■□□□□ 0.818e-7■■■■■ 31.5
GTF2F1P35269 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 519.5■□□□□ 0.719e-7■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 CRYBB2P1-201ENST00000354451 1560 ntTSL 1 (best)14.01□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.543e-7■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.523e-7■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.813e-7■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.683e-7■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 YY1AP1-207ENST00000361140 2701 ntTSL 1 (best)18■□□□□ 0.473e-7■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 YY1AP1-217ENST00000443231 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.93■□□□□ 0.463e-7■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 YY1AP1-221ENST00000476093 1037 ntTSL 317.55■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 YY1AP1-220ENST00000476027 927 ntTSL 315.04■□□□□ -03e-7■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.423e-7■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 YY1AP1-204ENST00000354691 2498 ntTSL 211.32□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 YY1AP1-215ENST00000436865 2684 ntTSL 1 (best)10.68□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.753e-7■■■■■ 31.4
GTF2F1P35269 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.142e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.044e-7■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 FGFR3-209ENST00000507588 336 ntTSL 1 (best)20.91■□□□□ 0.943e-14■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.932e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.92e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.712e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 FGFR3-207ENST00000474521 545 ntTSL 219.22■□□□□ 0.673e-14■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.622e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.382e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 STK24-206ENST00000481288 656 ntTSL 317.1■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.232e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 STK24-207ENST00000491878 547 ntTSL 416.1■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 LINC01004-202ENST00000450686 538 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.542e-14■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.432e-14■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 C22orf34-202ENST00000400023 1469 ntTSL 1 (best)17.11■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 ERCC1-210ENST00000589381 738 ntTSL 519.89■□□□□ 0.778e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.588e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 ERCC1-206ENST00000588300 1055 ntTSL 218.04■□□□□ 0.488e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.468e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 ERCC1-214ENST00000592083 938 ntTSL 517.07■□□□□ 0.328e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 ERCC1-209ENST00000589214 674 ntTSL 316.87■□□□□ 0.298e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 ERCC1-213ENST00000592023 738 ntTSL 516.87■□□□□ 0.298e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 ERCC1-217ENST00000592905 882 ntTSL 216.6■□□□□ 0.258e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.178e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.038e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 ERCC1-202ENST00000300853 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.158e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.28e-9■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 31.3
GTF2F1P35269 RER1-201ENST00000306256 695 ntTSL 523.22■■□□□ 1.314e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.574e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 CNN2-209ENST00000568865 1332 ntTSL 520.78■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 CNN2-212ENST00000607102 307 ntTSL 1 (best)16.68■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 CNN2-210ENST00000569352 731 ntTSL 515.78■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 CNN2-204ENST00000562075 623 ntTSL 1 (best)15.03■□□□□ -01e-6■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 CNN2-207ENST00000565096 2109 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 CNN2-208ENST00000566695 828 ntTSL 213.33□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 CNN2-211ENST00000606983 537 ntTSL 311.85□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.013e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.643e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.143e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 HNRNPUL1-219ENST00000601336 754 ntTSL 220.89■□□□□ 0.933e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 HNRNPUL1-208ENST00000595196 3043 ntTSL 1 (best)19.17■□□□□ 0.663e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.583e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.233e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.193e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 HNRNPUL1-214ENST00000599719 1473 ntTSL 1 (best)16.01■□□□□ 0.153e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 HNRNPUL1-218ENST00000601309 672 ntTSL 512.85□□□□□ -0.353e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 HNRNPUL1-211ENST00000597725 573 ntTSL 411.38□□□□□ -0.593e-8■■■■■ 31.2
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 86 ms