Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ITCH-206ENST00000486883 703 ntTSL 24.91□□□□□ -1.627e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.677e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 MBNL3-211ENST00000473364 780 ntTSL 34.47□□□□□ -1.697e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.857e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.927e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.117e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 FARP1-232ENST00000601009 667 ntTSL 58.59□□□□□ -1.033e-8■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.132e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 PSMD5-202ENST00000373903 686 ntTSL 32.87□□□□□ -1.952e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.132e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 ABCA1-201ENST00000374733 923 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.92e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 BRD8-209ENST00000430331 432 ntTSL 512.44□□□□□ -0.423e-8■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 RALY-204ENST00000413297 766 ntTSL 519.43■□□□□ 0.72e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 FN1-213ENST00000456923 3720 ntTSL 26.9□□□□□ -1.313e-8■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 FN1-224ENST00000492816 9171 ntTSL 55.61□□□□□ -1.513e-8■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 PAPD7-206ENST00000515721 603 ntTSL 325.77■■□□□ 1.721e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.441e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.271e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 HMG20B-201ENST00000262949 886 ntTSL 521.51■■□□□ 1.031e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 HMG20B-203ENST00000416526 711 ntTSL 320.79■□□□□ 0.921e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 HMG20B-205ENST00000435022 616 ntTSL 520.71■□□□□ 0.911e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 HMG20B-213ENST00000488973 2434 ntTSL 1 (best)20.46■□□□□ 0.871e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.551e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 HMG20B-208ENST00000464304 881 ntTSL 218.25■□□□□ 0.511e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.491e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 MFGE8-214ENST00000560937 801 ntTSL 217.88■□□□□ 0.451e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.441e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 MFGE8-205ENST00000558018 1989 ntTSL 217.4■□□□□ 0.381e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 TADA2A-213ENST00000620628 2211 ntTSL 517.17■□□□□ 0.341e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 MFGE8-206ENST00000558029 849 ntTSL 316.71■□□□□ 0.271e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.261e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.251e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 TADA2A-204ENST00000614122 1003 ntTSL 516.46■□□□□ 0.231e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 HMG20B-212ENST00000487894 1242 ntTSL 216.32■□□□□ 0.21e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 ACTR3-204ENST00000446821 818 ntTSL 315.92■□□□□ 0.141e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.061e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.031e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 RAB11FIP1-205ENST00000523182 2329 ntTSL 1 (best)15.11■□□□□ 0.011e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.021e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 RPL7L1-209ENST00000497417 2171 ntTSL 214.39□□□□□ -0.112e-7■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.151e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.161e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.221e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 MBD1-220ENST00000589758 385 ntTSL 1 (best)13.48□□□□□ -0.251e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 RPL7L1-207ENST00000492836 482 ntTSL 513.04□□□□□ -0.322e-7■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GABPB1-203ENST00000380877 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.391e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 ACTR3-203ENST00000443297 566 ntTSL 412.16□□□□□ -0.461e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 ACTR3-202ENST00000415792 676 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.581e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 RAB11FIP1-204ENST00000522774 3078 ntTSL 1 (best)11.27□□□□□ -0.61e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GABPB1-206ENST00000543881 1450 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.641e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GABPB1-210ENST00000560825 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.721e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 TADA2A-205ENST00000615182 4253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.751e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 PPP4R1-222ENST00000582594 2982 ntTSL 1 (best)10.14□□□□□ -0.791e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 HMG20B-210ENST00000483417 580 ntTSL 39.42□□□□□ -0.91e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 TADA2A-202ENST00000612272 1948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.921e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 PPP4R1-213ENST00000579609 565 ntTSL 39.05□□□□□ -0.961e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GABPB1-205ENST00000429662 1392 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.971e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 KDM1A-206ENST00000602503 2810 nt8.05□□□□□ -1.121e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 TADA2A-210ENST00000619777 920 ntTSL 57.5□□□□□ -1.211e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 TADA2A-209ENST00000619335 784 ntTSL 46.77□□□□□ -1.331e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GABPB1-211ENST00000561010 867 ntTSL 36.7□□□□□ -1.341e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 PPP4R1-207ENST00000578010 558 ntTSL 36.52□□□□□ -1.371e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 TADA2A-211ENST00000620086 1096 ntTSL 55.82□□□□□ -1.481e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 TADA2A-206ENST00000615328 804 ntTSL 55.25□□□□□ -1.571e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.611e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.621e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 PPP4R1-209ENST00000578329 350 ntTSL 34.13□□□□□ -1.751e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 ACSL3-203ENST00000407441 538 ntTSL 33.75□□□□□ -1.811e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 TXNL1-210ENST00000589931 466 ntTSL 32.98□□□□□ -1.931e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GABPB1-209ENST00000559100 290 ntTSL 32.01□□□□□ -2.091e-5■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 IVNS1ABP-203ENST00000422754 564 ntTSL 28.58□□□□□ -1.041e-7■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.55e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.325e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 C20orf194-202ENST00000619760 2151 ntTSL 215.73■□□□□ 0.116e-7■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 TMEM259-203ENST00000586250 418 ntTSL 312.95□□□□□ -0.342e-20■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 SEC63-203ENST00000446496 583 ntTSL 417.72■□□□□ 0.432e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 SEC63-205ENST00000460009 482 ntTSL 511.53□□□□□ -0.562e-9■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.045e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 PANK2-202ENST00000336066 1843 ntTSL 1 (best)25.14■■□□□ 1.615e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.415e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GART-208ENST00000430874 1036 ntTSL 519.76■□□□□ 0.755e-13■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.525e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 PANK2-205ENST00000495692 967 ntTSL 317.92■□□□□ 0.465e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.285e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 PLEKHJ1-210ENST00000588633 379 ntTSL 516.2■□□□□ 0.185e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 TIMM10B-202ENST00000528908 593 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.115e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.181e-11■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.365e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 NCAPG-205ENST00000514176 3017 ntTSL 1 (best)12.12□□□□□ -0.471e-11■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 TIMM10B-203ENST00000530751 809 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.515e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 TIMM10B-201ENST00000254616 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.525e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.585e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 S100A1-204ENST00000436839 236 ntTSL 311.37□□□□□ -0.595e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 TIMM10B-205ENST00000533379 608 ntTSL 210.78□□□□□ -0.685e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 AC084337.2-201ENST00000639224 589 ntAPPRIS ALT2 TSL 410.68□□□□□ -0.75e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 AC084337.2-202ENST00000640959 595 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.735e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 GART-203ENST00000381815 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.765e-13■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 CNOT6L-208ENST00000515506 4024 ntTSL 510.13□□□□□ -0.795e-6■□□□□ 9
EFTUD2Q15029 TIMM10B-204ENST00000531462 516 ntTSL 38.87□□□□□ -0.995e-6■□□□□ 9
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 3353.9 ms