RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254616.10

TIMM10B-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 10B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMM10B, Length 2,840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM10B-201ENST00000254616 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.48■■□□□ 1.35
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TIMM10B-201ENST00000254616 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
TIMM10B-201ENST00000254616 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.02■□□□□ 0.64
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TIMM10B-201ENST00000254616 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.49■□□□□ 0.55
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TIMM10B-201ENST00000254616 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.1■□□□□ 0.49
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TIMM10B-201ENST00000254616 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
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TIMM10B-201ENST00000254616 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
TIMM10B-201ENST00000254616 SMARCA4P51532 1647 aa17.87■□□□□ 0.45
TIMM10B-201ENST00000254616 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.83■□□□□ 0.44
TIMM10B-201ENST00000254616 SMARCA2P51531 1590 aa17.78■□□□□ 0.44
TIMM10B-201ENST00000254616 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.73■□□□□ 0.43
TIMM10B-201ENST00000254616 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.72■□□□□ 0.43
TIMM10B-201ENST00000254616 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.71■□□□□ 0.43
TIMM10B-201ENST00000254616 EEA1Q15075 1411 aa17.7■□□□□ 0.42
TIMM10B-201ENST00000254616 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.7■□□□□ 0.42
TIMM10B-201ENST00000254616 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
TIMM10B-201ENST00000254616 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.67■□□□□ 0.42
TIMM10B-201ENST00000254616 ABCC8Q09428 1581 aa17.58■□□□□ 0.41
TIMM10B-201ENST00000254616 TNIKQ9UKE5 1360 aa17.57■□□□□ 0.4
TIMM10B-201ENST00000254616 CEP162Q5TB80 1403 aa17.5■□□□□ 0.39
TIMM10B-201ENST00000254616 KIF21BO75037 1637 aa17.45■□□□□ 0.38
TIMM10B-201ENST00000254616 GOLGA3Q08378 1498 aa17.44■□□□□ 0.38
TIMM10B-201ENST00000254616 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.43■□□□□ 0.38
TIMM10B-201ENST00000254616 SOGA1O94964 1423 aa17.43■□□□□ 0.38
TIMM10B-201ENST00000254616 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.38■□□□□ 0.37
TIMM10B-201ENST00000254616 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.36■□□□□ 0.37
TIMM10B-201ENST00000254616 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
TIMM10B-201ENST00000254616 SYNJ1O43426 1573 aa17.32■□□□□ 0.36
TIMM10B-201ENST00000254616 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.32■□□□□ 0.36
TIMM10B-201ENST00000254616 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.31■□□□□ 0.36
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TIMM10B-201ENST00000254616 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
TIMM10B-201ENST00000254616 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
TIMM10B-201ENST00000254616 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.23■□□□□ 0.35
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TIMM10B-201ENST00000254616 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.17■□□□□ 0.34
TIMM10B-201ENST00000254616 VPS8Q8N3P4 1428 aa17.17■□□□□ 0.34
TIMM10B-201ENST00000254616 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.16■□□□□ 0.34
TIMM10B-201ENST00000254616 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
TIMM10B-201ENST00000254616 HMGXB3Q12766 1538 aa17.14■□□□□ 0.33
TIMM10B-201ENST00000254616 CLIP1P30622 1438 aa17.14■□□□□ 0.33
TIMM10B-201ENST00000254616 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
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TIMM10B-201ENST00000254616 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
TIMM10B-201ENST00000254616 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.06■□□□□ 0.32
TIMM10B-201ENST00000254616 NCAPD3P42695 1498 aa17.05■□□□□ 0.32
TIMM10B-201ENST00000254616 PRXQ9BXM0 1461 aa17.04■□□□□ 0.32
TIMM10B-201ENST00000254616 PRDM2Q13029 1718 aa16.99■□□□□ 0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.98■□□□□ 0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 CUX1P39880 1505 aa16.92■□□□□ 0.3
TIMM10B-201ENST00000254616 CFTRP13569 1480 aa16.92■□□□□ 0.3
TIMM10B-201ENST00000254616 ARAP1Q96P48 1450 aa16.92■□□□□ 0.3
TIMM10B-201ENST00000254616 NEUROD1Q13562 356 aa16.91■□□□□ 0.3
TIMM10B-201ENST00000254616 CUX2O14529 1486 aa16.88■□□□□ 0.29
TIMM10B-201ENST00000254616 APLP2Q06481 763 aa16.88■□□□□ 0.29
TIMM10B-201ENST00000254616 KIF27Q86VH2 1401 aa16.87■□□□□ 0.29
TIMM10B-201ENST00000254616 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
TIMM10B-201ENST00000254616 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
TIMM10B-201ENST00000254616 MAP3K1Q13233 1512 aa16.83■□□□□ 0.29
TIMM10B-201ENST00000254616 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
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TIMM10B-201ENST00000254616 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.74■□□□□ 0.27
TIMM10B-201ENST00000254616 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.74■□□□□ 0.27
TIMM10B-201ENST00000254616 TIAM1Q13009 1591 aa16.66■□□□□ 0.26
TIMM10B-201ENST00000254616 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.64■□□□□ 0.25
TIMM10B-201ENST00000254616 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.63■□□□□ 0.25
TIMM10B-201ENST00000254616 IGF1RP08069 1367 aa16.62■□□□□ 0.25
TIMM10B-201ENST00000254616 MIER1Q8N108 512 aa16.62■□□□□ 0.25
TIMM10B-201ENST00000254616 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.62■□□□□ 0.25
TIMM10B-201ENST00000254616 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TIMM10B-201ENST00000254616 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.56■□□□□ 0.24
TIMM10B-201ENST00000254616 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.56■□□□□ 0.24
TIMM10B-201ENST00000254616 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.55■□□□□ 0.24
TIMM10B-201ENST00000254616 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.55■□□□□ 0.24
TIMM10B-201ENST00000254616 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.53■□□□□ 0.24
TIMM10B-201ENST00000254616 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.241e-7■□□□□ 8.1
TIMM10B-201ENST00000254616 MYT1Q01538 1121 aa16.52■□□□□ 0.24
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