RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619760.1

C20orf194-202, Transcript of chromosome 20 open reading frame 194, humanhuman

TSL 2

Gene C20orf194, Length 2,151 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf194-202ENST00000619760 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.29■■■□□ 2.6
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C20orf194-202ENST00000619760 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.57■■□□□ 1.84
C20orf194-202ENST00000619760 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
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C20orf194-202ENST00000619760 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.32■■□□□ 1.64
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C20orf194-202ENST00000619760 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.61■■□□□ 1.53
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C20orf194-202ENST00000619760 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.49■■□□□ 1.51
C20orf194-202ENST00000619760 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.41■■□□□ 1.5
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C20orf194-202ENST00000619760 WIZO95785 1651 aa24.2■■□□□ 1.47
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C20orf194-202ENST00000619760 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
C20orf194-202ENST00000619760 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
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C20orf194-202ENST00000619760 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.91■■□□□ 1.42
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C20orf194-202ENST00000619760 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.71■■□□□ 1.39
C20orf194-202ENST00000619760 SMARCA2P51531 1590 aa23.7■■□□□ 1.38
C20orf194-202ENST00000619760 ABCC8Q09428 1581 aa23.64■■□□□ 1.37
C20orf194-202ENST00000619760 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.6■■□□□ 1.37
C20orf194-202ENST00000619760 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
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C20orf194-202ENST00000619760 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.41■■□□□ 1.34
C20orf194-202ENST00000619760 SOGA1O94964 1423 aa23.41■■□□□ 1.34
C20orf194-202ENST00000619760 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.32■■□□□ 1.32
C20orf194-202ENST00000619760 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
C20orf194-202ENST00000619760 CEP162Q5TB80 1403 aa23.27■■□□□ 1.32
C20orf194-202ENST00000619760 EEA1Q15075 1411 aa23.26■■□□□ 1.31
C20orf194-202ENST00000619760 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.25■■□□□ 1.31
C20orf194-202ENST00000619760 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.24■■□□□ 1.31
C20orf194-202ENST00000619760 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.22■■□□□ 1.31
C20orf194-202ENST00000619760 SYNJ1O43426 1573 aa23.15■■□□□ 1.3
C20orf194-202ENST00000619760 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
C20orf194-202ENST00000619760 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
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C20orf194-202ENST00000619760 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.98■■□□□ 1.27
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C20orf194-202ENST00000619760 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.8■■□□□ 1.24
C20orf194-202ENST00000619760 NCAPD3P42695 1498 aa22.77■■□□□ 1.24
C20orf194-202ENST00000619760 HMGXB3Q12766 1538 aa22.77■■□□□ 1.24
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C20orf194-202ENST00000619760 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
C20orf194-202ENST00000619760 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.22■■□□□ 1.15
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C20orf194-202ENST00000619760 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.2■■□□□ 1.14
C20orf194-202ENST00000619760 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
C20orf194-202ENST00000619760 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.16■■□□□ 1.14
C20orf194-202ENST00000619760 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.16■■□□□ 1.14
C20orf194-202ENST00000619760 MIER1Q8N108 512 aa22.13■■□□□ 1.13
C20orf194-202ENST00000619760 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.11■■□□□ 1.13
C20orf194-202ENST00000619760 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.11■■□□□ 1.13
C20orf194-202ENST00000619760 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.09■■□□□ 1.13
C20orf194-202ENST00000619760 TIAM1Q13009 1591 aa22.07■■□□□ 1.12
C20orf194-202ENST00000619760 MAP3K1Q13233 1512 aa22.06■■□□□ 1.12
C20orf194-202ENST00000619760 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.01■■□□□ 1.11
C20orf194-202ENST00000619760 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.01■■□□□ 1.11
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C20orf194-202ENST00000619760 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.98■■□□□ 1.11
C20orf194-202ENST00000619760 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.98■■□□□ 1.11
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