RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533379.1

TIMM10B-205, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 10B, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM10B, Length 608 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM10B-205ENST00000533379 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.81■■■□□ 2.2
TIMM10B-205ENST00000533379 ABCC9O60706 1549 aa26.44■■□□□ 1.82
TIMM10B-205ENST00000533379 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.96■■□□□ 1.75
TIMM10B-205ENST00000533379 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.2■■□□□ 1.62
TIMM10B-205ENST00000533379 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.88■■□□□ 1.57
TIMM10B-205ENST00000533379 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.53
TIMM10B-205ENST00000533379 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.61■■□□□ 1.53
TIMM10B-205ENST00000533379 NACADO15069 1562 aa24.61■■□□□ 1.53
TIMM10B-205ENST00000533379 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.49■■□□□ 1.51
TIMM10B-205ENST00000533379 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.28■■□□□ 1.48
TIMM10B-205ENST00000533379 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.07■■□□□ 1.44
TIMM10B-205ENST00000533379 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.84■■□□□ 1.41
TIMM10B-205ENST00000533379 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.8■■□□□ 1.4
TIMM10B-205ENST00000533379 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
TIMM10B-205ENST00000533379 SCRIBQ14160 1630 aa23.77■■□□□ 1.4
TIMM10B-205ENST00000533379 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.67■■□□□ 1.38
TIMM10B-205ENST00000533379 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.67■■□□□ 1.38
TIMM10B-205ENST00000533379 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
TIMM10B-205ENST00000533379 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.26■■□□□ 1.31
TIMM10B-205ENST00000533379 CUX2O14529 1486 aa22.79■■□□□ 1.24
TIMM10B-205ENST00000533379 ERCC6Q03468 1493 aa22.79■■□□□ 1.24
TIMM10B-205ENST00000533379 NCAPD3P42695 1498 aa22.73■■□□□ 1.23
TIMM10B-205ENST00000533379 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.67■■□□□ 1.22
TIMM10B-205ENST00000533379 NESP48681 1621 aa22.65■■□□□ 1.22
TIMM10B-205ENST00000533379 SMARCA4P51532 1647 aa22.57■■□□□ 1.2
TIMM10B-205ENST00000533379 SMARCA2P51531 1590 aa22.52■■□□□ 1.2
TIMM10B-205ENST00000533379 HMGXB3Q12766 1538 aa22.52■■□□□ 1.19
TIMM10B-205ENST00000533379 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TIMM10B-205ENST00000533379 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TIMM10B-205ENST00000533379 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TIMM10B-205ENST00000533379 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.33■■□□□ 1.17
TIMM10B-205ENST00000533379 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.28■■□□□ 1.16
TIMM10B-205ENST00000533379 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.27■■□□□ 1.16
TIMM10B-205ENST00000533379 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.27■■□□□ 1.16
TIMM10B-205ENST00000533379 TRIM41Q8WV44 630 aa22.2■■□□□ 1.14
TIMM10B-205ENST00000533379 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.15■■□□□ 1.14
TIMM10B-205ENST00000533379 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM10B-205ENST00000533379 WIZO95785 1651 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM10B-205ENST00000533379 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM10B-205ENST00000533379 WDR62O43379 1518 aa21.97■■□□□ 1.11
TIMM10B-205ENST00000533379 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.86■■□□□ 1.09
TIMM10B-205ENST00000533379 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.83■■□□□ 1.09
TIMM10B-205ENST00000533379 OSCARQ8IYS5 282 aa21.74■■□□□ 1.07
TIMM10B-205ENST00000533379 CFTRP13569 1480 aa21.72■■□□□ 1.07
TIMM10B-205ENST00000533379 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TIMM10B-205ENST00000533379 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TIMM10B-205ENST00000533379 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TIMM10B-205ENST00000533379 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.58■■□□□ 1.04
TIMM10B-205ENST00000533379 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.58■■□□□ 1.04
TIMM10B-205ENST00000533379 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.58■■□□□ 1.04
TIMM10B-205ENST00000533379 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TIMM10B-205ENST00000533379 PRDM2Q13029 1718 aa21.52■■□□□ 1.04
TIMM10B-205ENST00000533379 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.43■■□□□ 1.02
TIMM10B-205ENST00000533379 ARHGEF11O15085 1522 aa21.43■■□□□ 1.02
TIMM10B-205ENST00000533379 IFT140Q96RY7 1462 aa21.41■■□□□ 1.02
TIMM10B-205ENST00000533379 TOPBP1Q92547 1522 aa21.39■■□□□ 1.02
TIMM10B-205ENST00000533379 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
TIMM10B-205ENST00000533379 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.35■■□□□ 1.01
TIMM10B-205ENST00000533379 CHD1O14646 1710 aa21.32■■□□□ 1
TIMM10B-205ENST00000533379 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 11e-7■□□□□ 8.1
TIMM10B-205ENST00000533379 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.25■□□□□ 0.99
TIMM10B-205ENST00000533379 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
TIMM10B-205ENST00000533379 FBLN2P98095 1184 aa21.23■□□□□ 0.99
TIMM10B-205ENST00000533379 ARAP1Q96P48 1450 aa21.22■□□□□ 0.99
TIMM10B-205ENST00000533379 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
TIMM10B-205ENST00000533379 ABCC8Q09428 1581 aa21.19■□□□□ 0.98
TIMM10B-205ENST00000533379 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.15■□□□□ 0.98
TIMM10B-205ENST00000533379 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
TIMM10B-205ENST00000533379 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
TIMM10B-205ENST00000533379 SOGA1O94964 1423 aa21.04■□□□□ 0.96
TIMM10B-205ENST00000533379 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.03■□□□□ 0.96
TIMM10B-205ENST00000533379 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.99■□□□□ 0.95
TIMM10B-205ENST00000533379 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.98■□□□□ 0.95
TIMM10B-205ENST00000533379 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
TIMM10B-205ENST00000533379 CUX1P39880 1505 aa20.94■□□□□ 0.94
TIMM10B-205ENST00000533379 SYNJ1O43426 1573 aa20.9■□□□□ 0.94
TIMM10B-205ENST00000533379 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TIMM10B-205ENST00000533379 GRIN2BQ13224 1484 aa20.86■□□□□ 0.93
TIMM10B-205ENST00000533379 WDR97A6NE52 1622 aa20.85■□□□□ 0.93
TIMM10B-205ENST00000533379 PBRM1Q86U86 1689 aa20.84■□□□□ 0.93
TIMM10B-205ENST00000533379 SYNJ2O15056 1496 aa20.83■□□□□ 0.93
TIMM10B-205ENST00000533379 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
TIMM10B-205ENST00000533379 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.78■□□□□ 0.92
TIMM10B-205ENST00000533379 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.76■□□□□ 0.91
TIMM10B-205ENST00000533379 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.71■□□□□ 0.91
TIMM10B-205ENST00000533379 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.67■□□□□ 0.9
TIMM10B-205ENST00000533379 GRIN2AQ12879 1464 aa20.62■□□□□ 0.89
TIMM10B-205ENST00000533379 CEP170Q5SW79 1584 aa20.61■□□□□ 0.89
TIMM10B-205ENST00000533379 ADAMTS12P58397 1594 aa20.58■□□□□ 0.88
TIMM10B-205ENST00000533379 NUP160Q12769 1436 aa20.54■□□□□ 0.88
TIMM10B-205ENST00000533379 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.53■□□□□ 0.88
TIMM10B-205ENST00000533379 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
TIMM10B-205ENST00000533379 SHROOM2Q13796 1616 aa20.51■□□□□ 0.87
TIMM10B-205ENST00000533379 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
TIMM10B-205ENST00000533379 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.46■□□□□ 0.87
TIMM10B-205ENST00000533379 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.46■□□□□ 0.87
TIMM10B-205ENST00000533379 TOP2BQ02880 1626 aa20.45■□□□□ 0.86
TIMM10B-205ENST00000533379 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
TIMM10B-205ENST00000533379 JPH4Q96JJ6 628 aa20.38■□□□□ 0.85
TIMM10B-205ENST00000533379 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms