RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560937.1

MFGE8-214, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 801 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-214ENST00000560937 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.02■■■■■ 4.48
MFGE8-214ENST00000560937 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.12■■■■□ 3.69
MFGE8-214ENST00000560937 ABCC9O60706 1549 aa36.75■■■■□ 3.47
MFGE8-214ENST00000560937 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
MFGE8-214ENST00000560937 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.78■■■■□ 3.32
MFGE8-214ENST00000560937 NACADO15069 1562 aa35.64■■■■□ 3.3
MFGE8-214ENST00000560937 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.59■■■■□ 3.29
MFGE8-214ENST00000560937 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.58■■■■□ 3.29
MFGE8-214ENST00000560937 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.51■■■■□ 3.27
MFGE8-214ENST00000560937 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.92■■■■□ 3.18
MFGE8-214ENST00000560937 SCRIBQ14160 1630 aa34.86■■■■□ 3.17
MFGE8-214ENST00000560937 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.45■■■■□ 3.11
MFGE8-214ENST00000560937 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.4■■■■□ 3.1
MFGE8-214ENST00000560937 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.37■■■■□ 3.09
MFGE8-214ENST00000560937 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
MFGE8-214ENST00000560937 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.45■■■□□ 2.95
MFGE8-214ENST00000560937 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.35■■■□□ 2.93
MFGE8-214ENST00000560937 SMARCA4P51532 1647 aa33.35■■■□□ 2.93
MFGE8-214ENST00000560937 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.29■■■□□ 2.92
MFGE8-214ENST00000560937 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.19■■■□□ 2.9
MFGE8-214ENST00000560937 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.11■■■□□ 2.89
MFGE8-214ENST00000560937 SMARCA2P51531 1590 aa32.98■■■□□ 2.87
MFGE8-214ENST00000560937 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.95■■■□□ 2.87
MFGE8-214ENST00000560937 WIZO95785 1651 aa32.94■■■□□ 2.86
MFGE8-214ENST00000560937 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.94■■■□□ 2.86
MFGE8-214ENST00000560937 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.93■■■□□ 2.86
MFGE8-214ENST00000560937 NCAPD3P42695 1498 aa32.8■■■□□ 2.84
MFGE8-214ENST00000560937 HMGXB3Q12766 1538 aa32.77■■■□□ 2.84
MFGE8-214ENST00000560937 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
MFGE8-214ENST00000560937 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
MFGE8-214ENST00000560937 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
MFGE8-214ENST00000560937 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.14■■■□□ 2.74
MFGE8-214ENST00000560937 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.95■■■□□ 2.71
MFGE8-214ENST00000560937 NESP48681 1621 aa31.95■■■□□ 2.71
MFGE8-214ENST00000560937 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.89■■■□□ 2.7
MFGE8-214ENST00000560937 PRDM2Q13029 1718 aa31.87■■■□□ 2.69
MFGE8-214ENST00000560937 CFTRP13569 1480 aa31.82■■■□□ 2.68
MFGE8-214ENST00000560937 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.7■■■□□ 2.67
MFGE8-214ENST00000560937 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.67■■■□□ 2.66
MFGE8-214ENST00000560937 ERCC6Q03468 1493 aa31.65■■■□□ 2.66
MFGE8-214ENST00000560937 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.59■■■□□ 2.65
MFGE8-214ENST00000560937 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.53■■■□□ 2.64
MFGE8-214ENST00000560937 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
MFGE8-214ENST00000560937 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.35■■■□□ 2.61
MFGE8-214ENST00000560937 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
MFGE8-214ENST00000560937 WDR62O43379 1518 aa31.23■■■□□ 2.59
MFGE8-214ENST00000560937 ABCC8Q09428 1581 aa31.22■■■□□ 2.59
MFGE8-214ENST00000560937 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.19■■■□□ 2.58
MFGE8-214ENST00000560937 TOPBP1Q92547 1522 aa31.15■■■□□ 2.58
MFGE8-214ENST00000560937 CUX1P39880 1505 aa31.13■■■□□ 2.57
MFGE8-214ENST00000560937 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.1■■■□□ 2.57
MFGE8-214ENST00000560937 CUX2O14529 1486 aa31.06■■■□□ 2.56
MFGE8-214ENST00000560937 SYNJ1O43426 1573 aa31.05■■■□□ 2.56
MFGE8-214ENST00000560937 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.04■■■□□ 2.56
MFGE8-214ENST00000560937 TOP2BQ02880 1626 aa31.02■■■□□ 2.56
MFGE8-214ENST00000560937 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.94■■■□□ 2.54
MFGE8-214ENST00000560937 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
MFGE8-214ENST00000560937 IFT140Q96RY7 1462 aa30.8■■■□□ 2.52
MFGE8-214ENST00000560937 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.78■■■□□ 2.52
MFGE8-214ENST00000560937 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
MFGE8-214ENST00000560937 SOGA1O94964 1423 aa30.77■■■□□ 2.52
MFGE8-214ENST00000560937 WDR97A6NE52 1622 aa30.73■■■□□ 2.51
MFGE8-214ENST00000560937 TRIM41Q8WV44 630 aa30.73■■■□□ 2.51
MFGE8-214ENST00000560937 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.66■■■□□ 2.5
MFGE8-214ENST00000560937 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.63■■■□□ 2.49
MFGE8-214ENST00000560937 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
MFGE8-214ENST00000560937 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
MFGE8-214ENST00000560937 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
MFGE8-214ENST00000560937 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.52■■■□□ 2.48
MFGE8-214ENST00000560937 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.51■■■□□ 2.481e-6■■■□□ 18.4
MFGE8-214ENST00000560937 PBRM1Q86U86 1689 aa30.51■■■□□ 2.47
MFGE8-214ENST00000560937 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.45■■■□□ 2.47
MFGE8-214ENST00000560937 KIF27Q86VH2 1401 aa30.39■■■□□ 2.46
MFGE8-214ENST00000560937 GRIN2BQ13224 1484 aa30.37■■■□□ 2.45
MFGE8-214ENST00000560937 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.3■■■□□ 2.44
MFGE8-214ENST00000560937 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.29■■■□□ 2.44
MFGE8-214ENST00000560937 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.29■■■□□ 2.44
MFGE8-214ENST00000560937 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
MFGE8-214ENST00000560937 ADAMTS12P58397 1594 aa30.21■■■□□ 2.43
MFGE8-214ENST00000560937 CUL7Q14999 1698 aa30.2■■■□□ 2.43
MFGE8-214ENST00000560937 CHD1O14646 1710 aa30.2■■■□□ 2.43
MFGE8-214ENST00000560937 EEA1Q15075 1411 aa30.17■■■□□ 2.42
MFGE8-214ENST00000560937 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
MFGE8-214ENST00000560937 IGF1RP08069 1367 aa30.14■■■□□ 2.41
MFGE8-214ENST00000560937 SYNJ2O15056 1496 aa30.11■■■□□ 2.41
MFGE8-214ENST00000560937 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.09■■■□□ 2.41
MFGE8-214ENST00000560937 FBLN2P98095 1184 aa30.08■■■□□ 2.41
MFGE8-214ENST00000560937 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
MFGE8-214ENST00000560937 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.03■■■□□ 2.4
MFGE8-214ENST00000560937 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.01■■■□□ 2.39
MFGE8-214ENST00000560937 GRIN2AQ12879 1464 aa29.99■■■□□ 2.39
MFGE8-214ENST00000560937 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.94■■■□□ 2.38
MFGE8-214ENST00000560937 PRXQ9BXM0 1461 aa29.91■■■□□ 2.38
MFGE8-214ENST00000560937 KIF21BO75037 1637 aa29.89■■■□□ 2.38
MFGE8-214ENST00000560937 CEP170Q5SW79 1584 aa29.86■■■□□ 2.37
MFGE8-214ENST00000560937 OSCARQ8IYS5 282 aa29.83■■■□□ 2.37
MFGE8-214ENST00000560937 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.79■■■□□ 2.36
MFGE8-214ENST00000560937 NUP160Q12769 1436 aa29.79■■■□□ 2.36
MFGE8-214ENST00000560937 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.77■■■□□ 2.36
MFGE8-214ENST00000560937 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms