RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528908.1

TIMM10B-202, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 10B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMM10B, Length 593 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM10B-202ENST00000528908 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.26■■■■□ 3.4
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TIMM10B-202ENST00000528908 ABCC9O60706 1549 aa31.54■■■□□ 2.64
TIMM10B-202ENST00000528908 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.36■■■□□ 2.45
TIMM10B-202ENST00000528908 NACADO15069 1562 aa30.32■■■□□ 2.45
TIMM10B-202ENST00000528908 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.27■■■□□ 2.44
TIMM10B-202ENST00000528908 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
TIMM10B-202ENST00000528908 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.17■■■□□ 2.42
TIMM10B-202ENST00000528908 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.03■■■□□ 2.4
TIMM10B-202ENST00000528908 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.56■■■□□ 2.32
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TIMM10B-202ENST00000528908 SCRIBQ14160 1630 aa29.4■■■□□ 2.3
TIMM10B-202ENST00000528908 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.39■■■□□ 2.3
TIMM10B-202ENST00000528908 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.19■■■□□ 2.26
TIMM10B-202ENST00000528908 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.9■■■□□ 2.22
TIMM10B-202ENST00000528908 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
TIMM10B-202ENST00000528908 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.51■■■□□ 2.15
TIMM10B-202ENST00000528908 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.36■■■□□ 2.13
TIMM10B-202ENST00000528908 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
TIMM10B-202ENST00000528908 SMARCA4P51532 1647 aa28.13■■■□□ 2.09
TIMM10B-202ENST00000528908 NCAPD3P42695 1498 aa27.99■■■□□ 2.07
TIMM10B-202ENST00000528908 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.99■■■□□ 2.07
TIMM10B-202ENST00000528908 SMARCA2P51531 1590 aa27.98■■■□□ 2.07
TIMM10B-202ENST00000528908 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.93■■■□□ 2.06
TIMM10B-202ENST00000528908 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.87■■■□□ 2.05
TIMM10B-202ENST00000528908 HMGXB3Q12766 1538 aa27.86■■■□□ 2.05
TIMM10B-202ENST00000528908 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
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TIMM10B-202ENST00000528908 WIZO95785 1651 aa27.59■■■□□ 2.01
TIMM10B-202ENST00000528908 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
TIMM10B-202ENST00000528908 NESP48681 1621 aa27.27■■□□□ 1.96
TIMM10B-202ENST00000528908 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.25■■□□□ 1.95
TIMM10B-202ENST00000528908 ERCC6Q03468 1493 aa27.22■■□□□ 1.95
TIMM10B-202ENST00000528908 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.17■■□□□ 1.94
TIMM10B-202ENST00000528908 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.08■■□□□ 1.93
TIMM10B-202ENST00000528908 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.01■■□□□ 1.91
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TIMM10B-202ENST00000528908 CUX2O14529 1486 aa26.95■■□□□ 1.91
TIMM10B-202ENST00000528908 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.92■■□□□ 1.9
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TIMM10B-202ENST00000528908 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.86■■□□□ 1.89
TIMM10B-202ENST00000528908 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.84■■□□□ 1.89
TIMM10B-202ENST00000528908 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.81■■□□□ 1.88
TIMM10B-202ENST00000528908 PRDM2Q13029 1718 aa26.73■■□□□ 1.87
TIMM10B-202ENST00000528908 WDR62O43379 1518 aa26.7■■□□□ 1.87
TIMM10B-202ENST00000528908 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
TIMM10B-202ENST00000528908 ABCC8Q09428 1581 aa26.45■■□□□ 1.82
TIMM10B-202ENST00000528908 TOPBP1Q92547 1522 aa26.42■■□□□ 1.82
TIMM10B-202ENST00000528908 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.39■■□□□ 1.82
TIMM10B-202ENST00000528908 IFT140Q96RY7 1462 aa26.28■■□□□ 1.8
TIMM10B-202ENST00000528908 CUX1P39880 1505 aa26.2■■□□□ 1.79
TIMM10B-202ENST00000528908 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
TIMM10B-202ENST00000528908 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.13■■□□□ 1.77
TIMM10B-202ENST00000528908 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
TIMM10B-202ENST00000528908 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
TIMM10B-202ENST00000528908 SOGA1O94964 1423 aa26.09■■□□□ 1.77
TIMM10B-202ENST00000528908 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.08■■□□□ 1.77
TIMM10B-202ENST00000528908 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.06■■□□□ 1.76
TIMM10B-202ENST00000528908 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.06■■□□□ 1.76
TIMM10B-202ENST00000528908 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
TIMM10B-202ENST00000528908 TOP2BQ02880 1626 aa25.99■■□□□ 1.75
TIMM10B-202ENST00000528908 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.97■■□□□ 1.75
TIMM10B-202ENST00000528908 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.751e-7■□□□□ 8.1
TIMM10B-202ENST00000528908 WDR97A6NE52 1622 aa25.96■■□□□ 1.75
TIMM10B-202ENST00000528908 SYNJ1O43426 1573 aa25.96■■□□□ 1.75
TIMM10B-202ENST00000528908 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TIMM10B-202ENST00000528908 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.89■■□□□ 1.74
TIMM10B-202ENST00000528908 GRIN2BQ13224 1484 aa25.8■■□□□ 1.72
TIMM10B-202ENST00000528908 OSCARQ8IYS5 282 aa25.8■■□□□ 1.72
TIMM10B-202ENST00000528908 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.79■■□□□ 1.72
TIMM10B-202ENST00000528908 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.77■■□□□ 1.72
TIMM10B-202ENST00000528908 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.76■■□□□ 1.71
TIMM10B-202ENST00000528908 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
TIMM10B-202ENST00000528908 PBRM1Q86U86 1689 aa25.69■■□□□ 1.7
TIMM10B-202ENST00000528908 FBLN2P98095 1184 aa25.67■■□□□ 1.7
TIMM10B-202ENST00000528908 CHD1O14646 1710 aa25.65■■□□□ 1.7
TIMM10B-202ENST00000528908 SYNJ2O15056 1496 aa25.64■■□□□ 1.69
TIMM10B-202ENST00000528908 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
TIMM10B-202ENST00000528908 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.58■■□□□ 1.69
TIMM10B-202ENST00000528908 ADAMTS12P58397 1594 aa25.54■■□□□ 1.68
TIMM10B-202ENST00000528908 KIF27Q86VH2 1401 aa25.54■■□□□ 1.68
TIMM10B-202ENST00000528908 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.51■■□□□ 1.67
TIMM10B-202ENST00000528908 GRIN2AQ12879 1464 aa25.47■■□□□ 1.67
TIMM10B-202ENST00000528908 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.43■■□□□ 1.66
TIMM10B-202ENST00000528908 TRIM41Q8WV44 630 aa25.43■■□□□ 1.66
TIMM10B-202ENST00000528908 IGF1RP08069 1367 aa25.4■■□□□ 1.66
TIMM10B-202ENST00000528908 ARHGEF11O15085 1522 aa25.38■■□□□ 1.65
TIMM10B-202ENST00000528908 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.36■■□□□ 1.65
TIMM10B-202ENST00000528908 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.36■■□□□ 1.65
TIMM10B-202ENST00000528908 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.36■■□□□ 1.65
TIMM10B-202ENST00000528908 NUP160Q12769 1436 aa25.36■■□□□ 1.65
TIMM10B-202ENST00000528908 CUL7Q14999 1698 aa25.34■■□□□ 1.65
TIMM10B-202ENST00000528908 CEP170Q5SW79 1584 aa25.31■■□□□ 1.64
TIMM10B-202ENST00000528908 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.26■■□□□ 1.63
TIMM10B-202ENST00000528908 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.22■■□□□ 1.63
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TIMM10B-202ENST00000528908 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.13■■□□□ 1.61
TIMM10B-202ENST00000528908 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.12■■□□□ 1.61
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