Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 ATP6V0A1-215ENST00000587824 554 ntTSL 46.96□□□□□ -1.35e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NUP205-208ENST00000490439 653 ntTSL 36.95□□□□□ -1.35e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 HBS1L-211ENST00000527507 629 ntTSL 46.24□□□□□ -1.415e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NR2C2-205ENST00000413194 551 ntTSL 35.79□□□□□ -1.485e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 BPTF-205ENST00000424123 8295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.5□□□□□ -1.535e-13■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 ARFGEF1-208ENST00000522878 750 ntTSL 34.88□□□□□ -1.635e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 HBS1L-207ENST00000524715 551 ntTSL 43.11□□□□□ -1.915e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 GOLIM4-203ENST00000479415 562 ntTSL 32.74□□□□□ -1.975e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CBX3-204ENST00000456948 1068 ntTSL 521.2■□□□□ 0.984e-17■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.055e-9■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.244e-17■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.314e-17■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.344e-17■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NASP-208ENST00000470768 1036 ntTSL 312.72□□□□□ -0.375e-9■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NASP-207ENST00000464190 604 ntTSL 212.41□□□□□ -0.425e-9■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NASP-211ENST00000525515 565 ntTSL 510.61□□□□□ -0.715e-9■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NASP-213ENST00000527470 532 ntTSL 410.61□□□□□ -0.715e-9■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NASP-217ENST00000529333 778 ntTSL 410.61□□□□□ -0.715e-9■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 RBM26-201ENST00000267229 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.825e-9■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NASP-222ENST00000534101 754 ntTSL 34.12□□□□□ -1.755e-9■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CBX3-208ENST00000497498 922 ntTSL 23.63□□□□□ -1.834e-17■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.166e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.396e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 TGFBR3-206ENST00000470600 574 ntTSL 27.63□□□□□ -1.196e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 TGFBR3-210ENST00000533089 6455 ntTSL 1 (best)6.92□□□□□ -1.36e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 TGFBR3-209ENST00000532540 3913 ntTSL 1 (best)6.85□□□□□ -1.316e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.326e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.396e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 JAG1-204ENST00000612857 586 ntTSL 58.72□□□□□ -1.017e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 JAG1-205ENST00000613518 597 ntTSL 57.66□□□□□ -1.187e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 JAG1-209ENST00000622545 507 ntTSL 56.37□□□□□ -1.397e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 PAXBP1-209ENST00000497873 2277 ntTSL 25.64□□□□□ -1.517e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 PAXBP1-203ENST00000421049 339 ntTSL 33.81□□□□□ -1.87e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 GPI-206ENST00000587384 810 ntTSL 316.61■□□□□ 0.253e-27■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 GPI-207ENST00000587521 557 ntTSL 510.56□□□□□ -0.723e-27■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 PSMD9-210ENST00000544254 1481 ntTSL 211.32□□□□□ -0.69e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CLTC-203ENST00000466513 793 ntTSL 25.35□□□□□ -1.557e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 FKBP11-211ENST00000551807 508 ntTSL 324.29■■□□□ 1.481e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.034e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 GTPBP2-206ENST00000452781 681 ntTSL 518.55■□□□□ 0.564e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.434e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.384e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.344e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.274e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.254e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 EEF1B2-207ENST00000445505 515 ntTSL 516.26■□□□□ 0.193e-15■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 C15orf38-AP3S2-203ENST00000559629 675 ntTSL 315.46■□□□□ 0.074e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.074e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.144e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 YIF1B-210ENST00000589151 431 ntTSL 214.14□□□□□ -0.154e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 ANXA11-204ENST00000437799 610 ntTSL 213.58□□□□□ -0.244e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 C15orf38-AP3S2-204ENST00000560224 659 ntTSL 213.07□□□□□ -0.324e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.354e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 C15orf38-AP3S2-202ENST00000558648 664 ntTSL 512.19□□□□□ -0.464e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 AP3S2-201ENST00000336418 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.634e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 DENND1A-206ENST00000473039 4800 ntTSL 1 (best)11.03□□□□□ -0.644e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CKS1B-206ENST00000474215 739 ntTSL 310.19□□□□□ -0.784e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 AP3S2-202ENST00000423566 1262 ntTSL 210.15□□□□□ -0.784e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 TLN1-202ENST00000378192 1693 ntTSL 210.05□□□□□ -0.84e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 AP3S2-206ENST00000558806 578 ntTSL 1 (best)9.84□□□□□ -0.834e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 DENND1A-210ENST00000479305 791 ntTSL 29.66□□□□□ -0.864e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 DENND1A-212ENST00000497135 1207 ntTSL 59.53□□□□□ -0.884e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 DENND1A-211ENST00000491650 842 ntTSL 58.98□□□□□ -0.974e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 DENND1A-204ENST00000394215 1380 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.134e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 AP3S2-203ENST00000557999 578 ntTSL 47.58□□□□□ -1.24e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 AP3S2-208ENST00000558999 653 ntTSL 57.21□□□□□ -1.264e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CKS1B-205ENST00000473344 390 ntTSL 36.37□□□□□ -1.394e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.44e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CKS1B-204ENST00000471245 1166 ntTSL 1 (best)5.22□□□□□ -1.574e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.694e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 DENND1A-205ENST00000462245 739 ntTSL 24.28□□□□□ -1.724e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CKS1B-207ENST00000477676 602 ntTSL 34.08□□□□□ -1.764e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 AP3S2-212ENST00000560251 573 ntTSL 43.91□□□□□ -1.784e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 AP3S2-210ENST00000559601 543 ntTSL 43.57□□□□□ -1.844e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.44□□□□□ -1.863e-15■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 AP3S2-211ENST00000560184 601 ntTSL 33.41□□□□□ -1.864e-8■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.04□□□□□ -2.083e-15■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 TAPBP-237ENST00000467025 751 ntTSL 311.61□□□□□ -0.552e-11■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.852e-12■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NEMP1-204ENST00000554340 1381 ntTSL 1 (best)18.74■□□□□ 0.591e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 TNNT1-217ENST00000593194 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.95■□□□□ 0.31e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.251e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 SETD4-211ENST00000443703 707 ntTSL 516.39■□□□□ 0.211e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.041e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.041e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.061e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 TNNT1-214ENST00000589745 529 ntTSL 213.76□□□□□ -0.211e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.291e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 SETD4-213ENST00000460704 795 ntTSL 312.79□□□□□ -0.361e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.421e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 DHX38-206ENST00000564622 390 ntTSL 212.39□□□□□ -0.431e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.551e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.561e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 MAPKAPK2-204ENST00000493447 241 ntTSL 311.05□□□□□ -0.641e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NUMA1-218ENST00000540843 1969 ntTSL 210.58□□□□□ -0.721e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NUMA1-212ENST00000536119 1686 ntTSL 210.31□□□□□ -0.761e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 SETD4-212ENST00000446166 754 ntTSL 310.22□□□□□ -0.771e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NUMA1-207ENST00000534987 2211 ntTSL 210.02□□□□□ -0.811e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NEMP1-202ENST00000379391 5370 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.851e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CD55-211ENST00000635614 1145 ntTSL 59.62□□□□□ -0.872e-12■□□□□ 8.6
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