RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443703.1

SETD4-211, Transcript of SET domain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene SETD4, Length 707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4-211ENST00000443703 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.63■■■■■ 4.9
SETD4-211ENST00000443703 ABCC9O60706 1549 aa41.6■■■■■ 4.25
SETD4-211ENST00000443703 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.01■■■■■ 4.16
SETD4-211ENST00000443703 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.65■■■■□ 3.94
SETD4-211ENST00000443703 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.33■■■■□ 3.89
SETD4-211ENST00000443703 NACADO15069 1562 aa39■■■■□ 3.83
SETD4-211ENST00000443703 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.74■■■■□ 3.79
SETD4-211ENST00000443703 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.73■■■■□ 3.79
SETD4-211ENST00000443703 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.39■■■■□ 3.74
SETD4-211ENST00000443703 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.29■■■■□ 3.72
SETD4-211ENST00000443703 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.28■■■■□ 3.72
SETD4-211ENST00000443703 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.72■■■■□ 3.63
SETD4-211ENST00000443703 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
SETD4-211ENST00000443703 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.69■■■■□ 3.62
SETD4-211ENST00000443703 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.55■■■■□ 3.6
SETD4-211ENST00000443703 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.51■■■■□ 3.6
SETD4-211ENST00000443703 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
SETD4-211ENST00000443703 SCRIBQ14160 1630 aa37.33■■■■□ 3.57
SETD4-211ENST00000443703 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.76■■■■□ 3.48
SETD4-211ENST00000443703 NCAPD3P42695 1498 aa36.12■■■■□ 3.37
SETD4-211ENST00000443703 CUX2O14529 1486 aa36.08■■■■□ 3.37
SETD4-211ENST00000443703 ERCC6Q03468 1493 aa35.92■■■■□ 3.34
SETD4-211ENST00000443703 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.89■■■■□ 3.34
SETD4-211ENST00000443703 SMARCA2P51531 1590 aa35.69■■■■□ 3.3
SETD4-211ENST00000443703 HMGXB3Q12766 1538 aa35.69■■■■□ 3.3
SETD4-211ENST00000443703 NESP48681 1621 aa35.61■■■■□ 3.29
SETD4-211ENST00000443703 SMARCA4P51532 1647 aa35.61■■■■□ 3.29
SETD4-211ENST00000443703 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
SETD4-211ENST00000443703 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
SETD4-211ENST00000443703 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.35■■■■□ 3.25
SETD4-211ENST00000443703 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
SETD4-211ENST00000443703 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.25■■■■□ 3.23
SETD4-211ENST00000443703 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.15■■■■□ 3.22
SETD4-211ENST00000443703 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.14■■■■□ 3.22
SETD4-211ENST00000443703 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.99■■■■□ 3.19
SETD4-211ENST00000443703 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.98■■■■□ 3.19
SETD4-211ENST00000443703 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.82■■■■□ 3.16
SETD4-211ENST00000443703 TRIM41Q8WV44 630 aa34.8■■■■□ 3.16
SETD4-211ENST00000443703 WDR62O43379 1518 aa34.74■■■■□ 3.15
SETD4-211ENST00000443703 WIZO95785 1651 aa34.6■■■■□ 3.13
SETD4-211ENST00000443703 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.56■■■■□ 3.12
SETD4-211ENST00000443703 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.52■■■■□ 3.12
SETD4-211ENST00000443703 CFTRP13569 1480 aa34.47■■■■□ 3.11
SETD4-211ENST00000443703 OSCARQ8IYS5 282 aa34.44■■■■□ 3.1
SETD4-211ENST00000443703 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
SETD4-211ENST00000443703 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
SETD4-211ENST00000443703 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
SETD4-211ENST00000443703 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
SETD4-211ENST00000443703 IFT140Q96RY7 1462 aa33.93■■■■□ 3.02
SETD4-211ENST00000443703 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.88■■■■□ 3.01
SETD4-211ENST00000443703 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.87■■■■□ 3.01
SETD4-211ENST00000443703 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.87■■■■□ 3.01
SETD4-211ENST00000443703 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.87■■■■□ 3.01
SETD4-211ENST00000443703 TOPBP1Q92547 1522 aa33.79■■■■□ 3
SETD4-211ENST00000443703 ARHGEF11O15085 1522 aa33.78■■■■□ 3
SETD4-211ENST00000443703 PRDM2Q13029 1718 aa33.76■■■■□ 3
SETD4-211ENST00000443703 ABCC8Q09428 1581 aa33.71■■■□□ 2.99
SETD4-211ENST00000443703 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.64■■■□□ 2.98
SETD4-211ENST00000443703 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
SETD4-211ENST00000443703 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.59■■■□□ 2.974e-7■■■■□ 21.4
SETD4-211ENST00000443703 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.58■■■□□ 2.97
SETD4-211ENST00000443703 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
SETD4-211ENST00000443703 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
SETD4-211ENST00000443703 ARAP1Q96P48 1450 aa33.44■■■□□ 2.94
SETD4-211ENST00000443703 FBLN2P98095 1184 aa33.43■■■□□ 2.94
SETD4-211ENST00000443703 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
SETD4-211ENST00000443703 CHD1O14646 1710 aa33.36■■■□□ 2.93
SETD4-211ENST00000443703 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
SETD4-211ENST00000443703 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.32■■■□□ 2.92
SETD4-211ENST00000443703 SOGA1O94964 1423 aa33.31■■■□□ 2.92
SETD4-211ENST00000443703 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.16■■■□□ 2.9
SETD4-211ENST00000443703 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
SETD4-211ENST00000443703 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.13■■■□□ 2.89
SETD4-211ENST00000443703 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.12■■■□□ 2.89
SETD4-211ENST00000443703 WDR97A6NE52 1622 aa33.1■■■□□ 2.89
SETD4-211ENST00000443703 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
SETD4-211ENST00000443703 GRIN2BQ13224 1484 aa33.05■■■□□ 2.88
SETD4-211ENST00000443703 CUX1P39880 1505 aa33.03■■■□□ 2.88
SETD4-211ENST00000443703 SYNJ1O43426 1573 aa33■■■□□ 2.87
SETD4-211ENST00000443703 SYNJ2O15056 1496 aa32.99■■■□□ 2.87
SETD4-211ENST00000443703 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.86■■■□□ 2.85
SETD4-211ENST00000443703 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.77■■■□□ 2.84
SETD4-211ENST00000443703 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
SETD4-211ENST00000443703 PBRM1Q86U86 1689 aa32.67■■■□□ 2.82
SETD4-211ENST00000443703 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.66■■■□□ 2.82
SETD4-211ENST00000443703 GRIN2AQ12879 1464 aa32.61■■■□□ 2.81
SETD4-211ENST00000443703 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.58■■■□□ 2.81
SETD4-211ENST00000443703 NUP160Q12769 1436 aa32.57■■■□□ 2.8
SETD4-211ENST00000443703 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.55■■■□□ 2.8
SETD4-211ENST00000443703 CEP170Q5SW79 1584 aa32.48■■■□□ 2.79
SETD4-211ENST00000443703 ADAMTS12P58397 1594 aa32.45■■■□□ 2.78
SETD4-211ENST00000443703 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.44■■■□□ 2.78
SETD4-211ENST00000443703 SHROOM2Q13796 1616 aa32.38■■■□□ 2.77
SETD4-211ENST00000443703 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
SETD4-211ENST00000443703 TOP2BQ02880 1626 aa32.33■■■□□ 2.77
SETD4-211ENST00000443703 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.31■■■□□ 2.76
SETD4-211ENST00000443703 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.29■■■□□ 2.76
SETD4-211ENST00000443703 JPH4Q96JJ6 628 aa32.28■■■□□ 2.76
SETD4-211ENST00000443703 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
SETD4-211ENST00000443703 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms