Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 GNB3-209ENST00000542868 616 ntTSL 1 (best)21.36■■□□□ 1.017e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 IQSEC3-202ENST00000537151 539 ntTSL 421.35■■□□□ 1.017e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.997e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.997e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.997e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 LEF1-212ENST00000506680 1280 ntTSL 1 (best)21.12■□□□□ 0.977e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CHID1-220ENST00000532909 619 ntTSL 521.11■□□□□ 0.977e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RYR1-206ENST00000594335 6263 ntTSL 1 (best)21.07■□□□□ 0.967e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 IRF9-215ENST00000561415 1769 ntTSL 221.04■□□□□ 0.967e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 BTRC-206ENST00000475200 527 ntTSL 321.02■□□□□ 0.967e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FGFR4-211ENST00000509511 1341 ntTSL 1 (best)21.01■□□□□ 0.958e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.957e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FPGS-208ENST00000467826 829 ntTSL 521■□□□□ 0.957e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.97e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FPGS-217ENST00000488506 649 ntTSL 520.68■□□□□ 0.97e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.97e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.887e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.887e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RPL27-208ENST00000593262 1872 ntTSL 220.41■□□□□ 0.867e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.867e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 NUDT22-202ENST00000422364 2055 ntTSL 1 (best)20.3■□□□□ 0.847e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CTDSP1-207ENST00000473420 922 ntTSL 320.29■□□□□ 0.847e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ANKRD13D-208ENST00000507915 1165 ntTSL 320.29■□□□□ 0.847e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MFSD1-218ENST00000491804 312 ntTSL 520.28■□□□□ 0.847e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.847e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CDK11A-223ENST00000509982 2306 ntTSL 520.09■□□□□ 0.817e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.87e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 NUDT22-208ENST00000537707 986 ntTSL 1 (best)20.04■□□□□ 0.87e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 VILL-208ENST00000484717 2072 ntTSL 1 (best)19.99■□□□□ 0.797e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MFSD1-216ENST00000486568 566 ntTSL 419.98■□□□□ 0.797e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.787e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-206ENST00000585802 2693 ntTSL 519.9■□□□□ 0.787e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ANKRD13D-210ENST00000508422 477 ntTSL 219.81■□□□□ 0.767e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 INPP5J-210ENST00000420017 558 ntTSL 419.78■□□□□ 0.767e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.757e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FGFR4-208ENST00000503708 770 ntTSL 419.75■□□□□ 0.758e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.757e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 UBE2E1-208ENST00000481622 432 ntTSL 519.74■□□□□ 0.757e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.737e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 NUDT22-203ENST00000428347 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.57■□□□□ 0.727e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 NECAB3-210ENST00000484824 596 ntTSL 219.54■□□□□ 0.727e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.717e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CDK11A-202ENST00000356937 2275 ntTSL 1 (best)19.48■□□□□ 0.717e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.697e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.687e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TTLL11-203ENST00000373778 2195 ntTSL 519.22■□□□□ 0.677e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ANKRD13D-215ENST00000513750 2081 ntTSL 219.21■□□□□ 0.677e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SPCS2-208ENST00000532972 839 ntTSL 219.2■□□□□ 0.668e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TMEM241-212ENST00000578790 664 ntTSL 319.17■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SLC25A12-206ENST00000472748 630 ntTSL 319.16■□□□□ 0.667e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.667e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.667e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ANKRD13D-206ENST00000506119 609 ntTSL 319.09■□□□□ 0.657e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF418-211ENST00000601593 540 ntTSL 419.08■□□□□ 0.647e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TNFAIP2-206ENST00000560428 773 ntTSL 519.05■□□□□ 0.647e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.634e-8■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.637e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PTPN7-209ENST00000477554 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.96■□□□□ 0.637e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TNXB-205ENST00000486148 2669 ntTSL 1 (best)18.92■□□□□ 0.627e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.627e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.627e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.617e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PML-219ENST00000569161 675 ntTSL 318.8■□□□□ 0.67e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.67e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.597e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CTDSP1-215ENST00000498160 877 ntTSL 518.73■□□□□ 0.597e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 NLGN3-203ENST00000395855 1862 ntTSL 1 (best)18.65■□□□□ 0.587e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.579e-8■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.567e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 LZTR1-204ENST00000415817 2323 ntTSL 318.56■□□□□ 0.567e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ANKRD13D-209ENST00000508417 2009 ntTSL 218.5■□□□□ 0.557e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.557e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.44■□□□□ 0.548e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 C15orf38-AP3S2-203ENST00000559629 675 ntTSL 318.41■□□□□ 0.547e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.538e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.537e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TRPV6-206ENST00000489123 673 ntTSL 418.33■□□□□ 0.527e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.527e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.517e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.57e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SPCS2-204ENST00000527225 321 ntTSL 518.16■□□□□ 0.58e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-226ENST00000636473 1653 ntTSL 518.09■□□□□ 0.497e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MGST2-203ENST00000503816 1780 ntTSL 518.04■□□□□ 0.488e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.488e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.477e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ANO10-206ENST00000427171 746 ntTSL 517.96■□□□□ 0.477e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.467e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FGFR4-205ENST00000430285 713 ntTSL 1 (best)17.93■□□□□ 0.468e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.457e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.457e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 INPP5J-211ENST00000461241 2810 ntTSL 217.86■□□□□ 0.457e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RYR1-208ENST00000599547 2200 ntTSL 217.83■□□□□ 0.457e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.447e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.441e-30■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.437e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.428e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.427e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GRIN1-201ENST00000350902 4465 ntTSL 1 (best)17.66■□□□□ 0.427e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 IDH3B-210ENST00000491065 823 ntTSL 217.61■□□□□ 0.417e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ANO10-211ENST00000444344 575 ntTSL 317.57■□□□□ 0.47e-11■■■■■ 260.8
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