RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525151.5

TRAF3IP2-AS1-208, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 609 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.18■■■■■ 4.66
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ABCC9O60706 1549 aa41.04■■■■■ 4.16
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.12■■■■■ 4.01
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.52■■■■□ 3.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.58■■■■□ 3.77
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NACADO15069 1562 aa38.08■■■■□ 3.69
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.03■■■■□ 3.68
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.02■■■■□ 3.68
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.7■■■■□ 3.63
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.53■■■■□ 3.6
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.22■■■■□ 3.55
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.09■■■■□ 3.53
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.04■■■■□ 3.52
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.87■■■■□ 3.49
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.83■■■■□ 3.49
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SCRIBQ14160 1630 aa36.49■■■■□ 3.43
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.4■■■■□ 3.42
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CUX2O14529 1486 aa35.72■■■■□ 3.31
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ERCC6Q03468 1493 aa35.38■■■■□ 3.25
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NCAPD3P42695 1498 aa35.18■■■■□ 3.22
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NESP48681 1621 aa35.06■■■■□ 3.2
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.96■■■■□ 3.19
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 HMGXB3Q12766 1538 aa34.84■■■■□ 3.17
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TRIM41Q8WV44 630 aa34.76■■■■□ 3.16
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SMARCA2P51531 1590 aa34.73■■■■□ 3.15
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SMARCA4P51532 1647 aa34.72■■■■□ 3.15
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.63■■■■□ 3.13
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.55■■■■□ 3.12
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.39■■■■□ 3.1
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.27■■■■□ 3.08
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 WDR62O43379 1518 aa34.14■■■■□ 3.06
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.12■■■■□ 3.05
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.09■■■■□ 3.05
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.02■■■■□ 3.04
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 OSCARQ8IYS5 282 aa33.85■■■■□ 3.01
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.76■■■□□ 2.99
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.73■■■□□ 2.99
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.73■■■□□ 2.99
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.73■■■□□ 2.99
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 WIZO95785 1651 aa33.68■■■□□ 2.98
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.66■■■□□ 2.98
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CFTRP13569 1480 aa33.47■■■□□ 2.95
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ARHGEF11O15085 1522 aa33.45■■■□□ 2.95
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PRDM2Q13029 1718 aa33.2■■■□□ 2.91
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.16■■■□□ 2.9
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 IFT140Q96RY7 1462 aa33.12■■■□□ 2.89
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ARAP1Q96P48 1450 aa33.09■■■□□ 2.89
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CHD1O14646 1710 aa33.08■■■□□ 2.89
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.04■■■□□ 2.88
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TOPBP1Q92547 1522 aa32.96■■■□□ 2.87
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.95■■■□□ 2.87
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.84■■■□□ 2.85
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.81■■■□□ 2.84
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.74■■■□□ 2.83
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.73■■■□□ 2.83
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ABCC8Q09428 1581 aa32.68■■■□□ 2.82
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FBLN2P98095 1184 aa32.63■■■□□ 2.81
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.61■■■□□ 2.81
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.48■■■□□ 2.79
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.43■■■□□ 2.78
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SYNJ1O43426 1573 aa32.37■■■□□ 2.77
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SOGA1O94964 1423 aa32.31■■■□□ 2.76
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 WDR97A6NE52 1622 aa32.28■■■□□ 2.76
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.23■■■□□ 2.75
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.2■■■□□ 2.75
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SYNJ2O15056 1496 aa32.17■■■□□ 2.74
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GRIN2BQ13224 1484 aa32.14■■■□□ 2.74
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PBRM1Q86U86 1689 aa32.12■■■□□ 2.73
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.11■■■□□ 2.73
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CUX1P39880 1505 aa32.07■■■□□ 2.72
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.03■■■□□ 2.72
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.89■■■□□ 2.7
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CEP170Q5SW79 1584 aa31.86■■■□□ 2.69
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SHROOM2Q13796 1616 aa31.8■■■□□ 2.68
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GRIN2AQ12879 1464 aa31.78■■■□□ 2.68
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.76■■■□□ 2.68
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NUP160Q12769 1436 aa31.73■■■□□ 2.67
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ADAMTS12P58397 1594 aa31.69■■■□□ 2.66
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.6■■■□□ 2.65
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.52■■■□□ 2.64
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DIP2BQ9P265 1576 aa31.49■■■□□ 2.63
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.46■■■□□ 2.63
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.44■■■□□ 2.62
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MAPKBP1O60336 1514 aa31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.7 ms