RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508422.1

ANKRD13D-210, Transcript of ankyrin repeat domain 13D, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD13D, Length 477 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13D-210ENST00000508422 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.52■■■■■ 4.56
ANKRD13D-210ENST00000508422 ABCC9O60706 1549 aa39.75■■■■□ 3.95
ANKRD13D-210ENST00000508422 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.19■■■■□ 3.86
ANKRD13D-210ENST00000508422 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.77■■■■□ 3.64
ANKRD13D-210ENST00000508422 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.57■■■■□ 3.6
ANKRD13D-210ENST00000508422 NACADO15069 1562 aa37.12■■■■□ 3.53
ANKRD13D-210ENST00000508422 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.88■■■■□ 3.49
ANKRD13D-210ENST00000508422 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.83■■■■□ 3.492e-9■■■■□ 20.5
ANKRD13D-210ENST00000508422 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.73■■■■□ 3.47
ANKRD13D-210ENST00000508422 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.5■■■■□ 3.43
ANKRD13D-210ENST00000508422 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
ANKRD13D-210ENST00000508422 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.34■■■■□ 3.41
ANKRD13D-210ENST00000508422 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.98■■■■□ 3.35
ANKRD13D-210ENST00000508422 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.92■■■■□ 3.34
ANKRD13D-210ENST00000508422 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.89■■■■□ 3.34
ANKRD13D-210ENST00000508422 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.86■■■■□ 3.33
ANKRD13D-210ENST00000508422 SCRIBQ14160 1630 aa35.67■■■■□ 3.3
ANKRD13D-210ENST00000508422 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
ANKRD13D-210ENST00000508422 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.15■■■■□ 3.22
ANKRD13D-210ENST00000508422 CUX2O14529 1486 aa34.52■■■■□ 3.12
ANKRD13D-210ENST00000508422 ERCC6Q03468 1493 aa34.38■■■■□ 3.09
ANKRD13D-210ENST00000508422 NCAPD3P42695 1498 aa34.21■■■■□ 3.07
ANKRD13D-210ENST00000508422 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.05■■■■□ 3.04
ANKRD13D-210ENST00000508422 HMGXB3Q12766 1538 aa33.98■■■■□ 3.03
ANKRD13D-210ENST00000508422 NESP48681 1621 aa33.97■■■■□ 3.03
ANKRD13D-210ENST00000508422 SMARCA2P51531 1590 aa33.96■■■■□ 3.03
ANKRD13D-210ENST00000508422 SMARCA4P51532 1647 aa33.93■■■■□ 3.02
ANKRD13D-210ENST00000508422 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
ANKRD13D-210ENST00000508422 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
ANKRD13D-210ENST00000508422 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
ANKRD13D-210ENST00000508422 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.64■■■□□ 2.98
ANKRD13D-210ENST00000508422 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.63■■■□□ 2.97
ANKRD13D-210ENST00000508422 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.6■■■□□ 2.97
ANKRD13D-210ENST00000508422 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.56■■■□□ 2.96
ANKRD13D-210ENST00000508422 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
ANKRD13D-210ENST00000508422 TRIM41Q8WV44 630 aa33.41■■■□□ 2.94
ANKRD13D-210ENST00000508422 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.39■■■□□ 2.94
ANKRD13D-210ENST00000508422 WIZO95785 1651 aa33.26■■■□□ 2.92
ANKRD13D-210ENST00000508422 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.19■■■□□ 2.9
ANKRD13D-210ENST00000508422 WDR62O43379 1518 aa33.16■■■□□ 2.9
ANKRD13D-210ENST00000508422 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.14■■■□□ 2.9
ANKRD13D-210ENST00000508422 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
ANKRD13D-210ENST00000508422 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.94■■■□□ 2.86
ANKRD13D-210ENST00000508422 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
ANKRD13D-210ENST00000508422 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.82■■■□□ 2.84
ANKRD13D-210ENST00000508422 OSCARQ8IYS5 282 aa32.75■■■□□ 2.83
ANKRD13D-210ENST00000508422 CFTRP13569 1480 aa32.65■■■□□ 2.82
ANKRD13D-210ENST00000508422 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
ANKRD13D-210ENST00000508422 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.56■■■□□ 2.8
ANKRD13D-210ENST00000508422 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.56■■■□□ 2.8
ANKRD13D-210ENST00000508422 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.56■■■□□ 2.8
ANKRD13D-210ENST00000508422 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.54■■■□□ 2.8
ANKRD13D-210ENST00000508422 PRDM2Q13029 1718 aa32.49■■■□□ 2.79
ANKRD13D-210ENST00000508422 ARHGEF11O15085 1522 aa32.33■■■□□ 2.77
ANKRD13D-210ENST00000508422 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
ANKRD13D-210ENST00000508422 IFT140Q96RY7 1462 aa32.28■■■□□ 2.76
ANKRD13D-210ENST00000508422 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
ANKRD13D-210ENST00000508422 TOPBP1Q92547 1522 aa32.14■■■□□ 2.74
ANKRD13D-210ENST00000508422 CHD1O14646 1710 aa32.13■■■□□ 2.73
ANKRD13D-210ENST00000508422 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.05■■■□□ 2.72
ANKRD13D-210ENST00000508422 ABCC8Q09428 1581 aa31.99■■■□□ 2.71
ANKRD13D-210ENST00000508422 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.99■■■□□ 2.71
ANKRD13D-210ENST00000508422 ARAP1Q96P48 1450 aa31.96■■■□□ 2.71
ANKRD13D-210ENST00000508422 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
ANKRD13D-210ENST00000508422 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
ANKRD13D-210ENST00000508422 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.91■■■□□ 2.73e-7■■■■■ 44.4
ANKRD13D-210ENST00000508422 FBLN2P98095 1184 aa31.82■■■□□ 2.68
ANKRD13D-210ENST00000508422 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
ANKRD13D-210ENST00000508422 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.65■■■□□ 2.66
ANKRD13D-210ENST00000508422 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.64■■■□□ 2.66
ANKRD13D-210ENST00000508422 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.61■■■□□ 2.65
ANKRD13D-210ENST00000508422 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
ANKRD13D-210ENST00000508422 SYNJ1O43426 1573 aa31.57■■■□□ 2.64
ANKRD13D-210ENST00000508422 SOGA1O94964 1423 aa31.57■■■□□ 2.64
ANKRD13D-210ENST00000508422 WDR97A6NE52 1622 aa31.57■■■□□ 2.64
ANKRD13D-210ENST00000508422 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
ANKRD13D-210ENST00000508422 CUX1P39880 1505 aa31.49■■■□□ 2.63
ANKRD13D-210ENST00000508422 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.48■■■□□ 2.63
ANKRD13D-210ENST00000508422 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.48■■■□□ 2.63
ANKRD13D-210ENST00000508422 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
ANKRD13D-210ENST00000508422 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
ANKRD13D-210ENST00000508422 PBRM1Q86U86 1689 aa31.39■■■□□ 2.62
ANKRD13D-210ENST00000508422 GRIN2BQ13224 1484 aa31.39■■■□□ 2.62
ANKRD13D-210ENST00000508422 SYNJ2O15056 1496 aa31.37■■■□□ 2.61
ANKRD13D-210ENST00000508422 TOP2BQ02880 1626 aa31.33■■■□□ 2.61
ANKRD13D-210ENST00000508422 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.32■■■□□ 2.6
ANKRD13D-210ENST00000508422 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.3■■■□□ 2.6
ANKRD13D-210ENST00000508422 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.25■■■□□ 2.59
ANKRD13D-210ENST00000508422 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.16■■■□□ 2.58
ANKRD13D-210ENST00000508422 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.11■■■□□ 2.57
ANKRD13D-210ENST00000508422 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.06■■■□□ 2.56
ANKRD13D-210ENST00000508422 GRIN2AQ12879 1464 aa31.01■■■□□ 2.55
ANKRD13D-210ENST00000508422 CEP170Q5SW79 1584 aa31■■■□□ 2.55
ANKRD13D-210ENST00000508422 ADAMTS12P58397 1594 aa30.97■■■□□ 2.55
ANKRD13D-210ENST00000508422 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.96■■■□□ 2.55
ANKRD13D-210ENST00000508422 SHROOM2Q13796 1616 aa30.92■■■□□ 2.54
ANKRD13D-210ENST00000508422 NUP160Q12769 1436 aa30.9■■■□□ 2.54
ANKRD13D-210ENST00000508422 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.78■■■□□ 2.52
ANKRD13D-210ENST00000508422 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.75■■■□□ 2.51
ANKRD13D-210ENST00000508422 KIF27Q86VH2 1401 aa30.74■■■□□ 2.51
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