RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513750.5

ANKRD13D-215, Transcript of ankyrin repeat domain 13D, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD13D, Length 2,081 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13D-215ENST00000513750 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.55■■■■□ 3.76
ANKRD13D-215ENST00000513750 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.23■■■□□ 2.91
ANKRD13D-215ENST00000513750 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
ANKRD13D-215ENST00000513750 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.17■■■□□ 2.74
ANKRD13D-215ENST00000513750 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.99■■■□□ 2.71
ANKRD13D-215ENST00000513750 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.73■■■□□ 2.67
ANKRD13D-215ENST00000513750 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
ANKRD13D-215ENST00000513750 ABCC9O60706 1549 aa31.19■■■□□ 2.58
ANKRD13D-215ENST00000513750 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.1■■■□□ 2.57
ANKRD13D-215ENST00000513750 SCRIBQ14160 1630 aa30.88■■■□□ 2.53
ANKRD13D-215ENST00000513750 NACADO15069 1562 aa30.85■■■□□ 2.53
ANKRD13D-215ENST00000513750 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.5■■■□□ 2.47
ANKRD13D-215ENST00000513750 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
ANKRD13D-215ENST00000513750 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.07■■■□□ 2.4
ANKRD13D-215ENST00000513750 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.02■■■□□ 2.4
ANKRD13D-215ENST00000513750 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.96■■■□□ 2.39
ANKRD13D-215ENST00000513750 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.88■■■□□ 2.37
ANKRD13D-215ENST00000513750 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
ANKRD13D-215ENST00000513750 WIZO95785 1651 aa29.69■■■□□ 2.34
ANKRD13D-215ENST00000513750 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.62■■■□□ 2.332e-9■■■■□ 20.5
ANKRD13D-215ENST00000513750 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.6■■■□□ 2.33
ANKRD13D-215ENST00000513750 SMARCA4P51532 1647 aa29.52■■■□□ 2.32
ANKRD13D-215ENST00000513750 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
ANKRD13D-215ENST00000513750 TRIM41Q8WV44 630 aa29.22■■■□□ 2.27
ANKRD13D-215ENST00000513750 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.09■■■□□ 2.25
ANKRD13D-215ENST00000513750 SMARCA2P51531 1590 aa29.07■■■□□ 2.24
ANKRD13D-215ENST00000513750 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.06■■■□□ 2.24
ANKRD13D-215ENST00000513750 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.03■■■□□ 2.24
ANKRD13D-215ENST00000513750 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
ANKRD13D-215ENST00000513750 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.91■■■□□ 2.22
ANKRD13D-215ENST00000513750 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
ANKRD13D-215ENST00000513750 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
ANKRD13D-215ENST00000513750 ABCC8Q09428 1581 aa28.74■■■□□ 2.19
ANKRD13D-215ENST00000513750 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.55■■■□□ 2.16
ANKRD13D-215ENST00000513750 NCAPD3P42695 1498 aa28.5■■■□□ 2.15
ANKRD13D-215ENST00000513750 HMGXB3Q12766 1538 aa28.48■■■□□ 2.15
ANKRD13D-215ENST00000513750 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.4■■■□□ 2.14
ANKRD13D-215ENST00000513750 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.36■■■□□ 2.13
ANKRD13D-215ENST00000513750 SOGA1O94964 1423 aa28.31■■■□□ 2.12
ANKRD13D-215ENST00000513750 SYNJ1O43426 1573 aa28.27■■■□□ 2.12
ANKRD13D-215ENST00000513750 EEA1Q15075 1411 aa28.2■■■□□ 2.11
ANKRD13D-215ENST00000513750 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.19■■■□□ 2.1
ANKRD13D-215ENST00000513750 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.15■■■□□ 2.1
ANKRD13D-215ENST00000513750 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.14■■■□□ 2.09
ANKRD13D-215ENST00000513750 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
ANKRD13D-215ENST00000513750 CFTRP13569 1480 aa28.06■■■□□ 2.08
ANKRD13D-215ENST00000513750 TOP2BQ02880 1626 aa28.04■■■□□ 2.08
ANKRD13D-215ENST00000513750 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.98■■■□□ 2.07
ANKRD13D-215ENST00000513750 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.96■■■□□ 2.07
ANKRD13D-215ENST00000513750 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.94■■■□□ 2.06
ANKRD13D-215ENST00000513750 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
ANKRD13D-215ENST00000513750 GOLGA3Q08378 1498 aa27.93■■■□□ 2.06
ANKRD13D-215ENST00000513750 HRCP23327 699 aa27.91■■■□□ 2.06
ANKRD13D-215ENST00000513750 CEP162Q5TB80 1403 aa27.9■■■□□ 2.06
ANKRD13D-215ENST00000513750 CUX1P39880 1505 aa27.89■■■□□ 2.06
ANKRD13D-215ENST00000513750 PRDM2Q13029 1718 aa27.89■■■□□ 2.06
ANKRD13D-215ENST00000513750 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.88■■■□□ 2.05
ANKRD13D-215ENST00000513750 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.85■■■□□ 2.05
ANKRD13D-215ENST00000513750 KIF21BO75037 1637 aa27.83■■■□□ 2.05
ANKRD13D-215ENST00000513750 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
ANKRD13D-215ENST00000513750 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.68■■■□□ 2.02
ANKRD13D-215ENST00000513750 KIF27Q86VH2 1401 aa27.62■■■□□ 2.01
ANKRD13D-215ENST00000513750 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.61■■■□□ 2.01
ANKRD13D-215ENST00000513750 NESP48681 1621 aa27.56■■■□□ 2
ANKRD13D-215ENST00000513750 CLIP1P30622 1438 aa27.54■■■□□ 2
ANKRD13D-215ENST00000513750 PRXQ9BXM0 1461 aa27.54■■■□□ 2
ANKRD13D-215ENST00000513750 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.52■■■□□ 2
ANKRD13D-215ENST00000513750 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.51■■□□□ 1.99
ANKRD13D-215ENST00000513750 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
ANKRD13D-215ENST00000513750 CUX2O14529 1486 aa27.47■■□□□ 1.99
ANKRD13D-215ENST00000513750 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
ANKRD13D-215ENST00000513750 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.43■■□□□ 1.98
ANKRD13D-215ENST00000513750 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.4■■□□□ 1.98
ANKRD13D-215ENST00000513750 TOPBP1Q92547 1522 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD13D-215ENST00000513750 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.35■■□□□ 1.97
ANKRD13D-215ENST00000513750 IGF1RP08069 1367 aa27.33■■□□□ 1.97
ANKRD13D-215ENST00000513750 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
ANKRD13D-215ENST00000513750 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.27■■□□□ 1.96
ANKRD13D-215ENST00000513750 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.26■■□□□ 1.95
ANKRD13D-215ENST00000513750 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
ANKRD13D-215ENST00000513750 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.22■■□□□ 1.95
ANKRD13D-215ENST00000513750 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.21■■□□□ 1.95
ANKRD13D-215ENST00000513750 APLP2Q06481 763 aa27.2■■□□□ 1.95
ANKRD13D-215ENST00000513750 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
ANKRD13D-215ENST00000513750 ARAP1Q96P48 1450 aa27.18■■□□□ 1.94
ANKRD13D-215ENST00000513750 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.16■■□□□ 1.94
ANKRD13D-215ENST00000513750 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.06■■□□□ 1.92
ANKRD13D-215ENST00000513750 WDR97A6NE52 1622 aa27.04■■□□□ 1.92
ANKRD13D-215ENST00000513750 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
ANKRD13D-215ENST00000513750 CUL7Q14999 1698 aa26.99■■□□□ 1.91
ANKRD13D-215ENST00000513750 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
ANKRD13D-215ENST00000513750 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
ANKRD13D-215ENST00000513750 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.93■■□□□ 1.9
ANKRD13D-215ENST00000513750 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.91■■□□□ 1.9
ANKRD13D-215ENST00000513750 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.88■■□□□ 1.89
ANKRD13D-215ENST00000513750 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
ANKRD13D-215ENST00000513750 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
ANKRD13D-215ENST00000513750 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
ANKRD13D-215ENST00000513750 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.8■■□□□ 1.88
ANKRD13D-215ENST00000513750 P3H3Q8IVL6 736 aa26.8■■□□□ 1.88
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