Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CEP112-209ENST00000580624 569 ntTSL 46.34□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 WDR41-202ENST00000502528 3268 ntTSL 1 (best)6.33□□□□□ -1.42e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 NUP62-210ENST00000596680 473 ntTSL 26.33□□□□□ -1.42e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.412e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DST-222ENST00000520645 4598 ntTSL 26.24□□□□□ -1.412e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC38A9-213ENST00000507216 290 ntTSL 36.21□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CSGALNACT1-212ENST00000523227 633 ntTSL 36.19□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF559-ZNF177-206ENST00000603024 610 ntTSL 46.1□□□□□ -1.432e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 BRAP-203ENST00000547043 1543 ntTSL 36.06□□□□□ -1.442e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PCMTD2-208ENST00000609764 572 ntTSL 46.02□□□□□ -1.452e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UGP2-222ENST00000491621 753 ntTSL 35.92□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZEB1-215ENST00000559476 1205 ntTSL 25.9□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 LDLRAD4-213ENST00000590115 501 ntTSL 45.87□□□□□ -1.472e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ASAP1-208ENST00000520625 606 ntTSL 35.85□□□□□ -1.472e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.482e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF480-203ENST00000468240 2527 ntTSL 25.82□□□□□ -1.482e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZEB1-213ENST00000558832 570 ntTSL 45.81□□□□□ -1.482e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZEB1-211ENST00000558440 886 ntTSL 1 (best)5.77□□□□□ -1.492e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.492e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.492e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SCARB2-218ENST00000639715 4355 ntTSL 55.73□□□□□ -1.492e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.492e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZEB1-210ENST00000557827 877 ntTSL 1 (best)5.71□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CCDC91-203ENST00000535520 1626 ntTSL 25.7□□□□□ -1.56e-8■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CDKN1B-204ENST00000477087 453 ntTSL 35.69□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF559-ZNF177-207ENST00000603099 584 ntTSL 45.68□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PITPNA-206ENST00000574991 627 ntTSL 35.68□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.512e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZEB1-209ENST00000542879 3645 ntTSL 25.62□□□□□ -1.512e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 STX8-210ENST00000574775 802 ntTSL 35.59□□□□□ -1.512e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 STRBP-209ENST00000496533 657 ntTSL 35.58□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RUNX1-217ENST00000494829 3622 ntTSL 1 (best)5.57□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DENND6A-204ENST00000477344 503 ntTSL 35.56□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DNAJB1-205ENST00000595992 601 ntTSL 25.55□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CEP350-205ENST00000429851 6096 ntTSL 1 (best)5.55□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RAB3GAP1-204ENST00000487003 3506 ntTSL 55.46□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.552e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.552e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CDK12-204ENST00000559545 586 ntTSL 55.29□□□□□ -1.569e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 CCDC91-217ENST00000543809 1667 ntTSL 1 (best)5.18□□□□□ -1.586e-8■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF559-ZNF177-217ENST00000605522 549 ntTSL 45.14□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 GMDS-207ENST00000530459 520 ntTSL 35.06□□□□□ -1.62e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.62e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.613e-11■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 QRICH1-209ENST00000477021 546 ntTSL 34.95□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 KDM3A-212ENST00000485171 556 ntTSL 44.94□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ABR-209ENST00000571022 551 ntTSL 44.92□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PIK3CA-203ENST00000468036 620 ntTSL 34.91□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC39A11-211ENST00000581581 386 ntTSL 34.89□□□□□ -1.632e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.632e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.632e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RBMS1-209ENST00000474820 4016 ntTSL 1 (best)4.86□□□□□ -1.632e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CUL3-212ENST00000497715 2400 ntTSL 24.82□□□□□ -1.642e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EPCAM-206ENST00000490733 752 ntTSL 34.77□□□□□ -1.652e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.652e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.652e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RUNX1-211ENST00000467692 453 ntTSL 24.75□□□□□ -1.652e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UGP2-211ENST00000475550 4397 ntTSL 1 (best)4.62□□□□□ -1.672e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.672e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 C1orf228-211ENST00000441519 836 ntAPPRIS ALT2 TSL 54.59□□□□□ -1.672e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PCMTD2-210ENST00000610074 541 ntTSL 44.58□□□□□ -1.682e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CWF19L2-202ENST00000431778 2955 ntTSL 1 (best)4.56□□□□□ -1.682e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 N4BP2-204ENST00000515550 724 ntTSL 34.56□□□□□ -1.682e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 WDR41-227ENST00000515253 1507 ntTSL 24.54□□□□□ -1.682e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TRPM7-202ENST00000558444 465 ntTSL 34.52□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EIF3H-202ENST00000517974 594 ntTSL 24.51□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RORA-214ENST00000561093 642 ntTSL 44.51□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF559-ZNF177-215ENST00000605301 565 ntTSL 44.5□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.699e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.712e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MSL2-205ENST00000491050 559 ntTSL 44.34□□□□□ -1.711e-6■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.722e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.722e-7■■■■■ 62.8
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