Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 GAPVD1-204ENST00000394083 4747 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.963e-8■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 PRDX1-205ENST00000447184 606 ntTSL 59.01□□□□□ -0.971e-9■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.083e-8■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 DEAF1-211ENST00000529727 248 ntTSL 38.18□□□□□ -1.11e-9■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 NEMF-206ENST00000555411 573 ntTSL 47.94□□□□□ -1.141e-9■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.23e-8■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.26e-6■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.223e-8■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.253e-8■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.381e-9■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.453e-8■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 CWC22-201ENST00000404136 2392 ntTSL 1 (best)5.54□□□□□ -1.521e-9■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 KNL1-205ENST00000528967 254 ntTSL 54.77□□□□□ -1.651e-9■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.721e-9■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.791e-9■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.919e-14■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 AASDHPPT-205ENST00000534152 5145 ntTSL 1 (best)3.08□□□□□ -1.921e-9■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 PRPF31-207ENST00000466404 1837 ntTSL 219.91■□□□□ 0.781e-6■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.561e-6■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.441e-6■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 TBC1D9B-213ENST00000521669 592 ntTSL 220.8■□□□□ 0.925e-9■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 GMPPA-208ENST00000455657 907 ntTSL 519.11■□□□□ 0.652e-7■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 GMPPA-210ENST00000480506 835 ntTSL 514.18□□□□□ -0.142e-7■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 GMPPA-214ENST00000635609 569 ntTSL 511.97□□□□□ -0.499e-8■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 BIRC6-209ENST00000471232 4226 ntTSL 26.94□□□□□ -1.34e-9■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 MED23-205ENST00000368068 5233 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.692e-8■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 MED23-204ENST00000368060 4446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.692e-8■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 MED23-202ENST00000368053 2811 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.82e-8■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 MED23-209ENST00000539158 1636 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.042e-8■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.242e-8■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.532e-8■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 MED15-207ENST00000423862 581 ntTSL 319.91■□□□□ 0.789e-9■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 MED15-228ENST00000487550 587 ntTSL 318.23■□□□□ 0.519e-9■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.138e-7■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.118e-7■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 SMTN-213ENST00000460658 5080 ntTSL 515.05■□□□□ 08e-7■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.018e-7■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.098e-7■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.178e-7■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 SMTN-218ENST00000489337 3560 ntTSL 212.66□□□□□ -0.388e-7■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.56e-7■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 TRNAU1AP-205ENST00000480930 1132 ntTSL 1 (best)17.34■□□□□ 0.378e-7■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.276e-7■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 TRNAU1AP-206ENST00000484775 1008 ntTSL 515.95■□□□□ 0.148e-7■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 TRNAU1AP-207ENST00000491577 1610 ntTSL 215.26■□□□□ 0.038e-7■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.118e-7■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.656e-7■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.836e-7■■■■□ 25.1
BUD13Q9BRD0 PASK-214ENST00000493544 5174 ntTSL 1 (best)14.23□□□□□ -0.132e-8■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 CTSH-215ENST00000534237 691 ntTSL 312.93□□□□□ -0.346e-9■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 PDIA5-208ENST00000495004 563 ntTSL 312.13□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 PPP6R2-208ENST00000473283 550 ntTSL 416.57■□□□□ 0.241e-6■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 FAXDC2-205ENST00000517938 1203 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.237e-9■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 FAXDC2-215ENST00000524250 3105 ntTSL 212.04□□□□□ -0.487e-9■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 FAXDC2-201ENST00000326080 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.827e-9■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 FAXDC2-202ENST00000423554 3817 ntTSL 29.18□□□□□ -0.947e-9■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 FAXDC2-210ENST00000520581 868 ntTSL 48.39□□□□□ -1.077e-9■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.12e-7■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.492e-7■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.362e-7■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-7■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 MTRNR2L4-201ENST00000399974 1762 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.489e-7■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 MACF1-226ENST00000497964 4160 ntTSL 27.8□□□□□ -1.169e-7■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 NECAP2-209ENST00000504858 727 ntTSL 519.09■□□□□ 0.653e-7■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 KDM3A-213ENST00000488971 975 ntTSL 35.89□□□□□ -1.475e-13■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.851e-12■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.731e-12■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.461e-12■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.081e-12■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.491e-12■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.111e-12■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.21e-12■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.271e-12■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 PKM-219ENST00000567118 2254 ntTSL 212□□□□□ -0.491e-12■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 A1CF-210ENST00000493415 926 ntTSL 57.04□□□□□ -1.283e-8■■■■□ 25
BUD13Q9BRD0 CYC1-203ENST00000528618 831 ntTSL 520.69■□□□□ 0.92e-30■■■■□ 24.9
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BUD13Q9BRD0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.781e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-220ENST00000411464 767 ntTSL 319.9■□□□□ 0.781e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.781e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.431e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.411e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.361e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.251e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.251e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-224ENST00000464148 636 ntTSL 516.02■□□□□ 0.161e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.11e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.021e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.061e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.11e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.171e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-212ENST00000366739 641 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.211e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-221ENST00000430433 864 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.331e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-203ENST00000336520 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.331e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-204ENST00000348259 661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.561e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-216ENST00000366744 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.721e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 MRPL55-211ENST00000366738 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.861e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 LIN54-210ENST00000510877 4507 ntTSL 1 (best)13.54□□□□□ -0.241e-7■■■■□ 24.9
BUD13Q9BRD0 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.281e-7■■■■□ 24.9
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