RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391755.1

PRPF31-202, Transcript of pre-mRNA processing factor 31, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PRPF31, Length 1,767 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31-202ENST00000391755 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.25■■■■■ 4.03
PRPF31-202ENST00000391755 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.1■■■■□ 3.21
PRPF31-202ENST00000391755 ABCC9O60706 1549 aa33.9■■■■□ 3.02
PRPF31-202ENST00000391755 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
PRPF31-202ENST00000391755 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.34■■■□□ 2.93
PRPF31-202ENST00000391755 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.15■■■□□ 2.9
PRPF31-202ENST00000391755 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.97■■■□□ 2.87
PRPF31-202ENST00000391755 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.73■■■□□ 2.83
PRPF31-202ENST00000391755 NACADO15069 1562 aa32.71■■■□□ 2.83
PRPF31-202ENST00000391755 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.55■■■□□ 2.8
PRPF31-202ENST00000391755 SCRIBQ14160 1630 aa32.2■■■□□ 2.74
PRPF31-202ENST00000391755 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.83■■■□□ 2.69
PRPF31-202ENST00000391755 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.72■■■□□ 2.67
PRPF31-202ENST00000391755 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.66■■■□□ 2.66
PRPF31-202ENST00000391755 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
PRPF31-202ENST00000391755 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.25■■■□□ 2.59
PRPF31-202ENST00000391755 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
PRPF31-202ENST00000391755 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.23■■■□□ 2.59
PRPF31-202ENST00000391755 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
PRPF31-202ENST00000391755 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.06■■■□□ 2.56
PRPF31-202ENST00000391755 SMARCA4P51532 1647 aa30.92■■■□□ 2.54
PRPF31-202ENST00000391755 WIZO95785 1651 aa30.78■■■□□ 2.52
PRPF31-202ENST00000391755 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
PRPF31-202ENST00000391755 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.65■■■□□ 2.5
PRPF31-202ENST00000391755 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.59■■■□□ 2.49
PRPF31-202ENST00000391755 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
PRPF31-202ENST00000391755 SMARCA2P51531 1590 aa30.44■■■□□ 2.46
PRPF31-202ENST00000391755 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.42■■■□□ 2.46
PRPF31-202ENST00000391755 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
PRPF31-202ENST00000391755 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.24■■■□□ 2.43
PRPF31-202ENST00000391755 NCAPD3P42695 1498 aa30.2■■■□□ 2.43
PRPF31-202ENST00000391755 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.19■■■□□ 2.42
PRPF31-202ENST00000391755 HMGXB3Q12766 1538 aa30.15■■■□□ 2.42
PRPF31-202ENST00000391755 TRIM41Q8WV44 630 aa29.7■■■□□ 2.35
PRPF31-202ENST00000391755 CFTRP13569 1480 aa29.52■■■□□ 2.32
PRPF31-202ENST00000391755 ABCC8Q09428 1581 aa29.51■■■□□ 2.31
PRPF31-202ENST00000391755 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.41■■■□□ 2.3
PRPF31-202ENST00000391755 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.3
PRPF31-202ENST00000391755 NESP48681 1621 aa29.36■■■□□ 2.29
PRPF31-202ENST00000391755 PRDM2Q13029 1718 aa29.31■■■□□ 2.28
PRPF31-202ENST00000391755 SYNJ1O43426 1573 aa29.23■■■□□ 2.27
PRPF31-202ENST00000391755 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.22■■■□□ 2.27
PRPF31-202ENST00000391755 TOP2BQ02880 1626 aa29.15■■■□□ 2.26
PRPF31-202ENST00000391755 ERCC6Q03468 1493 aa29.15■■■□□ 2.26
PRPF31-202ENST00000391755 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.11■■■□□ 2.25
PRPF31-202ENST00000391755 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
PRPF31-202ENST00000391755 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.06■■■□□ 2.24
PRPF31-202ENST00000391755 CUX1P39880 1505 aa29.05■■■□□ 2.24
PRPF31-202ENST00000391755 EEA1Q15075 1411 aa29.04■■■□□ 2.24
PRPF31-202ENST00000391755 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.03■■■□□ 2.24
PRPF31-202ENST00000391755 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.03■■■□□ 2.24
PRPF31-202ENST00000391755 SOGA1O94964 1423 aa28.99■■■□□ 2.23
PRPF31-202ENST00000391755 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.94■■■□□ 2.22
PRPF31-202ENST00000391755 CUX2O14529 1486 aa28.88■■■□□ 2.21
PRPF31-202ENST00000391755 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.88■■■□□ 2.21
PRPF31-202ENST00000391755 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
PRPF31-202ENST00000391755 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.86■■■□□ 2.21
PRPF31-202ENST00000391755 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.83■■■□□ 2.21
PRPF31-202ENST00000391755 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.81■■■□□ 2.2
PRPF31-202ENST00000391755 TOPBP1Q92547 1522 aa28.74■■■□□ 2.19
PRPF31-202ENST00000391755 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.74■■■□□ 2.19
PRPF31-202ENST00000391755 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.73■■■□□ 2.19
PRPF31-202ENST00000391755 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
PRPF31-202ENST00000391755 KIF27Q86VH2 1401 aa28.67■■■□□ 2.18
PRPF31-202ENST00000391755 WDR62O43379 1518 aa28.66■■■□□ 2.18
PRPF31-202ENST00000391755 KIF21BO75037 1637 aa28.61■■■□□ 2.17
PRPF31-202ENST00000391755 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.6■■■□□ 2.17
PRPF31-202ENST00000391755 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
PRPF31-202ENST00000391755 GOLGA3Q08378 1498 aa28.58■■■□□ 2.17
PRPF31-202ENST00000391755 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.52■■■□□ 2.16
PRPF31-202ENST00000391755 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.51■■■□□ 2.16
PRPF31-202ENST00000391755 PRXQ9BXM0 1461 aa28.48■■■□□ 2.15
PRPF31-202ENST00000391755 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.48■■■□□ 2.15
PRPF31-202ENST00000391755 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.44■■■□□ 2.14
PRPF31-202ENST00000391755 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
PRPF31-202ENST00000391755 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.41■■■□□ 2.14
PRPF31-202ENST00000391755 IGF1RP08069 1367 aa28.4■■■□□ 2.14
PRPF31-202ENST00000391755 WDR97A6NE52 1622 aa28.38■■■□□ 2.13
PRPF31-202ENST00000391755 CEP162Q5TB80 1403 aa28.32■■■□□ 2.12
PRPF31-202ENST00000391755 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
PRPF31-202ENST00000391755 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.26■■■□□ 2.11
PRPF31-202ENST00000391755 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.25■■■□□ 2.11
PRPF31-202ENST00000391755 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.21■■■□□ 2.11
PRPF31-202ENST00000391755 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
PRPF31-202ENST00000391755 IFT140Q96RY7 1462 aa28.21■■■□□ 2.11
PRPF31-202ENST00000391755 CUL7Q14999 1698 aa28.18■■■□□ 2.1
PRPF31-202ENST00000391755 CLIP1P30622 1438 aa28.12■■■□□ 2.09
PRPF31-202ENST00000391755 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
PRPF31-202ENST00000391755 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.08■■■□□ 2.09
PRPF31-202ENST00000391755 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.02■■■□□ 2.085e-9■■■■□ 19.6
PRPF31-202ENST00000391755 PBRM1Q86U86 1689 aa28■■■□□ 2.07
PRPF31-202ENST00000391755 GRIN2BQ13224 1484 aa28■■■□□ 2.07
PRPF31-202ENST00000391755 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
PRPF31-202ENST00000391755 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.93■■■□□ 2.06
PRPF31-202ENST00000391755 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.89■■■□□ 2.05
PRPF31-202ENST00000391755 ADAMTS12P58397 1594 aa27.88■■■□□ 2.05
PRPF31-202ENST00000391755 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
PRPF31-202ENST00000391755 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.83■■■□□ 2.05
PRPF31-202ENST00000391755 ARAP1Q96P48 1450 aa27.82■■■□□ 2.04
PRPF31-202ENST00000391755 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.82■■■□□ 2.04
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