Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.62e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.612e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 CBX3-208ENST00000497498 922 ntTSL 23.68□□□□□ -1.821e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 CBX3-207ENST00000481300 559 ntTSL 23.58□□□□□ -1.841e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 LINC00174-208ENST00000450353 1303 ntTSL 511.14□□□□□ -0.634e-8■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 LINC00174-210ENST00000638592 2261 ntTSL 510.19□□□□□ -0.784e-8■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 LINC00174-209ENST00000638517 4621 ntTSL 56.84□□□□□ -1.314e-8■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.625e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.635e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.755e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.85e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.821e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 GOLGA4-203ENST00000419177 760 ntTSL 316.01■□□□□ 0.151e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 GOLGA4-205ENST00000431105 568 ntTSL 314.37□□□□□ -0.111e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 ATP2A2-203ENST00000377685 5702 ntTSL 521.39■■□□□ 1.016e-9■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.426e-9■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.066e-9■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 ATP2A2-207ENST00000548169 2951 ntTSL 27.85□□□□□ -1.156e-9■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MAGI1-IT1-201ENST00000460754 2567 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.141e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PTBP1-206ENST00000585856 1217 ntTSL 226.58■■□□□ 1.852e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-208ENST00000479829 733 ntTSL 523.27■■□□□ 1.322e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PTBP1-207ENST00000585932 1030 ntTSL 320.67■□□□□ 0.92e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PTBP1-219ENST00000621737 1125 ntTSL 519.61■□□□□ 0.732e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-221ENST00000580008 957 ntTSL 1 (best)18.45■□□□□ 0.542e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.422e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PTBP1-210ENST00000586944 4661 ntTSL 216.86■□□□□ 0.292e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-206ENST00000428757 1105 ntTSL 515.98■□□□□ 0.152e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-225ENST00000580885 1963 ntTSL 515.8■□□□□ 0.122e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-233ENST00000585306 597 ntTSL 415.33■□□□□ 0.042e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.082e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-213ENST00000535071 2441 ntTSL 514.47□□□□□ -0.092e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.12e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 SEC23A-212ENST00000556092 571 ntTSL 414.08□□□□□ -0.162e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.252e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PLEKHA5-203ENST00000429027 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-214ENST00000535508 3334 ntTSL 211.58□□□□□ -0.552e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.562e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-216ENST00000543759 628 ntTSL 411.48□□□□□ -0.572e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.62e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.642e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.692e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-229ENST00000582023 592 ntTSL 410.64□□□□□ -0.712e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.822e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 AC008014.1-203ENST00000611243 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.92e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PLEKHA5-213ENST00000538714 6487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.952e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-227ENST00000581054 574 ntTSL 48.3□□□□□ -1.082e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-219ENST00000578901 728 ntTSL 1 (best)8.19□□□□□ -1.12e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.112e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PLEKHA5-215ENST00000539256 3357 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.132e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-223ENST00000580517 567 ntTSL 47.69□□□□□ -1.182e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-215ENST00000537674 548 ntTSL 37.69□□□□□ -1.182e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.212e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.472e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MED24-218ENST00000578161 580 ntTSL 34.85□□□□□ -1.632e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 SEC23A-210ENST00000555425 547 ntTSL 54.76□□□□□ -1.652e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PLEKHA5-210ENST00000538068 901 ntTSL 34.54□□□□□ -1.682e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.732e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PLEKHA5-207ENST00000536974 3139 ntTSL 23.94□□□□□ -1.782e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PLEKHA5-214ENST00000538972 2072 ntTSL 23.07□□□□□ -1.922e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 SEC23A-208ENST00000555017 588 ntTSL 43□□□□□ -1.932e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 GPC3-203ENST00000406757 836 ntTSL 28.14□□□□□ -1.118e-7■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-309ENST00000627155 610 ntTSL 510.46□□□□□ -0.734e-6■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-256ENST00000601395 614 ntTSL 55.33□□□□□ -1.564e-6■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-251ENST00000597318 599 ntTSL 55.29□□□□□ -1.564e-6■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 ZNF91-206ENST00000595533 695 ntTSL 212.03□□□□□ -0.481e-7■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 ZNF91-212ENST00000599743 662 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.711e-7■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 ZNF91-209ENST00000596989 565 ntTSL 310.62□□□□□ -0.711e-7■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 ZNF91-201ENST00000300619 5489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.881e-7■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.391e-7■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 MLH1-201ENST00000231790 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.833e-6■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 MLH1-221ENST00000536378 2567 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.883e-6■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 MLH1-222ENST00000539477 2366 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.953e-6■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 MLH1-216ENST00000458205 2608 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.973e-6■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 MLH1-213ENST00000456676 2230 ntTSL 1 (best)7.91□□□□□ -1.143e-6■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.393e-6■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 MLH1-203ENST00000413740 342 ntTSL 1 (best)4.71□□□□□ -1.663e-6■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 MLH1-223ENST00000616768 721 ntTSL 24.67□□□□□ -1.663e-6■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.793e-6■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 MLH1-210ENST00000450420 233 ntTSL 1 (best)3.62□□□□□ -1.833e-6■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 SND1-213ENST00000486037 695 ntTSL 39.71□□□□□ -0.863e-10■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 SND1-211ENST00000484767 460 ntTSL 48.53□□□□□ -1.043e-10■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 SND1-216ENST00000492840 472 ntTSL 54.38□□□□□ -1.713e-10■■■■□ 21.8
ILF3Q12906 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.251e-6■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.124e-7■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 04e-7■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.084e-7■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.164e-7■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 CUX1-210ENST00000497815 947 ntTSL 211.72□□□□□ -0.534e-7■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.674e-7■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.744e-7■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.784e-7■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.814e-7■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.824e-7■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.874e-7■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 CUX1-216ENST00000558469 588 ntTSL 49.42□□□□□ -0.94e-7■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.934e-7■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.994e-7■■■■□ 21.7
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