RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479829.5

MED24-208, Transcript of mediator complex subunit 24, human

TSL 5

Gene MED24, Length 733 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED24-208	ENST00000479829	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		57.01	■■■■■ 6.72
MED24-208	ENST00000479829	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.83	■■■■■ 5.73
MED24-208	ENST00000479829	ABCC9	O60706	1549 aa		49.55	■■■■■ 5.52
MED24-208	ENST00000479829	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.75	■■■■■ 5.23
MED24-208	ENST00000479829	NACAD	O15069	1562 aa		47.66	■■■■■ 5.22
MED24-208	ENST00000479829	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	47.55	■■■■■ 5.2
MED24-208	ENST00000479829	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.5	■■■■■ 5.19
MED24-208	ENST00000479829	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47.34	■■■■■ 5.17
MED24-208	ENST00000479829	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		47.18	■■■■■ 5.14
MED24-208	ENST00000479829	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.79	■■■■■ 5.08
MED24-208	ENST00000479829	SCRIB	Q14160	1630 aa		46.36	■■■■■ 5.01
MED24-208	ENST00000479829	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.26	■■■■■ 5
MED24-208	ENST00000479829	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.19	■■■■■ 4.98
MED24-208	ENST00000479829	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.79	■■■■■ 4.92
MED24-208	ENST00000479829	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		45.24	■■■■■ 4.83
MED24-208	ENST00000479829	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.05	■■■■■ 4.8
MED24-208	ENST00000479829	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		44.87	■■■■■ 4.77
MED24-208	ENST00000479829	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.5	■■■■■ 4.71
MED24-208	ENST00000479829	SMARCA4	P51532	1647 aa		44.32	■■■■■ 4.68
MED24-208	ENST00000479829	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	44.24	■■■■■ 4.67
MED24-208	ENST00000479829	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.98	■■■■■ 4.63
MED24-208	ENST00000479829	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.95	■■■■■ 4.63
MED24-208	ENST00000479829	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.94	■■■■■ 4.62
MED24-208	ENST00000479829	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.88	■■■■■ 4.61
MED24-208	ENST00000479829	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.83	■■■■■ 4.61
MED24-208	ENST00000479829	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.8	■■■■■ 4.6
MED24-208	ENST00000479829	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.65	■■■■■ 4.58
MED24-208	ENST00000479829	WIZ	O95785	1651 aa		43.56	■■■■■ 4.56
MED24-208	ENST00000479829	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	43.39	■■■■■ 4.54
MED24-208	ENST00000479829	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	43.09	■■■■■ 4.49
MED24-208	ENST00000479829	NES	P48681	1621 aa		42.89	■■■■■ 4.46
MED24-208	ENST00000479829	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.84	■■■■■ 4.45
MED24-208	ENST00000479829	ERCC6	Q03468	1493 aa		42.74	■■■■■ 4.43
MED24-208	ENST00000479829	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.59	■■■■■ 4.41
MED24-208	ENST00000479829	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.54	■■■■■ 4.4
MED24-208	ENST00000479829	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.48	■■■■■ 4.39
MED24-208	ENST00000479829	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.46	■■■■■ 4.39
MED24-208	ENST00000479829	CFTR	P13569	1480 aa		42.39	■■■■■ 4.38
MED24-208	ENST00000479829	PRDM2	Q13029	1718 aa		42.37	■■■■■ 4.37
MED24-208	ENST00000479829	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
MED24-208	ENST00000479829	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	42.32	■■■■■ 4.37
MED24-208	ENST00000479829	CUX2	O14529	1486 aa		42.24	■■■■■ 4.35
MED24-208	ENST00000479829	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.19	■■■■■ 4.34
MED24-208	ENST00000479829	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.17	■■■■■ 4.34
MED24-208	ENST00000479829	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		42.09	■■■■■ 4.33
MED24-208	ENST00000479829	WDR62	O43379	1518 aa		41.97	■■■■■ 4.31
MED24-208	ENST00000479829	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.77	■■■■■ 4.28
MED24-208	ENST00000479829	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.54	■■■■■ 4.24
MED24-208	ENST00000479829	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.54	■■■■■ 4.24
MED24-208	ENST00000479829	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.5	■■■■■ 4.23
MED24-208	ENST00000479829	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.25	■■■■■ 4.19
MED24-208	ENST00000479829	CUX1	P39880	1505 aa		41.24	■■■■■ 4.19
MED24-208	ENST00000479829	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	41.18	■■■■■ 4.18
MED24-208	ENST00000479829	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		41.11	■■■■■ 4.17
MED24-208	ENST00000479829	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	41.11	■■■■■ 4.17
MED24-208	ENST00000479829	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	41.04	■■■■■ 4.16
MED24-208	ENST00000479829	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	41.02	■■■■■ 4.16
MED24-208	ENST00000479829	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.99	■■■■■ 4.15
MED24-208	ENST00000479829	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.97	■■■■■ 4.15
MED24-208	ENST00000479829	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.97	■■■■■ 4.15
MED24-208	ENST00000479829	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.95	■■■■■ 4.15
MED24-208	ENST00000479829	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.95	■■■■■ 4.15
MED24-208	ENST00000479829	SOGA1	O94964	1423 aa		40.94	■■■■■ 4.14
MED24-208	ENST00000479829	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.89	■■■■■ 4.14
MED24-208	ENST00000479829	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.78	■■■■■ 4.12	5e-7	■■■■□ 23.6
MED24-208	ENST00000479829	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		40.71	■■■■■ 4.11
MED24-208	ENST00000479829	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.69	■■■■■ 4.1
MED24-208	ENST00000479829	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.68	■■■■■ 4.1
MED24-208	ENST00000479829	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.63	■■■■■ 4.1
MED24-208	ENST00000479829	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.61	■■■■■ 4.09
MED24-208	ENST00000479829	CHD1	O14646	1710 aa		40.55	■■■■■ 4.08
MED24-208	ENST00000479829	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.52	■■■■■ 4.08
MED24-208	ENST00000479829	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.51	■■■■■ 4.08
MED24-208	ENST00000479829	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.5	■■■■■ 4.07
MED24-208	ENST00000479829	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.43	■■■■■ 4.06
MED24-208	ENST00000479829	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.35	■■■■■ 4.05
MED24-208	ENST00000479829	FBLN2	P98095	1184 aa		40.26	■■■■■ 4.04
MED24-208	ENST00000479829	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.26	■■■■■ 4.03
MED24-208	ENST00000479829	ADAMTS12	P58397	1594 aa		40.24	■■■■■ 4.03
MED24-208	ENST00000479829	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		40.22	■■■■■ 4.03
MED24-208	ENST00000479829	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.15	■■■■■ 4.02
MED24-208	ENST00000479829	KIF27	Q86VH2	1401 aa		40.1	■■■■■ 4.01
MED24-208	ENST00000479829	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		40.04	■■■■■ 4
MED24-208	ENST00000479829	GRIN2A	Q12879	1464 aa		40.02	■■■■■ 4
MED24-208	ENST00000479829	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		39.99	■■■■□ 3.99
MED24-208	ENST00000479829	CUL7	Q14999	1698 aa		39.97	■■■■□ 3.99
MED24-208	ENST00000479829	TRIM41	Q8WV44	630 aa		39.94	■■■■□ 3.98
MED24-208	ENST00000479829	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		39.92	■■■■□ 3.98
MED24-208	ENST00000479829	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		39.92	■■■■□ 3.98
MED24-208	ENST00000479829	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		39.92	■■■■□ 3.98
MED24-208	ENST00000479829	ARHGEF11	O15085	1522 aa		39.86	■■■■□ 3.97
MED24-208	ENST00000479829	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.86	■■■■□ 3.97
MED24-208	ENST00000479829	IGF1R	P08069	1367 aa		39.83	■■■■□ 3.97
MED24-208	ENST00000479829	NUP160	Q12769	1436 aa		39.8	■■■■□ 3.96
MED24-208	ENST00000479829	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.74	■■■■□ 3.95
MED24-208	ENST00000479829	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		39.65	■■■■□ 3.94
MED24-208	ENST00000479829	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.58	■■■■□ 3.93
MED24-208	ENST00000479829	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.55	■■■■□ 3.92
MED24-208	ENST00000479829	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		39.48	■■■■□ 3.91
MED24-208	ENST00000479829	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		39.47	■■■■□ 3.91

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