Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.732e-6■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.152e-6■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-6■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 AL080251.1-201ENST00000494072 4369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.582e-6■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.911e-323■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 EEF1A1-205ENST00000455918 701 ntTSL 219.51■□□□□ 0.711e-323■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.141e-323■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 EEF1A1-201ENST00000309268 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.541e-323■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 EEF1A1-204ENST00000356303 635 ntTSL 28.81□□□□□ -11e-323■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.491e-323■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.611e-323■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.544e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 CPSF6-205ENST00000550075 540 ntTSL 426.82■■□□□ 1.884e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 TUBB6-202ENST00000417736 2163 ntTSL 226.5■■□□□ 1.834e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 UTP4-211ENST00000567460 595 ntTSL 422.79■■□□□ 1.244e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 UTP4-203ENST00000562237 2186 ntTSL 1 (best)21.47■■□□□ 1.034e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.034e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 TUBB6-205ENST00000586810 1493 ntTSL 1 (best)19.05■□□□□ 0.644e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 UTP4-209ENST00000567235 586 ntTSL 518.2■□□□□ 0.54e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 TUBB6-209ENST00000590693 524 ntTSL 418■□□□□ 0.474e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 TUBB6-207ENST00000590103 1075 ntTSL 217.68■□□□□ 0.424e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-232ENST00000495360 1313 ntTSL 517.56■□□□□ 0.44e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.394e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-210ENST00000460945 542 ntTSL 416.87■□□□□ 0.294e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.244e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.144e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 UTP4-213ENST00000568448 562 ntTSL 415.84■□□□□ 0.134e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.114e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 TUBB6-212ENST00000591463 485 ntTSL 215.45■□□□□ 0.064e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.044e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.074e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 TUBB6-206ENST00000587204 408 ntTSL 214.33□□□□□ -0.124e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-202ENST00000379812 599 ntTSL 514.32□□□□□ -0.124e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-231ENST00000494973 547 ntTSL 414.32□□□□□ -0.124e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.164e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.164e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.244e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-221ENST00000477119 568 ntTSL 313.54□□□□□ -0.244e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-215ENST00000468275 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.324e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.334e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.344e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 TUBB6-208ENST00000590388 576 ntTSL 412.88□□□□□ -0.354e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-206ENST00000379825 2023 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.374e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-213ENST00000465003 1991 ntTSL 1 (best)12.44□□□□□ -0.424e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-227ENST00000485479 1986 ntTSL 1 (best)12.44□□□□□ -0.424e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 UTP4-208ENST00000567015 690 ntTSL 212.16□□□□□ -0.464e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-208ENST00000436040 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.484e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-223ENST00000479656 1881 ntTSL 1 (best)12.02□□□□□ -0.494e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-230ENST00000494649 2099 ntTSL 1 (best)11.62□□□□□ -0.554e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-209ENST00000460940 1874 ntTSL 1 (best)11.52□□□□□ -0.574e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-204ENST00000379817 2106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.614e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-225ENST00000482687 1879 ntTSL 1 (best)11.08□□□□□ -0.644e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-224ENST00000480031 674 ntTSL 511.04□□□□□ -0.644e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 UTP4-207ENST00000566227 747 ntTSL 310.87□□□□□ -0.674e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-212ENST00000464632 679 ntTSL 1 (best)10.83□□□□□ -0.684e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-217ENST00000473221 687 ntTSL 210.83□□□□□ -0.684e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-205ENST00000379819 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.694e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-216ENST00000472896 1759 ntTSL 1 (best)10.63□□□□□ -0.714e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-226ENST00000483148 1764 ntTSL 1 (best)10.63□□□□□ -0.714e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-214ENST00000467331 2101 ntTSL 1 (best)10.58□□□□□ -0.724e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-207ENST00000397172 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.734e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 APTX-222ENST00000478279 684 ntTSL 1 (best)10.26□□□□□ -0.774e-13■□□□□ 9.3
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DDX3XO00571 APTX-219ENST00000474658 952 ntTSL 59.89□□□□□ -0.834e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.134e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 UTP4-205ENST00000563299 581 ntTSL 37.84□□□□□ -1.154e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 UTP4-216ENST00000569800 552 ntTSL 47.71□□□□□ -1.184e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.24e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 CPSF6-206ENST00000550987 560 ntTSL 46.35□□□□□ -1.394e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.974e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.55e-7■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 GAK-207ENST00000505819 1326 ntTSL 522.1■■□□□ 1.135e-7■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 GAK-209ENST00000507580 468 ntTSL 421.4■■□□□ 1.025e-7■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 GAK-219ENST00000512325 577 ntTSL 321.4■■□□□ 1.025e-7■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.015e-7■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 GAK-202ENST00000502656 554 ntTSL 420.14■□□□□ 0.815e-7■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.575e-7■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.315e-7■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.272e-17■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.055e-7■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.055e-7■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 GAK-220ENST00000513935 573 ntTSL 213.91□□□□□ -0.185e-7■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.282e-17■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 PCSK9-202ENST00000490692 3891 ntTSL 212.23□□□□□ -0.453e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 MREG-202ENST00000420348 584 ntTSL 46.79□□□□□ -1.325e-7■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 AZGP1-206ENST00000495765 540 ntTSL 26.6□□□□□ -1.352e-17■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 MREG-203ENST00000424992 560 ntTSL 56.04□□□□□ -1.445e-7■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 MREG-204ENST00000439791 576 ntTSL 45.32□□□□□ -1.565e-7■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 INSIG2-205ENST00000479999 532 ntTSL 24.51□□□□□ -1.695e-7■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 KEL-206ENST00000476829 649 ntTSL 315.55■□□□□ 0.081e-6■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 KEL-208ENST00000479768 1856 ntTSL 514.63□□□□□ -0.071e-6■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 KEL-204ENST00000467543 786 ntTSL 413.17□□□□□ -0.31e-6■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 KEL-201ENST00000355265 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.861e-6■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 AP001931.1-201ENST00000531074 580 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.442e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 CTNND1-210ENST00000524630 6553 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.742e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 CTNND1-235ENST00000533189 498 ntTSL 310.38□□□□□ -0.752e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.912e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 CTNND1-215ENST00000526938 3489 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.912e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.982e-13■□□□□ 9.3
DDX3XO00571 CTNND1-208ENST00000428599 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.982e-13■□□□□ 9.3
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