RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495360.5

APTX-232, Transcript of aprataxin, humanhuman

TSL 5

Gene APTX, Length 1,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTX-232ENST00000495360 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.82■■■■■ 4.44
APTX-232ENST00000495360 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.29■■■■□ 3.72
APTX-232ENST00000495360 ABCC9O60706 1549 aa37.94■■■■□ 3.66
APTX-232ENST00000495360 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.28■■■■□ 3.4
APTX-232ENST00000495360 NACADO15069 1562 aa36.1■■■■□ 3.37
APTX-232ENST00000495360 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.98■■■■□ 3.35
APTX-232ENST00000495360 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.7■■■■□ 3.31
APTX-232ENST00000495360 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
APTX-232ENST00000495360 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.41■■■■□ 3.26
APTX-232ENST00000495360 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.38■■■■□ 3.25
APTX-232ENST00000495360 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.35■■■■□ 3.25
APTX-232ENST00000495360 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.2■■■■□ 3.23
APTX-232ENST00000495360 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.18■■■■□ 3.22
APTX-232ENST00000495360 SCRIBQ14160 1630 aa34.92■■■■□ 3.18
APTX-232ENST00000495360 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.77■■■■□ 3.16
APTX-232ENST00000495360 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
APTX-232ENST00000495360 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.28■■■■□ 3.08
APTX-232ENST00000495360 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.13■■■■□ 3.05
APTX-232ENST00000495360 SMARCA4P51532 1647 aa33.33■■■□□ 2.93
APTX-232ENST00000495360 NCAPD3P42695 1498 aa33.3■■■□□ 2.92
APTX-232ENST00000495360 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.26■■■□□ 2.92
APTX-232ENST00000495360 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.23■■■□□ 2.91
APTX-232ENST00000495360 SMARCA2P51531 1590 aa33.21■■■□□ 2.91
APTX-232ENST00000495360 HMGXB3Q12766 1538 aa33.12■■■□□ 2.89
APTX-232ENST00000495360 MROH2BQ7Z745 1585 aa33■■■□□ 2.87
APTX-232ENST00000495360 PEG3Q9GZU2 1588 aa33■■■□□ 2.87
APTX-232ENST00000495360 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
APTX-232ENST00000495360 ERCC6Q03468 1493 aa32.75■■■□□ 2.83
APTX-232ENST00000495360 NESP48681 1621 aa32.68■■■□□ 2.82
APTX-232ENST00000495360 WIZO95785 1651 aa32.62■■■□□ 2.81
APTX-232ENST00000495360 CUX2O14529 1486 aa32.55■■■□□ 2.8
APTX-232ENST00000495360 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.52■■■□□ 2.8
APTX-232ENST00000495360 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
APTX-232ENST00000495360 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.31■■■□□ 2.76
APTX-232ENST00000495360 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.31■■■□□ 2.76
APTX-232ENST00000495360 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
APTX-232ENST00000495360 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.28■■■□□ 2.76
APTX-232ENST00000495360 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
APTX-232ENST00000495360 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.07■■■□□ 2.72
APTX-232ENST00000495360 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.03■■■□□ 2.72
APTX-232ENST00000495360 CFTRP13569 1480 aa32.02■■■□□ 2.72
APTX-232ENST00000495360 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.98■■■□□ 2.71
APTX-232ENST00000495360 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.97■■■□□ 2.71
APTX-232ENST00000495360 WDR62O43379 1518 aa31.94■■■□□ 2.7
APTX-232ENST00000495360 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.86■■■□□ 2.69
APTX-232ENST00000495360 PRDM2Q13029 1718 aa31.74■■■□□ 2.67
APTX-232ENST00000495360 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
APTX-232ENST00000495360 TOPBP1Q92547 1522 aa31.4■■■□□ 2.62
APTX-232ENST00000495360 ABCC8Q09428 1581 aa31.35■■■□□ 2.61
APTX-232ENST00000495360 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.33■■■□□ 2.61
APTX-232ENST00000495360 IFT140Q96RY7 1462 aa31.32■■■□□ 2.6
APTX-232ENST00000495360 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
APTX-232ENST00000495360 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
APTX-232ENST00000495360 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
APTX-232ENST00000495360 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
APTX-232ENST00000495360 OSCARQ8IYS5 282 aa31.09■■■□□ 2.57
APTX-232ENST00000495360 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
APTX-232ENST00000495360 CUX1P39880 1505 aa30.99■■■□□ 2.55
APTX-232ENST00000495360 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.98■■■□□ 2.555e-8■■□□□ 13.4
APTX-232ENST00000495360 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.98■■■□□ 2.55
APTX-232ENST00000495360 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.97■■■□□ 2.55
APTX-232ENST00000495360 SOGA1O94964 1423 aa30.96■■■□□ 2.55
APTX-232ENST00000495360 TRIM41Q8WV44 630 aa30.86■■■□□ 2.53
APTX-232ENST00000495360 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
APTX-232ENST00000495360 WDR97A6NE52 1622 aa30.81■■■□□ 2.52
APTX-232ENST00000495360 CHD1O14646 1710 aa30.78■■■□□ 2.52
APTX-232ENST00000495360 FBLN2P98095 1184 aa30.72■■■□□ 2.51
APTX-232ENST00000495360 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.7■■■□□ 2.51
APTX-232ENST00000495360 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.68■■■□□ 2.5
APTX-232ENST00000495360 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.68■■■□□ 2.5
APTX-232ENST00000495360 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.68■■■□□ 2.5
APTX-232ENST00000495360 GRIN2BQ13224 1484 aa30.66■■■□□ 2.5
APTX-232ENST00000495360 ARHGEF11O15085 1522 aa30.63■■■□□ 2.49
APTX-232ENST00000495360 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
APTX-232ENST00000495360 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.62■■■□□ 2.49
APTX-232ENST00000495360 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.62■■■□□ 2.49
APTX-232ENST00000495360 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.59■■■□□ 2.49
APTX-232ENST00000495360 TOP2BQ02880 1626 aa30.59■■■□□ 2.49
APTX-232ENST00000495360 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.59■■■□□ 2.49
APTX-232ENST00000495360 SYNJ1O43426 1573 aa30.57■■■□□ 2.49
APTX-232ENST00000495360 PBRM1Q86U86 1689 aa30.57■■■□□ 2.48
APTX-232ENST00000495360 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.56■■■□□ 2.48
APTX-232ENST00000495360 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
APTX-232ENST00000495360 SYNJ2O15056 1496 aa30.52■■■□□ 2.48
APTX-232ENST00000495360 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.43■■■□□ 2.46
APTX-232ENST00000495360 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.35■■■□□ 2.45
APTX-232ENST00000495360 ARAP1Q96P48 1450 aa30.34■■■□□ 2.45
APTX-232ENST00000495360 ADAMTS12P58397 1594 aa30.32■■■□□ 2.44
APTX-232ENST00000495360 GRIN2AQ12879 1464 aa30.27■■■□□ 2.44
APTX-232ENST00000495360 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.25■■■□□ 2.43
APTX-232ENST00000495360 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.22■■■□□ 2.43
APTX-232ENST00000495360 NUP160Q12769 1436 aa30.14■■■□□ 2.42
APTX-232ENST00000495360 CEP170Q5SW79 1584 aa30.14■■■□□ 2.42
APTX-232ENST00000495360 KIF27Q86VH2 1401 aa30■■■□□ 2.39
APTX-232ENST00000495360 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.99■■■□□ 2.39
APTX-232ENST00000495360 SHROOM2Q13796 1616 aa29.97■■■□□ 2.39
APTX-232ENST00000495360 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
APTX-232ENST00000495360 IGF1RP08069 1367 aa29.91■■■□□ 2.38
APTX-232ENST00000495360 CUL7Q14999 1698 aa29.9■■■□□ 2.38
APTX-232ENST00000495360 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.88■■■□□ 2.37
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