RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550075.5

CPSF6-205, Transcript of cleavage and polyadenylation specific factor 6, humanhuman

TSL 4

Gene CPSF6, Length 540 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF6-205ENST00000550075 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.97■■■■■ 7.67
CPSF6-205ENST00000550075 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.11■■■■■ 6.57
CPSF6-205ENST00000550075 ABCC9O60706 1549 aa54.74■■■■■ 6.35
CPSF6-205ENST00000550075 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.77■■■■■ 6.04
CPSF6-205ENST00000550075 NACADO15069 1562 aa52.69■■■■■ 6.03
CPSF6-205ENST00000550075 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.52■■■■■ 6
CPSF6-205ENST00000550075 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.49■■■■■ 5.99
CPSF6-205ENST00000550075 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.39■■■■■ 5.98
CPSF6-205ENST00000550075 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.16■■■■■ 5.94
CPSF6-205ENST00000550075 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.52■■■■■ 5.84
CPSF6-205ENST00000550075 SCRIBQ14160 1630 aa51.11■■■■■ 5.77
CPSF6-205ENST00000550075 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.06■■■■■ 5.77
CPSF6-205ENST00000550075 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.06■■■■■ 5.76
CPSF6-205ENST00000550075 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.71■■■■■ 5.71
CPSF6-205ENST00000550075 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.05■■■■■ 5.6
CPSF6-205ENST00000550075 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.77■■■■■ 5.56
CPSF6-205ENST00000550075 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.55■■■■■ 5.52
CPSF6-205ENST00000550075 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.22■■■■■ 5.47
CPSF6-205ENST00000550075 SMARCA4P51532 1647 aa48.9■■■■■ 5.42
CPSF6-205ENST00000550075 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.87■■■■■ 5.41
CPSF6-205ENST00000550075 SMARCA2P51531 1590 aa48.62■■■■■ 5.37
CPSF6-205ENST00000550075 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.57■■■■■ 5.37
CPSF6-205ENST00000550075 NCAPD3P42695 1498 aa48.55■■■■■ 5.36
CPSF6-205ENST00000550075 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.49■■■■■ 5.35
CPSF6-205ENST00000550075 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.43■■■■■ 5.34
CPSF6-205ENST00000550075 HMGXB3Q12766 1538 aa48.41■■■■■ 5.34
CPSF6-205ENST00000550075 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.24■■■■■ 5.31
CPSF6-205ENST00000550075 WIZO95785 1651 aa47.99■■■■■ 5.27
CPSF6-205ENST00000550075 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.93■■■■■ 5.26
CPSF6-205ENST00000550075 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.55■■■■■ 5.2
CPSF6-205ENST00000550075 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.36■■■■■ 5.17
CPSF6-205ENST00000550075 NESP48681 1621 aa47.34■■■■■ 5.17
CPSF6-205ENST00000550075 ERCC6Q03468 1493 aa47.27■■■■■ 5.16
CPSF6-205ENST00000550075 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.13■■■■■ 5.14
CPSF6-205ENST00000550075 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.01■■■■■ 5.12
CPSF6-205ENST00000550075 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.89■■■■■ 5.1
CPSF6-205ENST00000550075 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.87■■■■■ 5.09
CPSF6-205ENST00000550075 CFTRP13569 1480 aa46.87■■■■■ 5.09
CPSF6-205ENST00000550075 CUX2O14529 1486 aa46.77■■■■■ 5.08
CPSF6-205ENST00000550075 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.72■■■■■ 5.07
CPSF6-205ENST00000550075 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.69■■■■■ 5.06
CPSF6-205ENST00000550075 PRDM2Q13029 1718 aa46.65■■■■■ 5.06
CPSF6-205ENST00000550075 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.63■■■■■ 5.05
CPSF6-205ENST00000550075 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.62■■■■■ 5.05
CPSF6-205ENST00000550075 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.53■■■■■ 5.04
CPSF6-205ENST00000550075 WDR62O43379 1518 aa46.37■■■■■ 5.01
CPSF6-205ENST00000550075 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.13■■■■■ 4.97
CPSF6-205ENST00000550075 ABCC8Q09428 1581 aa45.95■■■■■ 4.95
CPSF6-205ENST00000550075 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.88■■■■■ 4.93
CPSF6-205ENST00000550075 TOPBP1Q92547 1522 aa45.87■■■■■ 4.93
CPSF6-205ENST00000550075 IFT140Q96RY7 1462 aa45.62■■■■■ 4.89
CPSF6-205ENST00000550075 CUX1P39880 1505 aa45.52■■■■■ 4.88
CPSF6-205ENST00000550075 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.49■■■■■ 4.87
CPSF6-205ENST00000550075 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.38■■■■■ 4.86
CPSF6-205ENST00000550075 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.37■■■■■ 4.85
CPSF6-205ENST00000550075 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.32■■■■■ 4.85
CPSF6-205ENST00000550075 SOGA1O94964 1423 aa45.27■■■■■ 4.84
CPSF6-205ENST00000550075 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.26■■■■■ 4.84
CPSF6-205ENST00000550075 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
CPSF6-205ENST00000550075 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.23■■■■■ 4.83
CPSF6-205ENST00000550075 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.19■■■■■ 4.83
CPSF6-205ENST00000550075 TOP2BQ02880 1626 aa45.19■■■■■ 4.82
CPSF6-205ENST00000550075 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.18■■■■■ 4.82
CPSF6-205ENST00000550075 WDR97A6NE52 1622 aa45.14■■■■■ 4.82
CPSF6-205ENST00000550075 SYNJ1O43426 1573 aa45.12■■■■■ 4.81
CPSF6-205ENST00000550075 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.06■■■■■ 4.82e-6■■■□□ 17.8
CPSF6-205ENST00000550075 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
CPSF6-205ENST00000550075 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.96■■■■■ 4.79
CPSF6-205ENST00000550075 GRIN2BQ13224 1484 aa44.8■■■■■ 4.76
CPSF6-205ENST00000550075 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.79■■■■■ 4.76
CPSF6-205ENST00000550075 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.78■■■■■ 4.76
CPSF6-205ENST00000550075 PBRM1Q86U86 1689 aa44.75■■■■■ 4.75
CPSF6-205ENST00000550075 OSCARQ8IYS5 282 aa44.74■■■■■ 4.75
CPSF6-205ENST00000550075 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.72■■■■■ 4.75
CPSF6-205ENST00000550075 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.72■■■■■ 4.75
CPSF6-205ENST00000550075 CHD1O14646 1710 aa44.67■■■■■ 4.74
CPSF6-205ENST00000550075 FBLN2P98095 1184 aa44.55■■■■■ 4.72
CPSF6-205ENST00000550075 SYNJ2O15056 1496 aa44.52■■■■■ 4.72
CPSF6-205ENST00000550075 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.45■■■■■ 4.71
CPSF6-205ENST00000550075 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.45■■■■■ 4.71
CPSF6-205ENST00000550075 ADAMTS12P58397 1594 aa44.39■■■■■ 4.7
CPSF6-205ENST00000550075 KIF27Q86VH2 1401 aa44.33■■■■■ 4.69
CPSF6-205ENST00000550075 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.28■■■■■ 4.68
CPSF6-205ENST00000550075 GRIN2AQ12879 1464 aa44.21■■■■■ 4.67
CPSF6-205ENST00000550075 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.17■■■■■ 4.66
CPSF6-205ENST00000550075 TRIM41Q8WV44 630 aa44.14■■■■■ 4.66
CPSF6-205ENST00000550075 CUL7Q14999 1698 aa44.11■■■■■ 4.65
CPSF6-205ENST00000550075 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.08■■■■■ 4.65
CPSF6-205ENST00000550075 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.08■■■■■ 4.65
CPSF6-205ENST00000550075 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.08■■■■■ 4.65
CPSF6-205ENST00000550075 ARHGEF11O15085 1522 aa44.07■■■■■ 4.65
CPSF6-205ENST00000550075 IGF1RP08069 1367 aa44.04■■■■■ 4.64
CPSF6-205ENST00000550075 NUP160Q12769 1436 aa44■■■■■ 4.63
CPSF6-205ENST00000550075 CEP170Q5SW79 1584 aa43.97■■■■■ 4.63
CPSF6-205ENST00000550075 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.83■■■■■ 4.61
CPSF6-205ENST00000550075 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.78■■■■■ 4.6
CPSF6-205ENST00000550075 SHROOM2Q13796 1616 aa43.7■■■■■ 4.59
CPSF6-205ENST00000550075 ARAP1Q96P48 1450 aa43.7■■■■■ 4.59
CPSF6-205ENST00000550075 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.62■■■■■ 4.57
CPSF6-205ENST00000550075 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.59■■■■■ 4.57
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