Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.33e-7■■■■■ 270.1
UTP3Q9NQZ2 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.399e-7■■■■■ 270.1
UTP3Q9NQZ2 EIF3K-214ENST00000614624 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.589e-7■■■■■ 270.1
UTP3Q9NQZ2 EIF3K-208ENST00000588934 501 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.79e-7■■■■■ 270.1
UTP3Q9NQZ2 EIF3K-201ENST00000248342 864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.779e-7■■■■■ 270.1
UTP3Q9NQZ2 EIF3K-211ENST00000592558 670 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.789e-7■■■■■ 270.1
UTP3Q9NQZ2 SMAD3-204ENST00000540846 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.278e-7■■■■■ 269.8
UTP3Q9NQZ2 RPS6KA4-207ENST00000532496 588 ntTSL 514.87□□□□□ -0.033e-68■■■■■ 269.2
UTP3Q9NQZ2 ROBO2-202ENST00000461745 8946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.77e-18■■■■■ 269.2
UTP3Q9NQZ2 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.797e-18■■■■■ 269.2
UTP3Q9NQZ2 ROBO2-206ENST00000473767 5393 ntTSL 1 (best)8.87□□□□□ -0.997e-18■■■■■ 269.2
UTP3Q9NQZ2 STAT2-208ENST00000557156 539 ntTSL 48.19□□□□□ -1.17e-18■■■■■ 269.2
UTP3Q9NQZ2 STRN4-203ENST00000435164 1551 ntTSL 215.46■□□□□ 0.078e-8■■■■■ 269.2
UTP3Q9NQZ2 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.441e-6■■■■■ 269.1
UTP3Q9NQZ2 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.571e-6■■■■■ 269.1
UTP3Q9NQZ2 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.641e-6■■■■■ 269.1
UTP3Q9NQZ2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.371e-7■■■■■ 268.9
UTP3Q9NQZ2 UBE2H-208ENST00000490974 572 ntTSL 524.45■■□□□ 1.55e-7■■■■■ 268.9
UTP3Q9NQZ2 UBE2H-203ENST00000472396 758 ntTSL 522.93■■□□□ 1.265e-7■■■■■ 268.9
UTP3Q9NQZ2 UBE2H-205ENST00000480245 436 ntTSL 38.5□□□□□ -1.055e-7■■■■■ 268.9
UTP3Q9NQZ2 NUMBL-203ENST00000593367 587 ntTSL 419.9■□□□□ 0.788e-8■■■■■ 268.6
UTP3Q9NQZ2 NUMBL-211ENST00000600967 640 ntTSL 318.74■□□□□ 0.598e-8■■■■■ 268.6
UTP3Q9NQZ2 PRKRIP1-203ENST00000468316 2045 ntTSL 1 (best)17.09■□□□□ 0.334e-7■■■■■ 268.5
UTP3Q9NQZ2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.245e-9■■■■■ 268.3
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.313e-9■■■■■ 268.2
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-225ENST00000582746 1645 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.553e-9■■■■■ 268.2
UTP3Q9NQZ2 UXS1-204ENST00000416298 701 ntTSL 512.17□□□□□ -0.464e-6■■■■■ 268.1
UTP3Q9NQZ2 UXS1-202ENST00000409032 1935 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.614e-6■■■■■ 268.1
UTP3Q9NQZ2 REXO1-207ENST00000590936 1271 ntTSL 516.17■□□□□ 0.189e-12■■■■■ 267.9
UTP3Q9NQZ2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.838e-7■■■■■ 267.7
UTP3Q9NQZ2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 267.7
UTP3Q9NQZ2 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 267.7
UTP3Q9NQZ2 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 267.7
UTP3Q9NQZ2 TUBGCP6-208ENST00000498611 5274 ntTSL 1 (best)20.51■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 267.3
UTP3Q9NQZ2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 267.3
UTP3Q9NQZ2 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 267.3
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-221ENST00000523814 802 ntTSL 517.75■□□□□ 0.439e-7■■■■■ 267.3
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-204ENST00000517824 849 ntTSL 511.59□□□□□ -0.559e-7■■■■■ 267.3
UTP3Q9NQZ2 PEAK1-209ENST00000567808 520 ntTSL 322.02■■□□□ 1.122e-7■■■■■ 267.1
UTP3Q9NQZ2 PEAK1-210ENST00000569159 531 ntTSL 420.97■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 267.1
UTP3Q9NQZ2 PEAK1-208ENST00000567337 555 ntTSL 418.32■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 267.1
UTP3Q9NQZ2 TFDP1-203ENST00000453989 792 ntTSL 325.51■■□□□ 1.672e-8■■■■■ 266.5
UTP3Q9NQZ2 TFDP1-202ENST00000408980 866 ntTSL 524.18■■□□□ 1.462e-8■■■■■ 266.5
UTP3Q9NQZ2 TFDP1-208ENST00000544902 1571 ntTSL 223.9■■□□□ 1.422e-8■■■■■ 266.5
UTP3Q9NQZ2 TFDP1-206ENST00000475254 804 ntTSL 320■□□□□ 0.792e-8■■■■■ 266.5
UTP3Q9NQZ2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.112e-8■■■■■ 266.5
UTP3Q9NQZ2 TFDP1-205ENST00000465174 955 ntTSL 314.32□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 266.5
UTP3Q9NQZ2 ANKRD28-211ENST00000492895 539 ntTSL 45.88□□□□□ -1.477e-56■■■■■ 266.4
UTP3Q9NQZ2 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.012e-11■■■■■ 266.4
UTP3Q9NQZ2 ROBO2-212ENST00000602589 3382 ntTSL 513.15□□□□□ -0.32e-11■■■■■ 266.4
UTP3Q9NQZ2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 266.4
UTP3Q9NQZ2 XPC-205ENST00000476581 2944 ntTSL 1 (best)12.99□□□□□ -0.337e-7■■■■■ 266
UTP3Q9NQZ2 XPC-201ENST00000285021 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.417e-7■■■■■ 266
UTP3Q9NQZ2 KIAA0141-206ENST00000508751 998 ntTSL 512.25□□□□□ -0.452e-27■■■■■ 266
UTP3Q9NQZ2 KIAA0141-203ENST00000502729 833 ntTSL 310.17□□□□□ -0.782e-27■■■■■ 266
UTP3Q9NQZ2 CDC25A-205ENST00000459900 767 ntTSL 36.21□□□□□ -1.428e-7■■■■■ 266
UTP3Q9NQZ2 PHKB-203ENST00000563376 697 ntTSL 315□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 266
UTP3Q9NQZ2 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 265.7
UTP3Q9NQZ2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 265.7
UTP3Q9NQZ2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.171e-9■■■■■ 265.6
UTP3Q9NQZ2 PTPRS-206ENST00000588552 5443 ntTSL 1 (best)17.98■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 265.2
UTP3Q9NQZ2 AGFG2-203ENST00000430857 915 ntTSL 527.46■■□□□ 1.992e-6■■■■■ 264.5
UTP3Q9NQZ2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.192e-6■■■■■ 264.5
UTP3Q9NQZ2 AGFG2-205ENST00000477022 1327 ntTSL 1 (best)21.61■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 264.5
UTP3Q9NQZ2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.278e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 C1orf122-203ENST00000419397 223 ntTSL 527.68■■■□□ 2.028e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.828e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.498e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-215ENST00000450501 559 ntTSL 420.06■□□□□ 0.88e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-211ENST00000432387 584 ntTSL 419.94■□□□□ 0.788e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.498e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-208ENST00000412591 571 ntTSL 417.36■□□□□ 0.378e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.378e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-202ENST00000357490 563 ntTSL 417.26■□□□□ 0.358e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.268e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-222ENST00000492423 689 ntTSL 216.05■□□□□ 0.168e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.118e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-210ENST00000413197 2442 ntTSL 215.54■□□□□ 0.088e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.058e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.048e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.078e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.128e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.228e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 STRADA-222ENST00000583085 3685 nt13.3□□□□□ -0.288e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-209ENST00000412922 1935 ntTSL 512.86□□□□□ -0.358e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-214ENST00000449784 978 ntTSL 310.41□□□□□ -0.748e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-216ENST00000452375 600 ntTSL 410.41□□□□□ -0.748e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 STRADA-224ENST00000617949 705 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.798e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 STRADA-210ENST00000579318 1307 ntTSL 29.09□□□□□ -0.958e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 CTPS1-208ENST00000479480 777 ntTSL 58.9□□□□□ -0.988e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 STRADA-246ENST00000640397 1045 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.998e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 CTPS1-209ENST00000480420 750 ntTSL 38.66□□□□□ -1.028e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-218ENST00000466901 598 ntTSL 38.35□□□□□ -1.078e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.138e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 STRADA-245ENST00000640183 2378 ntTSL 56.81□□□□□ -1.328e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 STRADA-214ENST00000580039 998 ntTSL 55.92□□□□□ -1.468e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 COPS7B-220ENST00000479430 550 ntTSL 35.07□□□□□ -1.68e-25■■■■■ 264
UTP3Q9NQZ2 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.345e-13■■■■■ 263.8
UTP3Q9NQZ2 NCS1-202ENST00000493042 232 ntTSL 39.84□□□□□ -0.835e-13■■■■■ 263.8
UTP3Q9NQZ2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 263.6
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