RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 NISCHQ9Y2I1 1504 aa19.77■□□□□ 0.76
CTPS1-209ENST00000480420 ABCC9O60706 1549 aa17.79■□□□□ 0.44
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa17.69■□□□□ 0.42
CTPS1-209ENST00000480420 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17■□□□□ 0.31
CTPS1-209ENST00000480420 DCAF8L2P0C7V8 631 aa16.94■□□□□ 0.3
CTPS1-209ENST00000480420 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.82■□□□□ 0.28
CTPS1-209ENST00000480420 NACADO15069 1562 aa16.68■□□□□ 0.26
CTPS1-209ENST00000480420 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
CTPS1-209ENST00000480420 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.5■□□□□ 0.23
CTPS1-209ENST00000480420 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CTPS1-209ENST00000480420 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.37■□□□□ 0.21
CTPS1-209ENST00000480420 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.33■□□□□ 0.2
CTPS1-209ENST00000480420 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
CTPS1-209ENST00000480420 SCRIBQ14160 1630 aa16.26■□□□□ 0.19
CTPS1-209ENST00000480420 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.24■□□□□ 0.19
CTPS1-209ENST00000480420 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS1-209ENST00000480420 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-209ENST00000480420 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.02■□□□□ 0.15
CTPS1-209ENST00000480420 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTPS1-209ENST00000480420 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.84■□□□□ 0.13
CTPS1-209ENST00000480420 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-209ENST00000480420 CUX2O14529 1486 aa15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-209ENST00000480420 SMARCA4P51532 1647 aa15.43■□□□□ 0.06
CTPS1-209ENST00000480420 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.39■□□□□ 0.05
CTPS1-209ENST00000480420 SMARCA2P51531 1590 aa15.37■□□□□ 0.05
CTPS1-209ENST00000480420 NCAPD3P42695 1498 aa15.37■□□□□ 0.05
CTPS1-209ENST00000480420 ERCC6Q03468 1493 aa15.36■□□□□ 0.05
CTPS1-209ENST00000480420 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CTPS1-209ENST00000480420 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
CTPS1-209ENST00000480420 HMGXB3Q12766 1538 aa15.28■□□□□ 0.04
CTPS1-209ENST00000480420 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.28■□□□□ 0.04
CTPS1-209ENST00000480420 NESP48681 1621 aa15.21■□□□□ 0.03
CTPS1-209ENST00000480420 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.17■□□□□ 0.02
CTPS1-209ENST00000480420 WIZO95785 1651 aa15.16■□□□□ 0.02
CTPS1-209ENST00000480420 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CTPS1-209ENST00000480420 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.06■□□□□ 0
CTPS1-209ENST00000480420 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.05■□□□□ -0
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM41Q8WV44 630 aa15□□□□□ -0.01
CTPS1-209ENST00000480420 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS1-209ENST00000480420 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CTPS1-209ENST00000480420 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.96□□□□□ -0.02
CTPS1-209ENST00000480420 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CTPS1-209ENST00000480420 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.86□□□□□ -0.03
CTPS1-209ENST00000480420 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-209ENST00000480420 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.83□□□□□ -0.03
CTPS1-209ENST00000480420 WDR62O43379 1518 aa14.82□□□□□ -0.04
CTPS1-209ENST00000480420 CFTRP13569 1480 aa14.78□□□□□ -0.04
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC88BA6NC98 1476 aa14.75□□□□□ -0.05
CTPS1-209ENST00000480420 PRDM2Q13029 1718 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS1-209ENST00000480420 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTPS1-209ENST00000480420 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-209ENST00000480420 OSCARQ8IYS5 282 aa14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-209ENST00000480420 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.59□□□□□ -0.07
CTPS1-209ENST00000480420 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.59□□□□□ -0.07
CTPS1-209ENST00000480420 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.59□□□□□ -0.07
CTPS1-209ENST00000480420 TOPBP1Q92547 1522 aa14.55□□□□□ -0.08
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-209ENST00000480420 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-209ENST00000480420 IFT140Q96RY7 1462 aa14.5□□□□□ -0.09
CTPS1-209ENST00000480420 ABCC8Q09428 1581 aa14.5□□□□□ -0.09
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGEF11O15085 1522 aa14.49□□□□□ -0.09
CTPS1-209ENST00000480420 FBLN2P98095 1184 aa14.45□□□□□ -0.1
CTPS1-209ENST00000480420 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
CTPS1-209ENST00000480420 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.42□□□□□ -0.15e-9■■□□□ 12.5
CTPS1-209ENST00000480420 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
CTPS1-209ENST00000480420 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.4□□□□□ -0.1
CTPS1-209ENST00000480420 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
CTPS1-209ENST00000480420 SOGA1O94964 1423 aa14.38□□□□□ -0.11
CTPS1-209ENST00000480420 CHD1O14646 1710 aa14.38□□□□□ -0.11
CTPS1-209ENST00000480420 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
CTPS1-209ENST00000480420 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.36□□□□□ -0.11
CTPS1-209ENST00000480420 CUX1P39880 1505 aa14.34□□□□□ -0.11
CTPS1-209ENST00000480420 ARAP1Q96P48 1450 aa14.33□□□□□ -0.12
CTPS1-209ENST00000480420 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.33□□□□□ -0.12
CTPS1-209ENST00000480420 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
CTPS1-209ENST00000480420 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
CTPS1-209ENST00000480420 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.26□□□□□ -0.13
CTPS1-209ENST00000480420 PBRM1Q86U86 1689 aa14.23□□□□□ -0.13
CTPS1-209ENST00000480420 GRIN2BQ13224 1484 aa14.21□□□□□ -0.13
CTPS1-209ENST00000480420 WDR97A6NE52 1622 aa14.21□□□□□ -0.13
CTPS1-209ENST00000480420 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.19□□□□□ -0.14
CTPS1-209ENST00000480420 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
CTPS1-209ENST00000480420 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.16□□□□□ -0.14
CTPS1-209ENST00000480420 SYNJ1O43426 1573 aa14.16□□□□□ -0.14
CTPS1-209ENST00000480420 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.15□□□□□ -0.14
CTPS1-209ENST00000480420 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.14□□□□□ -0.15
CTPS1-209ENST00000480420 SYNJ2O15056 1496 aa14.13□□□□□ -0.15
CTPS1-209ENST00000480420 TOP2BQ02880 1626 aa14.13□□□□□ -0.15
CTPS1-209ENST00000480420 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.13□□□□□ -0.15
CTPS1-209ENST00000480420 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.12□□□□□ -0.15
CTPS1-209ENST00000480420 ADAMTS12P58397 1594 aa14.03□□□□□ -0.16
CTPS1-209ENST00000480420 GRIN2AQ12879 1464 aa14.02□□□□□ -0.16
CTPS1-209ENST00000480420 FHAD1B1AJZ9 1412 aa13.98□□□□□ -0.17
CTPS1-209ENST00000480420 CEP170Q5SW79 1584 aa13.98□□□□□ -0.17
CTPS1-209ENST00000480420 ERICH3Q5RHP9 1530 aa13.97□□□□□ -0.17
CTPS1-209ENST00000480420 ERCC6L2Q5T890 1561 aa13.95□□□□□ -0.18
CTPS1-209ENST00000480420 NUP160Q12769 1436 aa13.91□□□□□ -0.18
CTPS1-209ENST00000480420 KIF27Q86VH2 1401 aa13.9□□□□□ -0.19
CTPS1-209ENST00000480420 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
CTPS1-209ENST00000480420 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
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