RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416298.5

UXS1-204, Transcript of UDP-glucuronate decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene UXS1, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UXS1-204ENST00000416298 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.71■■■□□ 2.35
UXS1-204ENST00000416298 ABCC9O60706 1549 aa27.58■■■□□ 2.01
UXS1-204ENST00000416298 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.04■■□□□ 1.92
UXS1-204ENST00000416298 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.51■■□□□ 1.83
UXS1-204ENST00000416298 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
UXS1-204ENST00000416298 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.06■■□□□ 1.76
UXS1-204ENST00000416298 NACADO15069 1562 aa25.73■■□□□ 1.71
UXS1-204ENST00000416298 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.68
UXS1-204ENST00000416298 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.43■■□□□ 1.66
UXS1-204ENST00000416298 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.28■■□□□ 1.64
UXS1-204ENST00000416298 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.27■■□□□ 1.64
UXS1-204ENST00000416298 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.22■■□□□ 1.63
UXS1-204ENST00000416298 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.21■■□□□ 1.63
UXS1-204ENST00000416298 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25■■□□□ 1.59
UXS1-204ENST00000416298 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.98■■□□□ 1.59
UXS1-204ENST00000416298 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.97■■□□□ 1.59
UXS1-204ENST00000416298 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.94■■□□□ 1.58
UXS1-204ENST00000416298 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
UXS1-204ENST00000416298 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.59■■□□□ 1.53
UXS1-204ENST00000416298 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
UXS1-204ENST00000416298 SCRIBQ14160 1630 aa24.43■■□□□ 1.5
UXS1-204ENST00000416298 CUX2O14529 1486 aa24.19■■□□□ 1.46
UXS1-204ENST00000416298 ERCC6Q03468 1493 aa23.9■■□□□ 1.42
UXS1-204ENST00000416298 NCAPD3P42695 1498 aa23.76■■□□□ 1.39
UXS1-204ENST00000416298 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.54■■□□□ 1.36
UXS1-204ENST00000416298 HMGXB3Q12766 1538 aa23.51■■□□□ 1.35
UXS1-204ENST00000416298 NESP48681 1621 aa23.48■■□□□ 1.35
UXS1-204ENST00000416298 SMARCA2P51531 1590 aa23.47■■□□□ 1.35
UXS1-204ENST00000416298 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
UXS1-204ENST00000416298 TRIM41Q8WV44 630 aa23.45■■□□□ 1.34
UXS1-204ENST00000416298 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.33■■□□□ 1.33
UXS1-204ENST00000416298 SMARCA4P51532 1647 aa23.32■■□□□ 1.32
UXS1-204ENST00000416298 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
UXS1-204ENST00000416298 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.21■■□□□ 1.31
UXS1-204ENST00000416298 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.2■■□□□ 1.3
UXS1-204ENST00000416298 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.18■■□□□ 1.3
UXS1-204ENST00000416298 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
UXS1-204ENST00000416298 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.02■■□□□ 1.28
UXS1-204ENST00000416298 WDR62O43379 1518 aa23■■□□□ 1.27
UXS1-204ENST00000416298 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.98■■□□□ 1.27
UXS1-204ENST00000416298 OSCARQ8IYS5 282 aa22.95■■□□□ 1.26
UXS1-204ENST00000416298 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.83■■□□□ 1.25
UXS1-204ENST00000416298 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.78■■□□□ 1.24
UXS1-204ENST00000416298 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.68■■□□□ 1.22
UXS1-204ENST00000416298 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.68■■□□□ 1.22
UXS1-204ENST00000416298 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.68■■□□□ 1.22
UXS1-204ENST00000416298 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.67■■□□□ 1.22
UXS1-204ENST00000416298 CFTRP13569 1480 aa22.57■■□□□ 1.2
UXS1-204ENST00000416298 ARHGEF11O15085 1522 aa22.54■■□□□ 1.2
UXS1-204ENST00000416298 WIZO95785 1651 aa22.52■■□□□ 1.2
UXS1-204ENST00000416298 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
UXS1-204ENST00000416298 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
UXS1-204ENST00000416298 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.39■■□□□ 1.17
UXS1-204ENST00000416298 IFT140Q96RY7 1462 aa22.38■■□□□ 1.17
UXS1-204ENST00000416298 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
UXS1-204ENST00000416298 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
UXS1-204ENST00000416298 PRDM2Q13029 1718 aa22.31■■□□□ 1.16
UXS1-204ENST00000416298 ARAP1Q96P48 1450 aa22.24■■□□□ 1.15
UXS1-204ENST00000416298 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
UXS1-204ENST00000416298 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
UXS1-204ENST00000416298 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
UXS1-204ENST00000416298 ABCC8Q09428 1581 aa22.18■■□□□ 1.14
UXS1-204ENST00000416298 CHD1O14646 1710 aa22.17■■□□□ 1.14
UXS1-204ENST00000416298 TOPBP1Q92547 1522 aa22.17■■□□□ 1.14
UXS1-204ENST00000416298 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
UXS1-204ENST00000416298 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
UXS1-204ENST00000416298 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.04■■□□□ 1.12
UXS1-204ENST00000416298 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
UXS1-204ENST00000416298 FBLN2P98095 1184 aa22.02■■□□□ 1.12
UXS1-204ENST00000416298 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.96■■□□□ 1.11
UXS1-204ENST00000416298 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.93■■□□□ 1.1
UXS1-204ENST00000416298 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
UXS1-204ENST00000416298 WDR97A6NE52 1622 aa21.88■■□□□ 1.09
UXS1-204ENST00000416298 SYNJ1O43426 1573 aa21.87■■□□□ 1.09
UXS1-204ENST00000416298 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.8■■□□□ 1.08
UXS1-204ENST00000416298 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
UXS1-204ENST00000416298 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
UXS1-204ENST00000416298 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
UXS1-204ENST00000416298 SOGA1O94964 1423 aa21.79■■□□□ 1.08
UXS1-204ENST00000416298 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.78■■□□□ 1.08
UXS1-204ENST00000416298 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.74■■□□□ 1.07
UXS1-204ENST00000416298 SYNJ2O15056 1496 aa21.71■■□□□ 1.07
UXS1-204ENST00000416298 GRIN2BQ13224 1484 aa21.7■■□□□ 1.06
UXS1-204ENST00000416298 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.64■■□□□ 1.05
UXS1-204ENST00000416298 PBRM1Q86U86 1689 aa21.55■■□□□ 1.04
UXS1-204ENST00000416298 CUX1P39880 1505 aa21.5■■□□□ 1.03
UXS1-204ENST00000416298 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.48■■□□□ 1.03
UXS1-204ENST00000416298 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.45■■□□□ 1.02
UXS1-204ENST00000416298 CEP170Q5SW79 1584 aa21.42■■□□□ 1.02
UXS1-204ENST00000416298 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.41■■□□□ 1.02
UXS1-204ENST00000416298 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.4■■□□□ 1.02
UXS1-204ENST00000416298 GRIN2AQ12879 1464 aa21.4■■□□□ 1.02
UXS1-204ENST00000416298 NUP160Q12769 1436 aa21.38■■□□□ 1.01
UXS1-204ENST00000416298 SHROOM2Q13796 1616 aa21.38■■□□□ 1.01
UXS1-204ENST00000416298 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
UXS1-204ENST00000416298 ADAMTS12P58397 1594 aa21.29■■□□□ 1
UXS1-204ENST00000416298 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.29■■□□□ 1
UXS1-204ENST00000416298 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.28■■□□□ 1
UXS1-204ENST00000416298 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.26■□□□□ 0.99
UXS1-204ENST00000416298 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms