RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375370.9

TFDP1-201, Transcript of transcription factor Dp-1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TFDP1, Length 2,648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFDP1-201ENST00000375370 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.96■■■□□ 2.55
TFDP1-201ENST00000375370 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.78■■□□□ 1.88
TFDP1-201ENST00000375370 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
TFDP1-201ENST00000375370 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.07■■□□□ 1.76
TFDP1-201ENST00000375370 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.47■■□□□ 1.67
TFDP1-201ENST00000375370 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TFDP1-201ENST00000375370 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.43■■□□□ 1.66
TFDP1-201ENST00000375370 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.13■■□□□ 1.61
TFDP1-201ENST00000375370 ABCC9O60706 1549 aa24.93■■□□□ 1.58
TFDP1-201ENST00000375370 NACADO15069 1562 aa24.83■■□□□ 1.57
TFDP1-201ENST00000375370 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.79■■□□□ 1.56
TFDP1-201ENST00000375370 SCRIBQ14160 1630 aa24.66■■□□□ 1.54
TFDP1-201ENST00000375370 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.56■■□□□ 1.52
TFDP1-201ENST00000375370 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TFDP1-201ENST00000375370 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.14■■□□□ 1.45
TFDP1-201ENST00000375370 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.13■■□□□ 1.45
TFDP1-201ENST00000375370 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.05■■□□□ 1.44
TFDP1-201ENST00000375370 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24■■□□□ 1.43
TFDP1-201ENST00000375370 WIZO95785 1651 aa23.92■■□□□ 1.42
TFDP1-201ENST00000375370 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.85■■□□□ 1.41
TFDP1-201ENST00000375370 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
TFDP1-201ENST00000375370 TRIM41Q8WV44 630 aa23.76■■□□□ 1.39
TFDP1-201ENST00000375370 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.74■■□□□ 1.39
TFDP1-201ENST00000375370 HRCP23327 699 aa23.69■■□□□ 1.38
TFDP1-201ENST00000375370 SMARCA4P51532 1647 aa23.62■■□□□ 1.37
TFDP1-201ENST00000375370 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TFDP1-201ENST00000375370 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
TFDP1-201ENST00000375370 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TFDP1-201ENST00000375370 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
TFDP1-201ENST00000375370 SMARCA2P51531 1590 aa23.42■■□□□ 1.34
TFDP1-201ENST00000375370 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.42■■□□□ 1.34
TFDP1-201ENST00000375370 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TFDP1-201ENST00000375370 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.34■■□□□ 1.33
TFDP1-201ENST00000375370 ABCC8Q09428 1581 aa23.28■■□□□ 1.32
TFDP1-201ENST00000375370 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.25■■□□□ 1.31
TFDP1-201ENST00000375370 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
TFDP1-201ENST00000375370 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.08■■□□□ 1.29
TFDP1-201ENST00000375370 SOGA1O94964 1423 aa23.02■■□□□ 1.27
TFDP1-201ENST00000375370 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.94■■□□□ 1.26
TFDP1-201ENST00000375370 HMGXB3Q12766 1538 aa22.92■■□□□ 1.26
TFDP1-201ENST00000375370 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TFDP1-201ENST00000375370 NCAPD3P42695 1498 aa22.89■■□□□ 1.26
TFDP1-201ENST00000375370 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
TFDP1-201ENST00000375370 EEA1Q15075 1411 aa22.87■■□□□ 1.25
TFDP1-201ENST00000375370 SYNJ1O43426 1573 aa22.85■■□□□ 1.25
TFDP1-201ENST00000375370 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.82■■□□□ 1.24
TFDP1-201ENST00000375370 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.81■■□□□ 1.24
TFDP1-201ENST00000375370 CEP162Q5TB80 1403 aa22.8■■□□□ 1.24
TFDP1-201ENST00000375370 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TFDP1-201ENST00000375370 GOLGA3Q08378 1498 aa22.69■■□□□ 1.22
TFDP1-201ENST00000375370 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.68■■□□□ 1.22
TFDP1-201ENST00000375370 KIF21BO75037 1637 aa22.63■■□□□ 1.21
TFDP1-201ENST00000375370 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TFDP1-201ENST00000375370 TOP2BQ02880 1626 aa22.59■■□□□ 1.21
TFDP1-201ENST00000375370 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.58■■□□□ 1.21
TFDP1-201ENST00000375370 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.55■■□□□ 1.2
TFDP1-201ENST00000375370 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.47■■□□□ 1.19
TFDP1-201ENST00000375370 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TFDP1-201ENST00000375370 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
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TFDP1-201ENST00000375370 CUX1P39880 1505 aa22.4■■□□□ 1.18
TFDP1-201ENST00000375370 CLIP1P30622 1438 aa22.4■■□□□ 1.18
TFDP1-201ENST00000375370 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TFDP1-201ENST00000375370 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.32■■□□□ 1.16
TFDP1-201ENST00000375370 PRXQ9BXM0 1461 aa22.32■■□□□ 1.16
TFDP1-201ENST00000375370 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.29■■□□□ 1.16
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TFDP1-201ENST00000375370 KIF27Q86VH2 1401 aa22.18■■□□□ 1.14
TFDP1-201ENST00000375370 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TFDP1-201ENST00000375370 ARAP1Q96P48 1450 aa22.14■■□□□ 1.13
TFDP1-201ENST00000375370 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.11■■□□□ 1.13
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TFDP1-201ENST00000375370 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TFDP1-201ENST00000375370 CUX2O14529 1486 aa22■■□□□ 1.11
TFDP1-201ENST00000375370 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22■■□□□ 1.11
TFDP1-201ENST00000375370 IGF1RP08069 1367 aa22■■□□□ 1.11
TFDP1-201ENST00000375370 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.99■■□□□ 1.11
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TFDP1-201ENST00000375370 NESP48681 1621 aa21.96■■□□□ 1.11
TFDP1-201ENST00000375370 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
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TFDP1-201ENST00000375370 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.85■■□□□ 1.09
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TFDP1-201ENST00000375370 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
TFDP1-201ENST00000375370 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TFDP1-201ENST00000375370 MAP3K1Q13233 1512 aa21.7■■□□□ 1.06
TFDP1-201ENST00000375370 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
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TFDP1-201ENST00000375370 WDR97A6NE52 1622 aa21.69■■□□□ 1.06
TFDP1-201ENST00000375370 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.66■■□□□ 1.06
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