Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.624e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.654e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 CTAGE5-211ENST00000554392 527 ntTSL 44.07□□□□□ -1.764e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 ASXL1-211ENST00000619344 550 ntTSL 512.75□□□□□ -0.372e-11■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 HERPUD1-205ENST00000562914 570 ntTSL 214.54□□□□□ -0.082e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 HERPUD1-215ENST00000568676 571 ntTSL 214.54□□□□□ -0.082e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 HERPUD1-211ENST00000566550 511 ntTSL 23□□□□□ -1.932e-9■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 PHF12-210ENST00000582655 2551 ntTSL 510.33□□□□□ -0.764e-6■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 CARD10-206ENST00000467812 1910 ntTSL 218.18■□□□□ 0.51e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 TF-203ENST00000460531 577 ntTSL 417.05■□□□□ 0.328e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 TF-208ENST00000474287 645 ntTSL 216.02■□□□□ 0.168e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 RFNG-203ENST00000578356 649 ntTSL 514.93□□□□□ -0.021e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 SSR4-212ENST00000491833 921 ntTSL 313.29□□□□□ -0.283e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 RFNG-210ENST00000584463 424 ntTSL 312.13□□□□□ -0.471e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 CYBA-205ENST00000565588 221 ntTSL 210.02□□□□□ -0.813e-10■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 GLUL-208ENST00000475808 868 ntTSL 28.06□□□□□ -1.121e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 GLUL-209ENST00000480604 908 ntTSL 57.3□□□□□ -1.241e-7■□□□□ 10.8
SF3B4Q15427 IGF2BP3-217ENST00000498363 529 ntTSL 24.53□□□□□ -1.685e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 FBXO11-206ENST00000465204 3158 ntTSL 26.04□□□□□ -1.442e-8■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 FBXO11-205ENST00000434234 572 ntTSL 34.48□□□□□ -1.692e-8■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.72e-8■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.359e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 RBBP4-201ENST00000373485 1417 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.099e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.259e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 RBBP4-206ENST00000458695 1674 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.269e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 RBBP4-214ENST00000492348 1547 ntTSL 26.02□□□□□ -1.459e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 DDX23-208ENST00000551098 1083 ntTSL 215.9■□□□□ 0.144e-8■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 DDX23-218ENST00000553182 779 ntTSL 313.11□□□□□ -0.314e-8■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 DDX23-203ENST00000547165 958 ntTSL 57.27□□□□□ -1.254e-8■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.471e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.461e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 POLA2-203ENST00000527618 1924 ntTSL 214.26□□□□□ -0.132e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SRPRA-204ENST00000530680 558 ntTSL 413.41□□□□□ -0.262e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SEPT6-206ENST00000460411 1393 ntTSL 219.39■□□□□ 0.692e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.362e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.042e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.092e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.182e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.572e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SEPT6-203ENST00000354416 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.932e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.052e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.382e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 PIGS-214ENST00000584080 584 ntTSL 411.74□□□□□ -0.532e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 PIGS-201ENST00000268758 2397 ntTSL 211.23□□□□□ -0.612e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 PIGS-204ENST00000465444 578 ntTSL 510.29□□□□□ -0.762e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 PIGS-209ENST00000577620 608 ntTSL 410.29□□□□□ -0.762e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 PIGS-211ENST00000582615 699 ntTSL 29.97□□□□□ -0.812e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 PIGS-210ENST00000580968 372 ntTSL 39.02□□□□□ -0.972e-6■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SSR4-207ENST00000471724 443 ntTSL 312.68□□□□□ -0.381e-9■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 FTCD-205ENST00000446405 436 ntTSL 317.48■□□□□ 0.394e-8■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 FTCD-209ENST00000483568 398 ntTSL 59.72□□□□□ -0.854e-8■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 GTPBP1-212ENST00000488787 582 ntTSL 521.03■□□□□ 0.962e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 GTPBP1-202ENST00000418601 810 ntTSL 217.61■□□□□ 0.412e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 GTPBP1-207ENST00000470836 505 ntTSL 413.84□□□□□ -0.192e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 GTPBP1-209ENST00000484657 585 ntTSL 410.35□□□□□ -0.752e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 GTPBP1-205ENST00000461428 476 ntTSL 29.26□□□□□ -0.932e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 NVL-208ENST00000467882 1310 ntTSL 59.54□□□□□ -0.882e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 NVL-221ENST00000492281 553 ntTSL 42.53□□□□□ -22e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 NVL-204ENST00000436927 766 ntTSL 32.39□□□□□ -2.032e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 NVL-219ENST00000488718 564 ntTSL 42.31□□□□□ -2.042e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 STIP1-208ENST00000540501 880 ntTSL 323.16■■□□□ 1.39e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ANKS3-207ENST00000586605 968 ntTSL 522.23■■□□□ 1.159e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ANKS3-226ENST00000592698 1128 ntTSL 522.23■■□□□ 1.159e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ANKS3-206ENST00000586166 672 ntTSL 322.01■■□□□ 1.119e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ANKS3-205ENST00000586159 868 ntTSL 321.52■■□□□ 1.049e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 LTBP4-211ENST00000594537 657 ntTSL 520.89■□□□□ 0.939e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ANKS3-225ENST00000592421 1146 ntTSL 320.04■□□□□ 0.89e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ANKS3-217ENST00000590730 2198 ntTSL 219.96■□□□□ 0.799e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 LTBP4-227ENST00000600026 723 ntTSL 319.67■□□□□ 0.749e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 LTBP4-224ENST00000599016 726 ntTSL 319.6■□□□□ 0.739e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 EML3-215ENST00000526116 581 ntTSL 319.34■□□□□ 0.699e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 CWC15-203ENST00000542165 921 ntTSL 1 (best)18.92■□□□□ 0.629e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SCAMP2-206ENST00000565345 790 ntTSL 517.34■□□□□ 0.379e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 CC2D1A-202ENST00000585896 1843 ntTSL 217.2■□□□□ 0.349e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 USP22-204ENST00000476111 573 ntTSL 316.74■□□□□ 0.279e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 LASP1-209ENST00000585841 1408 ntTSL 216.12■□□□□ 0.179e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 CWC15-204ENST00000542907 790 ntTSL 314.82□□□□□ -0.049e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SCAMP2-208ENST00000566557 585 ntTSL 214.73□□□□□ -0.059e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ANKS3-222ENST00000592068 916 ntTSL 314.62□□□□□ -0.079e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 HELZ-210ENST00000581159 617 ntTSL 314.59□□□□□ -0.079e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 LASP1-202ENST00000419929 762 ntTSL 314.46□□□□□ -0.099e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 LASP1-205ENST00000443937 1482 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.149e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 TNFRSF12A-207ENST00000575836 161 ntTSL 313.99□□□□□ -0.179e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.29e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SCAMP2-209ENST00000567638 678 ntTSL 213.74□□□□□ -0.219e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SCAMP2-205ENST00000564529 866 ntTSL 213.72□□□□□ -0.219e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ANKS3-229ENST00000593120 572 ntTSL 413.64□□□□□ -0.239e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.329e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ANKS3-213ENST00000589065 561 ntTSL 512.93□□□□□ -0.349e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 MCM5-203ENST00000416905 739 ntTSL 312.33□□□□□ -0.449e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 LASP1-208ENST00000584106 1167 ntTSL 212.12□□□□□ -0.479e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 VAMP7-201ENST00000262640 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.589e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.619e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 MSL3-207ENST00000398527 2324 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.629e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 LASP1-203ENST00000433206 4023 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.659e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 SCAMP2-202ENST00000562363 638 ntTSL 510.57□□□□□ -0.729e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.739e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 VAMP7-206ENST00000488344 696 ntTSL 210.37□□□□□ -0.759e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 VAMP7-203ENST00000460621 658 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.839e-7■□□□□ 10.7
SF3B4Q15427 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.849e-7■□□□□ 10.7
Retrieved 100 of 47,349 protein–RNA pairs in 609.9 ms