RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488787.5

GTPBP1-212, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTPBP1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-212ENST00000488787 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.64■■■■■ 6.5
GTPBP1-212ENST00000488787 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.14■■■■■ 5.46
GTPBP1-212ENST00000488787 ABCC9O60706 1549 aa47.42■■■■■ 5.18
GTPBP1-212ENST00000488787 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.47■■■■■ 5.03
GTPBP1-212ENST00000488787 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.2■■■■■ 4.99
GTPBP1-212ENST00000488787 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.09■■■■■ 4.97
GTPBP1-212ENST00000488787 NACADO15069 1562 aa46.06■■■■■ 4.96
GTPBP1-212ENST00000488787 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.03■■■■■ 4.96
GTPBP1-212ENST00000488787 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.92■■■■■ 4.94
GTPBP1-212ENST00000488787 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.88■■■■■ 4.78
GTPBP1-212ENST00000488787 SCRIBQ14160 1630 aa44.86■■■■■ 4.77
GTPBP1-212ENST00000488787 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.53■■■■■ 4.72
GTPBP1-212ENST00000488787 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.45■■■■■ 4.71
GTPBP1-212ENST00000488787 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.32■■■■■ 4.69
GTPBP1-212ENST00000488787 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.27■■■■■ 4.52
GTPBP1-212ENST00000488787 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
GTPBP1-212ENST00000488787 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
GTPBP1-212ENST00000488787 SMARCA4P51532 1647 aa43■■■■■ 4.47
GTPBP1-212ENST00000488787 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.97■■■■■ 4.47
GTPBP1-212ENST00000488787 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.93■■■■■ 4.46
GTPBP1-212ENST00000488787 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.88■■■■■ 4.45
GTPBP1-212ENST00000488787 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
GTPBP1-212ENST00000488787 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.62■■■■■ 4.41
GTPBP1-212ENST00000488787 SMARCA2P51531 1590 aa42.6■■■■■ 4.41
GTPBP1-212ENST00000488787 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.6■■■■■ 4.41
GTPBP1-212ENST00000488787 NCAPD3P42695 1498 aa42.52■■■■■ 4.4
GTPBP1-212ENST00000488787 WIZO95785 1651 aa42.44■■■■■ 4.38
GTPBP1-212ENST00000488787 HMGXB3Q12766 1538 aa42.34■■■■■ 4.37
GTPBP1-212ENST00000488787 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
GTPBP1-212ENST00000488787 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
GTPBP1-212ENST00000488787 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
GTPBP1-212ENST00000488787 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.57■■■■■ 4.25
GTPBP1-212ENST00000488787 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.31■■■■■ 4.2
GTPBP1-212ENST00000488787 NESP48681 1621 aa41.25■■■■■ 4.19
GTPBP1-212ENST00000488787 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.25■■■■■ 4.19
GTPBP1-212ENST00000488787 CFTRP13569 1480 aa41.2■■■■■ 4.19
GTPBP1-212ENST00000488787 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.97■■■■■ 4.15
GTPBP1-212ENST00000488787 PRDM2Q13029 1718 aa40.9■■■■■ 4.14
GTPBP1-212ENST00000488787 ERCC6Q03468 1493 aa40.8■■■■■ 4.12
GTPBP1-212ENST00000488787 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.8■■■■■ 4.12
GTPBP1-212ENST00000488787 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.75■■■■■ 4.11
GTPBP1-212ENST00000488787 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.68■■■■■ 4.1
GTPBP1-212ENST00000488787 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.49■■■■■ 4.07
GTPBP1-212ENST00000488787 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
GTPBP1-212ENST00000488787 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
GTPBP1-212ENST00000488787 WDR62O43379 1518 aa40.33■■■■■ 4.05
GTPBP1-212ENST00000488787 ABCC8Q09428 1581 aa40.3■■■■■ 4.04
GTPBP1-212ENST00000488787 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.24■■■■■ 4.03
GTPBP1-212ENST00000488787 TOPBP1Q92547 1522 aa40.24■■■■■ 4.03
GTPBP1-212ENST00000488787 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.18■■■■■ 4.02
GTPBP1-212ENST00000488787 CUX1P39880 1505 aa40.18■■■■■ 4.02
GTPBP1-212ENST00000488787 CUX2O14529 1486 aa40.16■■■■■ 4.02
GTPBP1-212ENST00000488787 TOP2BQ02880 1626 aa40.02■■■■■ 4
GTPBP1-212ENST00000488787 SYNJ1O43426 1573 aa40.02■■■■■ 4
GTPBP1-212ENST00000488787 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.01■■■■■ 4
GTPBP1-212ENST00000488787 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
GTPBP1-212ENST00000488787 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.93■■■■□ 3.98
GTPBP1-212ENST00000488787 IFT140Q96RY7 1462 aa39.82■■■■□ 3.97
GTPBP1-212ENST00000488787 SOGA1O94964 1423 aa39.82■■■■□ 3.96
GTPBP1-212ENST00000488787 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.75■■■■□ 3.95
GTPBP1-212ENST00000488787 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
GTPBP1-212ENST00000488787 TRIM41Q8WV44 630 aa39.72■■■■□ 3.95
GTPBP1-212ENST00000488787 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.71■■■■□ 3.95
GTPBP1-212ENST00000488787 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.6■■■■□ 3.93
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
GTPBP1-212ENST00000488787 WDR97A6NE52 1622 aa39.55■■■■□ 3.92
GTPBP1-212ENST00000488787 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
GTPBP1-212ENST00000488787 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.45■■■■□ 3.914e-6■□□□□ 10.7
GTPBP1-212ENST00000488787 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
GTPBP1-212ENST00000488787 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.36■■■■□ 3.89
GTPBP1-212ENST00000488787 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.34■■■■□ 3.89
GTPBP1-212ENST00000488787 KIF27Q86VH2 1401 aa39.3■■■■□ 3.88
GTPBP1-212ENST00000488787 GRIN2BQ13224 1484 aa39.25■■■■□ 3.87
GTPBP1-212ENST00000488787 PBRM1Q86U86 1689 aa39.18■■■■□ 3.86
GTPBP1-212ENST00000488787 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.15■■■■□ 3.86
GTPBP1-212ENST00000488787 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.13■■■■□ 3.85
GTPBP1-212ENST00000488787 IGF1RP08069 1367 aa39.09■■■■□ 3.85
GTPBP1-212ENST00000488787 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.07■■■■□ 3.85
GTPBP1-212ENST00000488787 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.85
GTPBP1-212ENST00000488787 EEA1Q15075 1411 aa39.02■■■■□ 3.84
GTPBP1-212ENST00000488787 ADAMTS12P58397 1594 aa38.92■■■■□ 3.82
GTPBP1-212ENST00000488787 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.92■■■■□ 3.82
GTPBP1-212ENST00000488787 SYNJ2O15056 1496 aa38.91■■■■□ 3.82
GTPBP1-212ENST00000488787 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.89■■■■□ 3.82
GTPBP1-212ENST00000488787 CUL7Q14999 1698 aa38.89■■■■□ 3.82
GTPBP1-212ENST00000488787 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.86■■■■□ 3.81
GTPBP1-212ENST00000488787 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.86■■■■□ 3.81
GTPBP1-212ENST00000488787 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.85■■■■□ 3.81
GTPBP1-212ENST00000488787 FBLN2P98095 1184 aa38.83■■■■□ 3.81
GTPBP1-212ENST00000488787 CHD1O14646 1710 aa38.79■■■■□ 3.8
GTPBP1-212ENST00000488787 GRIN2AQ12879 1464 aa38.73■■■■□ 3.79
GTPBP1-212ENST00000488787 PRXQ9BXM0 1461 aa38.73■■■■□ 3.79
GTPBP1-212ENST00000488787 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.68■■■■□ 3.78
GTPBP1-212ENST00000488787 OSCARQ8IYS5 282 aa38.66■■■■□ 3.78
GTPBP1-212ENST00000488787 NUP160Q12769 1436 aa38.55■■■■□ 3.76
GTPBP1-212ENST00000488787 KIF21BO75037 1637 aa38.53■■■■□ 3.76
GTPBP1-212ENST00000488787 CEP170Q5SW79 1584 aa38.5■■■■□ 3.75
GTPBP1-212ENST00000488787 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.41■■■■□ 3.74
GTPBP1-212ENST00000488787 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.36■■■■□ 3.73
GTPBP1-212ENST00000488787 GOLGA3Q08378 1498 aa38.35■■■■□ 3.73
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