RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592068.5

ANKS3-222, Transcript of ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 3, human

TSL 3

Gene ANKS3, Length 916 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ANKS3-222	ENST00000592068	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		38.65	■■■■□ 3.78
ANKS3-222	ENST00000592068	ABCC9	O60706	1549 aa		35.01	■■■■□ 3.2
ANKS3-222	ENST00000592068	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.59	■■■■□ 3.13
ANKS3-222	ENST00000592068	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.23	■■■□□ 2.91
ANKS3-222	ENST00000592068	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.14	■■■□□ 2.9
ANKS3-222	ENST00000592068	NACAD	O15069	1562 aa		32.75	■■■□□ 2.83
ANKS3-222	ENST00000592068	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.48	■■■□□ 2.79
ANKS3-222	ENST00000592068	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.48	■■■□□ 2.79
ANKS3-222	ENST00000592068	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.43	■■■□□ 2.78
ANKS3-222	ENST00000592068	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
ANKS3-222	ENST00000592068	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.17	■■■□□ 2.74
ANKS3-222	ENST00000592068	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ANKS3-222	ENST00000592068	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		31.94	■■■□□ 2.7
ANKS3-222	ENST00000592068	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.7	■■■□□ 2.66
ANKS3-222	ENST00000592068	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.66	■■■□□ 2.66
ANKS3-222	ENST00000592068	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.6	■■■□□ 2.65
ANKS3-222	ENST00000592068	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.45	■■■□□ 2.62
ANKS3-222	ENST00000592068	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
ANKS3-222	ENST00000592068	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		30.93	■■■□□ 2.54
ANKS3-222	ENST00000592068	CUX2	O14529	1486 aa		30.44	■■■□□ 2.46
ANKS3-222	ENST00000592068	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.31	■■■□□ 2.44
ANKS3-222	ENST00000592068	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.18	■■■□□ 2.42
ANKS3-222	ENST00000592068	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.03	■■■□□ 2.4
ANKS3-222	ENST00000592068	HMGXB3	Q12766	1538 aa		29.99	■■■□□ 2.39
ANKS3-222	ENST00000592068	SMARCA2	P51531	1590 aa		29.97	■■■□□ 2.39
ANKS3-222	ENST00000592068	SMARCA4	P51532	1647 aa		29.93	■■■□□ 2.38
ANKS3-222	ENST00000592068	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	29.93	■■■□□ 2.38
ANKS3-222	ENST00000592068	NES	P48681	1621 aa		29.92	■■■□□ 2.38
ANKS3-222	ENST00000592068	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
ANKS3-222	ENST00000592068	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		29.81	■■■□□ 2.36
ANKS3-222	ENST00000592068	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
ANKS3-222	ENST00000592068	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.68	■■■□□ 2.34
ANKS3-222	ENST00000592068	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.63	■■■□□ 2.33
ANKS3-222	ENST00000592068	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		29.62	■■■□□ 2.33
ANKS3-222	ENST00000592068	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.57	■■■□□ 2.32
ANKS3-222	ENST00000592068	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.45	■■■□□ 2.31
ANKS3-222	ENST00000592068	WIZ	O95785	1651 aa		29.45	■■■□□ 2.31
ANKS3-222	ENST00000592068	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.4	■■■□□ 2.3
ANKS3-222	ENST00000592068	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.28	■■■□□ 2.28
ANKS3-222	ENST00000592068	WDR62	O43379	1518 aa		29.25	■■■□□ 2.27
ANKS3-222	ENST00000592068	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.23	■■■□□ 2.27
ANKS3-222	ENST00000592068	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
ANKS3-222	ENST00000592068	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
ANKS3-222	ENST00000592068	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.06	■■■□□ 2.24
ANKS3-222	ENST00000592068	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ANKS3-222	ENST00000592068	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ANKS3-222	ENST00000592068	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ANKS3-222	ENST00000592068	CFTR	P13569	1480 aa		28.8	■■■□□ 2.2
ANKS3-222	ENST00000592068	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
ANKS3-222	ENST00000592068	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.68	■■■□□ 2.18
ANKS3-222	ENST00000592068	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.68	■■■□□ 2.18
ANKS3-222	ENST00000592068	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.68	■■■□□ 2.18
ANKS3-222	ENST00000592068	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.66	■■■□□ 2.18
ANKS3-222	ENST00000592068	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.5	■■■□□ 2.15
ANKS3-222	ENST00000592068	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.47	■■■□□ 2.15
ANKS3-222	ENST00000592068	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.46	■■■□□ 2.15
ANKS3-222	ENST00000592068	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
ANKS3-222	ENST00000592068	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.34	■■■□□ 2.13
ANKS3-222	ENST00000592068	CHD1	O14646	1710 aa		28.3	■■■□□ 2.12
ANKS3-222	ENST00000592068	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.23	■■■□□ 2.11
ANKS3-222	ENST00000592068	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.23	■■■□□ 2.11
ANKS3-222	ENST00000592068	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.22	■■■□□ 2.11
ANKS3-222	ENST00000592068	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
ANKS3-222	ENST00000592068	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.16	■■■□□ 2.1
ANKS3-222	ENST00000592068	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
ANKS3-222	ENST00000592068	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.12	■■■□□ 2.09	3e-7	■■■□□ 18.1
ANKS3-222	ENST00000592068	FBLN2	P98095	1184 aa		28.02	■■■□□ 2.08
ANKS3-222	ENST00000592068	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
ANKS3-222	ENST00000592068	CUX1	P39880	1505 aa		27.93	■■■□□ 2.06
ANKS3-222	ENST00000592068	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ANKS3-222	ENST00000592068	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ANKS3-222	ENST00000592068	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	27.88	■■■□□ 2.05
ANKS3-222	ENST00000592068	WDR97	A6NE52	1622 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ANKS3-222	ENST00000592068	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ANKS3-222	ENST00000592068	SYNJ1	O43426	1573 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ANKS3-222	ENST00000592068	SOGA1	O94964	1423 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ANKS3-222	ENST00000592068	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ANKS3-222	ENST00000592068	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		27.83	■■■□□ 2.04
ANKS3-222	ENST00000592068	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.04
ANKS3-222	ENST00000592068	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
ANKS3-222	ENST00000592068	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
ANKS3-222	ENST00000592068	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ANKS3-222	ENST00000592068	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ANKS3-222	ENST00000592068	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ANKS3-222	ENST00000592068	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ANKS3-222	ENST00000592068	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.66	■■■□□ 2.02
ANKS3-222	ENST00000592068	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ANKS3-222	ENST00000592068	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.56	■■■□□ 2
ANKS3-222	ENST00000592068	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.49	■■□□□ 1.99
ANKS3-222	ENST00000592068	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.4	■■□□□ 1.98
ANKS3-222	ENST00000592068	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.35	■■□□□ 1.97
ANKS3-222	ENST00000592068	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.33	■■□□□ 1.97
ANKS3-222	ENST00000592068	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.32	■■□□□ 1.96
ANKS3-222	ENST00000592068	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.31	■■□□□ 1.96
ANKS3-222	ENST00000592068	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		27.27	■■□□□ 1.96
ANKS3-222	ENST00000592068	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.27	■■□□□ 1.96
ANKS3-222	ENST00000592068	NUP160	Q12769	1436 aa		27.25	■■□□□ 1.95
ANKS3-222	ENST00000592068	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		27.25	■■□□□ 1.95
ANKS3-222	ENST00000592068	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.21	■■□□□ 1.95
ANKS3-222	ENST00000592068	IGF1R	P08069	1367 aa		27.2	■■□□□ 1.94

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