RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319041.6

SH3BGRL3-202, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 768 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-202ENST00000319041 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.24■■■□□ 2.59
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
SH3BGRL3-202ENST00000319041 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ABCC9O60706 1549 aa25.72■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BGRL3-202ENST00000319041 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BGRL3-202ENST00000319041 NACADO15069 1562 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BGRL3-202ENST00000319041 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SCRIBQ14160 1630 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-202ENST00000319041 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-202ENST00000319041 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SH3BGRL3-202ENST00000319041 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SH3BGRL3-202ENST00000319041 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SMARCA4P51532 1647 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BGRL3-202ENST00000319041 WIZO95785 1651 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SMARCA2P51531 1590 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-202ENST00000319041 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BGRL3-202ENST00000319041 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BGRL3-202ENST00000319041 HMGXB3Q12766 1538 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-202ENST00000319041 NCAPD3P42695 1498 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TRIM41Q8WV44 630 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CFTRP13569 1480 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ABCC8Q09428 1581 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PRDM2Q13029 1718 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-202ENST00000319041 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRL3-202ENST00000319041 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SYNJ1O43426 1573 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TOP2BQ02880 1626 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BGRL3-202ENST00000319041 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BGRL3-202ENST00000319041 EEA1Q15075 1411 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BGRL3-202ENST00000319041 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BGRL3-202ENST00000319041 NESP48681 1621 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CUX1P39880 1505 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BGRL3-202ENST00000319041 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SOGA1O94964 1423 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TOPBP1Q92547 1522 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-202ENST00000319041 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-202ENST00000319041 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-202ENST00000319041 KIF27Q86VH2 1401 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRL3-202ENST00000319041 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BGRL3-202ENST00000319041 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BGRL3-202ENST00000319041 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BGRL3-202ENST00000319041 KIF21BO75037 1637 aa22.2■■□□□ 1.15
SH3BGRL3-202ENST00000319041 GOLGA3Q08378 1498 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CUX2O14529 1486 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ERCC6Q03468 1493 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BGRL3-202ENST00000319041 WDR62O43379 1518 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PRXQ9BXM0 1461 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BGRL3-202ENST00000319041 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRL3-202ENST00000319041 WDR97A6NE52 1622 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRL3-202ENST00000319041 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SH3BGRL3-202ENST00000319041 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22■■□□□ 1.11
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRL3-202ENST00000319041 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRL3-202ENST00000319041 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRL3-202ENST00000319041 IGF1RP08069 1367 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRL3-202ENST00000319041 IFT140Q96RY7 1462 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CUL7Q14999 1698 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CEP162Q5TB80 1403 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-202ENST00000319041 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CLIP1P30622 1438 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 GRIN2BQ13224 1484 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PBRM1Q86U86 1689 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.074e-6■■■■■ 31
SH3BGRL3-202ENST00000319041 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ADAMTS12P58397 1594 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BGRL3-202ENST00000319041 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BGRL3-202ENST00000319041 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ARAP1Q96P48 1450 aa21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms