RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590730.5

ANKS3-217, Transcript of ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene ANKS3, Length 2,198 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKS3-217ENST00000590730 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.69■■■■■ 5.86
ANKS3-217ENST00000590730 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.9■■■■■ 4.78
ANKS3-217ENST00000590730 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
ANKS3-217ENST00000590730 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.83■■■■■ 4.45
ANKS3-217ENST00000590730 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.68■■■■■ 4.42
ANKS3-217ENST00000590730 ABCC9O60706 1549 aa42.52■■■■■ 4.4
ANKS3-217ENST00000590730 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.34■■■■■ 4.37
ANKS3-217ENST00000590730 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.14■■■■■ 4.34
ANKS3-217ENST00000590730 NACADO15069 1562 aa41.86■■■■■ 4.29
ANKS3-217ENST00000590730 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.47■■■■■ 4.23
ANKS3-217ENST00000590730 SCRIBQ14160 1630 aa41.4■■■■■ 4.22
ANKS3-217ENST00000590730 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
ANKS3-217ENST00000590730 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.62■■■■■ 4.09
ANKS3-217ENST00000590730 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.25■■■■■ 4.03
ANKS3-217ENST00000590730 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.2■■■■■ 4.03
ANKS3-217ENST00000590730 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.2■■■■■ 4.03
ANKS3-217ENST00000590730 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
ANKS3-217ENST00000590730 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.95■■■■□ 3.99
ANKS3-217ENST00000590730 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
ANKS3-217ENST00000590730 SMARCA4P51532 1647 aa39.67■■■■□ 3.94
ANKS3-217ENST00000590730 WIZO95785 1651 aa39.62■■■■□ 3.93
ANKS3-217ENST00000590730 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.17■■■■□ 3.86
ANKS3-217ENST00000590730 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.16■■■■□ 3.86
ANKS3-217ENST00000590730 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.13■■■■□ 3.85
ANKS3-217ENST00000590730 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.05■■■■□ 3.84
ANKS3-217ENST00000590730 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
ANKS3-217ENST00000590730 SMARCA2P51531 1590 aa38.98■■■■□ 3.83
ANKS3-217ENST00000590730 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.85■■■■□ 3.81
ANKS3-217ENST00000590730 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.81■■■■□ 3.8
ANKS3-217ENST00000590730 NCAPD3P42695 1498 aa38.69■■■■□ 3.78
ANKS3-217ENST00000590730 HMGXB3Q12766 1538 aa38.58■■■■□ 3.77
ANKS3-217ENST00000590730 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.43■■■■□ 3.74
ANKS3-217ENST00000590730 TRIM41Q8WV44 630 aa38.38■■■■□ 3.73
ANKS3-217ENST00000590730 ABCC8Q09428 1581 aa38.05■■■■□ 3.68
ANKS3-217ENST00000590730 CFTRP13569 1480 aa37.86■■■■□ 3.65
ANKS3-217ENST00000590730 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.81■■■■□ 3.64
ANKS3-217ENST00000590730 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.74■■■■□ 3.63
ANKS3-217ENST00000590730 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.7■■■■□ 3.63
ANKS3-217ENST00000590730 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.69■■■■□ 3.62
ANKS3-217ENST00000590730 SYNJ1O43426 1573 aa37.6■■■■□ 3.61
ANKS3-217ENST00000590730 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.59■■■■□ 3.61
ANKS3-217ENST00000590730 PRDM2Q13029 1718 aa37.53■■■■□ 3.6
ANKS3-217ENST00000590730 TOP2BQ02880 1626 aa37.43■■■■□ 3.58
ANKS3-217ENST00000590730 SOGA1O94964 1423 aa37.41■■■■□ 3.58
ANKS3-217ENST00000590730 NESP48681 1621 aa37.37■■■■□ 3.57
ANKS3-217ENST00000590730 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.35■■■■□ 3.57
ANKS3-217ENST00000590730 CUX1P39880 1505 aa37.33■■■■□ 3.57
ANKS3-217ENST00000590730 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.3■■■■□ 3.56
ANKS3-217ENST00000590730 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.29■■■■□ 3.56
ANKS3-217ENST00000590730 EEA1Q15075 1411 aa37.29■■■■□ 3.56
ANKS3-217ENST00000590730 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.26■■■■□ 3.56
ANKS3-217ENST00000590730 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.19■■■■□ 3.54
ANKS3-217ENST00000590730 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.18■■■■□ 3.54
ANKS3-217ENST00000590730 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.08■■■■□ 3.53
ANKS3-217ENST00000590730 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.02■■■■□ 3.52
ANKS3-217ENST00000590730 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.92■■■■□ 3.5
ANKS3-217ENST00000590730 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.91■■■■□ 3.5
ANKS3-217ENST00000590730 TOPBP1Q92547 1522 aa36.89■■■■□ 3.5
ANKS3-217ENST00000590730 KIF27Q86VH2 1401 aa36.84■■■■□ 3.49
ANKS3-217ENST00000590730 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.83■■■■□ 3.49
ANKS3-217ENST00000590730 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
ANKS3-217ENST00000590730 GOLGA3Q08378 1498 aa36.78■■■■□ 3.48
ANKS3-217ENST00000590730 KIF21BO75037 1637 aa36.76■■■■□ 3.48
ANKS3-217ENST00000590730 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
ANKS3-217ENST00000590730 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.73■■■■□ 3.47
ANKS3-217ENST00000590730 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
ANKS3-217ENST00000590730 CUX2O14529 1486 aa36.72■■■■□ 3.47
ANKS3-217ENST00000590730 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.65■■■■□ 3.46
ANKS3-217ENST00000590730 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.62■■■■□ 3.45
ANKS3-217ENST00000590730 PRXQ9BXM0 1461 aa36.62■■■■□ 3.45
ANKS3-217ENST00000590730 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.58■■■■□ 3.45
ANKS3-217ENST00000590730 IGF1RP08069 1367 aa36.56■■■■□ 3.44
ANKS3-217ENST00000590730 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.54■■■■□ 3.44
ANKS3-217ENST00000590730 CEP162Q5TB80 1403 aa36.54■■■■□ 3.44
ANKS3-217ENST00000590730 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.51■■■■□ 3.43
ANKS3-217ENST00000590730 ERCC6Q03468 1493 aa36.42■■■■□ 3.42
ANKS3-217ENST00000590730 WDR97A6NE52 1622 aa36.36■■■■□ 3.41
ANKS3-217ENST00000590730 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.35■■■■□ 3.41
ANKS3-217ENST00000590730 WDR62O43379 1518 aa36.33■■■■□ 3.41
ANKS3-217ENST00000590730 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.41
ANKS3-217ENST00000590730 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
ANKS3-217ENST00000590730 CLIP1P30622 1438 aa36.24■■■■□ 3.39
ANKS3-217ENST00000590730 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.23■■■■□ 3.39
ANKS3-217ENST00000590730 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.23■■■■□ 3.39
ANKS3-217ENST00000590730 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
ANKS3-217ENST00000590730 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
ANKS3-217ENST00000590730 IFT140Q96RY7 1462 aa36.13■■■■□ 3.38
ANKS3-217ENST00000590730 CUL7Q14999 1698 aa36.12■■■■□ 3.37
ANKS3-217ENST00000590730 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.06■■■■□ 3.36
ANKS3-217ENST00000590730 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.05■■■■□ 3.362e-7■■■□□ 18.7
ANKS3-217ENST00000590730 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
ANKS3-217ENST00000590730 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
ANKS3-217ENST00000590730 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
ANKS3-217ENST00000590730 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.92■■■■□ 3.34
ANKS3-217ENST00000590730 PBRM1Q86U86 1689 aa35.91■■■■□ 3.34
ANKS3-217ENST00000590730 GRIN2BQ13224 1484 aa35.91■■■■□ 3.34
ANKS3-217ENST00000590730 ARAP1Q96P48 1450 aa35.84■■■■□ 3.33
ANKS3-217ENST00000590730 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.83■■■■□ 3.33
ANKS3-217ENST00000590730 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.82■■■■□ 3.33
ANKS3-217ENST00000590730 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
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