Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 ODC1-203ENST00000443218 494 ntTSL 217.79■□□□□ 0.441e-323■■□□□ 13
NOLC1Q14978 SNORA80B-201ENST00000383906 136 ntBASIC12.9□□□□□ -0.341e-323■■□□□ 13
NOLC1Q14978 CTNNB1-215ENST00000488914 804 ntTSL 26.77□□□□□ -1.334e-8■■□□□ 13
NOLC1Q14978 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.118e-11■■□□□ 13
NOLC1Q14978 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.028e-11■■□□□ 13
NOLC1Q14978 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.028e-11■■□□□ 13
NOLC1Q14978 DNAJB12-203ENST00000444643 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.088e-11■■□□□ 13
NOLC1Q14978 LDHA-222ENST00000543695 554 ntTSL 512.91□□□□□ -0.342e-8■■□□□ 13
NOLC1Q14978 TFRC-209ENST00000464368 569 ntTSL 410.71□□□□□ -0.695e-14■■□□□ 13
NOLC1Q14978 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.414e-9■■□□□ 13
NOLC1Q14978 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.961e-86■■□□□ 13
NOLC1Q14978 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.352e-11■■□□□ 13
NOLC1Q14978 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.44e-10■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.384e-10■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.094e-10■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 TRMT2A-216ENST00000487668 1040 ntTSL 519.98■□□□□ 0.794e-10■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.694e-10■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 TRMT2A-206ENST00000444845 739 ntTSL 315.95■□□□□ 0.144e-10■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 TRMT2A-213ENST00000480339 762 ntTSL 213.22□□□□□ -0.294e-10■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 LETMD1-236ENST00000553043 727 ntTSL 27.19□□□□□ -1.262e-6■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.061e-6■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.081e-6■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.171e-6■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.181e-6■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 BAG6-237ENST00000375976 3644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.351e-6■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 PTK7-211ENST00000473339 870 ntTSL 317.71■□□□□ 0.432e-10■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 PTK7-220ENST00000497957 713 ntTSL 317.4■□□□□ 0.382e-10■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 PTK7-218ENST00000493339 2987 ntTSL 216.11■□□□□ 0.172e-10■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 PTK7-207ENST00000461389 1035 ntTSL 215.88■□□□□ 0.132e-10■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 PTK7-206ENST00000461100 546 ntTSL 414.9□□□□□ -0.022e-10■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 PTK7-219ENST00000494146 576 ntTSL 411.01□□□□□ -0.652e-10■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 AHSG-201ENST00000273784 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.221e-323■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 AHSG-202ENST00000411641 1711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.411e-323■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.56□□□□□ -2.166e-9■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 AFP-203ENST00000506820 476 ntTSL 24.83□□□□□ -1.642e-60■■□□□ 12.9
NOLC1Q14978 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.161e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.11e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.541e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.291e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.241e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.21e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.151e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.611e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.521e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.623e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.423e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 SDF4-205ENST00000465727 2095 ntTSL 223.89■■□□□ 1.413e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.293e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 PSMB5-201ENST00000334454 796 ntTSL 520.88■□□□□ 0.933e-12■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.83e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.493e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 PSMD4-211ENST00000476855 1232 ntTSL 217.31■□□□□ 0.363e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.063e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 SDF4-203ENST00000403997 728 ntTSL 314.56□□□□□ -0.083e-6■■□□□ 12.8
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NOLC1Q14978 PDXDC1-202ENST00000396410 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.263e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 PDXDC1-217ENST00000570001 4828 ntTSL 213.37□□□□□ -0.273e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 NUMA1-220ENST00000541584 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.09□□□□□ -0.313e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 TERF2IP-202ENST00000564671 1266 ntTSL 212.09□□□□□ -0.473e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 PDXDC1-216ENST00000569715 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.493e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 MMADHC-201ENST00000303319 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.513e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 PSMD4-207ENST00000461434 801 ntTSL 211.82□□□□□ -0.523e-6■■□□□ 12.8
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NOLC1Q14978 SKIV2L2-208ENST00000508716 2185 ntTSL 210.8□□□□□ -0.683e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 PSMD4-208ENST00000462970 900 ntTSL 510.52□□□□□ -0.733e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 SKIV2L2-201ENST00000230640 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.873e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.973e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 MMADHC-202ENST00000422782 1462 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -13e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 KPNB1-209ENST00000580158 603 ntTSL 26.43□□□□□ -1.383e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 SKIV2L2-207ENST00000506750 3271 ntTSL 24.96□□□□□ -1.623e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.413e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.243e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 MAD1L1-205ENST00000421113 564 ntTSL 421.16■□□□□ 0.983e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 AMDHD2-210ENST00000565570 1844 ntTSL 520.62■□□□□ 0.893e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.853e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 MAD1L1-220ENST00000483165 603 ntTSL 419.96■□□□□ 0.793e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 HNRNPK-206ENST00000457156 1283 ntTSL 519.7■□□□□ 0.743e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 MAD1L1-215ENST00000464742 449 ntTSL 517.69■□□□□ 0.423e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.393e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 MAD1L1-210ENST00000444373 535 ntTSL 417.09■□□□□ 0.333e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.313e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 DDB1-216ENST00000539739 1624 ntTSL 516.85■□□□□ 0.293e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 CSNK1E-208ENST00000431611 814 ntTSL 516.54■□□□□ 0.243e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.163e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.143e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 CSNK1E-209ENST00000431632 763 ntTSL 215.64■□□□□ 0.093e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 MICAL3-213ENST00000577821 807 ntTSL 315.61■□□□□ 0.093e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.113e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 MAD1L1-222ENST00000491858 494 ntTSL 414.16□□□□□ -0.143e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.163e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 MICAL3-216ENST00000579997 519 ntTSL 513.8□□□□□ -0.23e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 MICAL3-218ENST00000584751 436 ntTSL 213.79□□□□□ -0.23e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 MICAL3-217ENST00000580469 3622 ntTSL 413.36□□□□□ -0.273e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 CSNK1E-213ENST00000495232 669 ntTSL 213.23□□□□□ -0.293e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 AC016026.1-201ENST00000476405 4328 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.333e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.423e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 CSNK1E-202ENST00000366216 1005 ntTSL 212.16□□□□□ -0.463e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.066e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 58.08□□□□□ -1.123e-6■■□□□ 12.8
NOLC1Q14978 GLUD1-202ENST00000465164 503 ntTSL 27.24□□□□□ -1.253e-6■■□□□ 12.8
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