Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.35e-7■■■■■ 39.7
PCBP2Q15366 LMBR1-212ENST00000448926 3629 ntTSL 24.05□□□□□ -1.762e-7■■■■■ 39.7
PCBP2Q15366 SAMD4A-207ENST00000555112 2287 ntTSL 1 (best)21.18■□□□□ 0.984e-16■■■■■ 39.7
PCBP2Q15366 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 39.7
PCBP2Q15366 RNF130-204ENST00000520911 1790 ntTSL 1 (best)27.24■■□□□ 1.954e-7■■■■■ 39.7
PCBP2Q15366 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.854e-7■■■■■ 39.7
PCBP2Q15366 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.764e-7■■■■■ 39.7
PCBP2Q15366 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.684e-7■■■■■ 39.7
PCBP2Q15366 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.22e-13■■■■■ 39.7
PCBP2Q15366 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.272e-13■■■■■ 39.7
PCBP2Q15366 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-13■■■■■ 39.7
PCBP2Q15366 PCMTD1-203ENST00000519559 1204 ntTSL 26.74□□□□□ -1.332e-13■■■■■ 39.7
PCBP2Q15366 NPIPA1-208ENST00000545831 553 ntTSL 39.78□□□□□ -0.841e-24■■■■■ 39.7
PCBP2Q15366 NPIPA1-201ENST00000328085 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.041e-24■■■■■ 39.7
PCBP2Q15366 VTI1A-206ENST00000489142 727 ntTSL 213.06□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 39.6
PCBP2Q15366 VTI1A-208ENST00000494728 463 ntTSL 210.76□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 39.6
PCBP2Q15366 ALG14-203ENST00000507727 159 ntTSL 54.73□□□□□ -1.654e-10■■■■■ 39.6
PCBP2Q15366 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.74e-10■■■■■ 39.6
PCBP2Q15366 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.947e-7■■■■■ 39.6
PCBP2Q15366 ADAP1-211ENST00000478000 2192 ntTSL 517.93■□□□□ 0.462e-12■■■■■ 39.6
PCBP2Q15366 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.314e-11■■■■■ 39.6
PCBP2Q15366 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.344e-11■■■■■ 39.6
PCBP2Q15366 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.664e-11■■■■■ 39.6
PCBP2Q15366 NDST2-206ENST00000465929 527 ntTSL 510.91□□□□□ -0.663e-10■■■■■ 39.6
PCBP2Q15366 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.341e-8■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.541e-8■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.551e-8■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.69e-7■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 417.88■□□□□ 0.459e-7■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.219e-7■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 PLEKHH3-202ENST00000456950 2406 ntTSL 223.47■■□□□ 1.352e-11■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 RBM19-205ENST00000552384 588 ntTSL 320.03■□□□□ 0.82e-11■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 NSUN4-206ENST00000486270 922 ntTSL 315.31■□□□□ 0.042e-11■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 NSUN4-203ENST00000472157 364 ntTSL 214.83□□□□□ -0.042e-11■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.312e-11■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.452e-11■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.62e-11■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 NSUN4-202ENST00000469918 865 ntTSL 310.8□□□□□ -0.682e-11■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 NSUN4-209ENST00000537428 2087 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.732e-11■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 RBM19-202ENST00000392561 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-11■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 RBM19-203ENST00000545145 4422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.862e-11■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 NDUFA10-206ENST00000419408 662 ntTSL 510.46□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 VLDLR-203ENST00000382100 9163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.493e-9■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.283e-9■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.363e-9■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.393e-9■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 RNF38-208ENST00000488058 582 ntTSL 322.24■■□□□ 1.158e-10■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.15e-7■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.385e-7■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 CHID1-210ENST00000526714 976 ntTSL 510.41□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.295e-7■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 FOXP1-219ENST00000610810 577 ntTSL 513.6□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 39.5
PCBP2Q15366 C11orf95-203ENST00000445014 827 ntTSL 525.6■■□□□ 1.692e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.282e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.12e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 AATK-AS1-202ENST00000571031 1488 ntTSL 1 (best)20.63■□□□□ 0.892e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 C11orf95-201ENST00000338498 723 ntTSL 1 (best)20.48■□□□□ 0.872e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 AATK-AS1-201ENST00000414089 1577 ntTSL 219.87■□□□□ 0.772e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 PTPRU-203ENST00000415600 1590 ntTSL 519.01■□□□□ 0.632e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.592e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.482e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 BAG3-202ENST00000450186 1146 ntTSL 515.57■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 ZNF644-208ENST00000482467 710 ntTSL 515.33■□□□□ 0.042e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 PPP6R3-217ENST00000529344 603 ntTSL 414.88□□□□□ -0.032e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 PPP6R3-215ENST00000528635 538 ntTSL 414.88□□□□□ -0.032e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.082e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 FBLN1-206ENST00000437711 753 ntTSL 514.49□□□□□ -0.092e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.092e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.222e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 CNOT10-205ENST00000435630 2290 ntTSL 1 (best)12.41□□□□□ -0.422e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 FBLN1-203ENST00000340923 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.432e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 THADA-218ENST00000486735 564 ntTSL 411.65□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 FBLN1-215ENST00000460538 543 ntTSL 211.45□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 PPP6R3-204ENST00000393801 5069 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.632e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 PPP6R3-220ENST00000530427 560 ntTSL 511□□□□□ -0.652e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 PPP6R3-205ENST00000524845 2771 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 PPP6R3-226ENST00000534534 2968 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.72e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 PPP6R3-203ENST00000393800 5093 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 PPP6R3-201ENST00000265636 4794 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 PPP6R3-202ENST00000265637 4783 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.842e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 CNOT10-207ENST00000455381 770 ntTSL 59.5□□□□□ -0.892e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 PPP6R3-224ENST00000533127 551 ntTSL 49.34□□□□□ -0.912e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 PPP6R3-219ENST00000529907 826 ntTSL 59.34□□□□□ -0.912e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.092e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 CWC27-204ENST00000508024 2103 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.182e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 CNOT10-209ENST00000463697 719 ntTSL 37.46□□□□□ -1.222e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.222e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 CNOT10-203ENST00000416457 2096 ntTSL 26.88□□□□□ -1.312e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 SEPT7-211ENST00000493626 643 ntTSL 45.05□□□□□ -1.62e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.752e-9■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 39.4
PCBP2Q15366 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 39.4
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