RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520911.5

RNF130-204, Transcript of ring finger protein 130, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RNF130, Length 1,790 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF130-204ENST00000520911 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.46■■■■■ 8.23
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RNF130-204ENST00000520911 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.57■■■■■ 6.49
RNF130-204ENST00000520911 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.37■■■■■ 6.45
RNF130-204ENST00000520911 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.89■■■■■ 6.38
RNF130-204ENST00000520911 NACADO15069 1562 aa54.76■■■■■ 6.36
RNF130-204ENST00000520911 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.69■■■■■ 6.34
RNF130-204ENST00000520911 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.58■■■■■ 6.33
RNF130-204ENST00000520911 SCRIBQ14160 1630 aa53.67■■■■■ 6.18
RNF130-204ENST00000520911 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.45■■■■■ 6.15
RNF130-204ENST00000520911 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.43■■■■■ 6.14
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RNF130-204ENST00000520911 BICRAQ9NZM4 1560 aa53■■■■■ 6.08
RNF130-204ENST00000520911 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.79■■■■■ 5.88
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RNF130-204ENST00000520911 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.32■■■■■ 5.81
RNF130-204ENST00000520911 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.1■■■■■ 5.77
RNF130-204ENST00000520911 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.05■■■■■ 5.76
RNF130-204ENST00000520911 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51■■■■■ 5.75
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RNF130-204ENST00000520911 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.82■■■■■ 5.73
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RNF130-204ENST00000520911 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.73■■■■■ 5.71
RNF130-204ENST00000520911 SMARCA2P51531 1590 aa50.71■■■■■ 5.71
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RNF130-204ENST00000520911 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.2■■■■■ 5.47
RNF130-204ENST00000520911 CFTRP13569 1480 aa49.11■■■■■ 5.45
RNF130-204ENST00000520911 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.03■■■■■ 5.44
RNF130-204ENST00000520911 PRDM2Q13029 1718 aa48.72■■■■■ 5.39
RNF130-204ENST00000520911 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.7■■■■■ 5.39
RNF130-204ENST00000520911 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.65■■■■■ 5.38
RNF130-204ENST00000520911 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.56■■■■■ 5.36
RNF130-204ENST00000520911 ERCC6Q03468 1493 aa48.52■■■■■ 5.36
RNF130-204ENST00000520911 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.46■■■■■ 5.35
RNF130-204ENST00000520911 ABCC8Q09428 1581 aa48.32■■■■■ 5.33
RNF130-204ENST00000520911 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.16■■■■■ 5.3
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RNF130-204ENST00000520911 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.12■■■■■ 5.29
RNF130-204ENST00000520911 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.09■■■■■ 5.29
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RNF130-204ENST00000520911 TOPBP1Q92547 1522 aa48■■■■■ 5.27
RNF130-204ENST00000520911 SYNJ1O43426 1573 aa47.98■■■■■ 5.27
RNF130-204ENST00000520911 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.97■■■■■ 5.27
RNF130-204ENST00000520911 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.95■■■■■ 5.27
RNF130-204ENST00000520911 WDR62O43379 1518 aa47.94■■■■■ 5.27
RNF130-204ENST00000520911 TOP2BQ02880 1626 aa47.85■■■■■ 5.25
RNF130-204ENST00000520911 TRIM41Q8WV44 630 aa47.81■■■■■ 5.24
RNF130-204ENST00000520911 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.81■■■■■ 5.24
RNF130-204ENST00000520911 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.72■■■■■ 5.23
RNF130-204ENST00000520911 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.68■■■■■ 5.22
RNF130-204ENST00000520911 CUX2O14529 1486 aa47.57■■■■■ 5.21
RNF130-204ENST00000520911 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.54■■■■■ 5.2
RNF130-204ENST00000520911 SOGA1O94964 1423 aa47.51■■■■■ 5.2
RNF130-204ENST00000520911 IFT140Q96RY7 1462 aa47.37■■■■■ 5.17
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RNF130-204ENST00000520911 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.25■■■■■ 5.15
RNF130-204ENST00000520911 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.22■■■■■ 5.15
RNF130-204ENST00000520911 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.2■■■■■ 5.15
RNF130-204ENST00000520911 WDR97A6NE52 1622 aa47.19■■■■■ 5.14
RNF130-204ENST00000520911 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.1■■■■■ 5.13
RNF130-204ENST00000520911 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.08■■■■■ 5.13
RNF130-204ENST00000520911 KIF27Q86VH2 1401 aa47■■■■■ 5.11
RNF130-204ENST00000520911 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.98■■■■■ 5.11
RNF130-204ENST00000520911 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.96■■■■■ 5.11
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RNF130-204ENST00000520911 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.95■■■■■ 5.11
RNF130-204ENST00000520911 GRIN2BQ13224 1484 aa46.77■■■■■ 5.08
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RNF130-204ENST00000520911 PBRM1Q86U86 1689 aa46.74■■■■■ 5.07
RNF130-204ENST00000520911 EEA1Q15075 1411 aa46.71■■■■■ 5.07
RNF130-204ENST00000520911 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.67■■■■■ 5.06
RNF130-204ENST00000520911 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.66■■■■■ 5.06
RNF130-204ENST00000520911 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.62■■■■■ 5.05
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RNF130-204ENST00000520911 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.42■■■■■ 5.02
RNF130-204ENST00000520911 FBLN2P98095 1184 aa46.39■■■■■ 5.02
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RNF130-204ENST00000520911 SYNJ2O15056 1496 aa46.33■■■■■ 5.01
RNF130-204ENST00000520911 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.33■■■■■ 5.01
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RNF130-204ENST00000520911 CHD1O14646 1710 aa46.2■■■■■ 4.99
RNF130-204ENST00000520911 GRIN2AQ12879 1464 aa46.19■■■■■ 4.98
RNF130-204ENST00000520911 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.12■■■■■ 4.97
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RNF130-204ENST00000520911 NUP160Q12769 1436 aa45.91■■■■■ 4.94
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