Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 PIK3C2A-203ENST00000531428 1593 ntTSL 1 (best)15.73■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 KIAA1328-210ENST00000592611 1798 ntTSL 215.69■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EXOC5-208ENST00000556318 518 ntTSL 415.67■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 NUP62-206ENST00000595463 563 ntTSL 415.63■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 COL16A1-209ENST00000470799 826 ntTSL 515.59■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UGP2-221ENST00000488245 784 ntTSL 515.5■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC23A2-204ENST00000468355 1934 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.069e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ELF3-209ENST00000495848 899 ntTSL 215.43■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TGFA-209ENST00000474101 147 ntTSL 515.42■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SCRN2-211ENST00000583090 683 ntTSL 315.4■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATG4B-203ENST00000400772 625 ntTSL 415.4■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GPR89B-204ENST00000478307 2633 ntTSL 215.39■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 AIMP2-204ENST00000415999 777 ntTSL 315.36■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.053e-11■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMEM94-232ENST00000585105 5632 ntTSL 215.34■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 FAM117A-205ENST00000505159 739 ntTSL 315.32■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.039e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 WDR41-206ENST00000506307 582 ntTSL 315.25■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SCAMP2-210ENST00000569124 538 ntTSL 415.23■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 RPS5-203ENST00000596314 718 ntTSL 515.2■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SORD-204ENST00000558789 1553 ntTSL 215.18■□□□□ 0.029e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 NDUFA7-202ENST00000593729 569 ntTSL 215.11■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 02e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 02e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SCAMP2-205ENST00000564529 866 ntTSL 215.06■□□□□ 02e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 01e-6■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -02e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -02e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SMG7-210ENST00000502375 566 ntTSL 515□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC29A1-210ENST00000472176 1225 ntTSL 514.99□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SCRN2-207ENST00000581546 1237 ntTSL 1 (best)14.95□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 IDUA-207ENST00000509744 428 ntTSL 314.92□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TSNAX-DISC1-203ENST00000602885 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.9□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SCRN2-203ENST00000578323 624 ntTSL 514.87□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 AP3M1-204ENST00000487653 550 ntTSL 314.85□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.039e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 COL16A1-213ENST00000482910 676 ntTSL 514.84□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 ATG4B-215ENST00000468018 721 ntTSL 514.8□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 NDUFA7-204ENST00000601101 414 ntTSL 414.79□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 62.8
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TBRG4Q969Z0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 FGFR1-222ENST00000487647 1608 ntTSL 1 (best)14.71□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CTIF-205ENST00000587860 2940 ntTSL 214.69□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 JADE2-209ENST00000512386 567 ntTSL 414.66□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ACVR2B-202ENST00000461232 5370 ntTSL 1 (best)14.65□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PPP1R12A-208ENST00000547330 2275 ntTSL 1 (best)14.65□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PPP5C-205ENST00000478046 1886 ntTSL 1 (best)14.6□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ENPP7-202ENST00000576512 2002 ntTSL 214.56□□□□□ -0.089e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.099e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 62.8
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