Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX8Q9Y5X2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX8Q9Y5X2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX8Q9Y5X2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX8Q9Y5X2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX8Q9Y5X2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX8Q9Y5X2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX8Q9Y5X2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX8Q9Y5X2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX8Q9Y5X2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX8Q9Y5X2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX8Q9Y5X2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX8Q9Y5X2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX8Q9Y5X2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNX8Q9Y5X2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX8Q9Y5X2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX8Q9Y5X2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX8Q9Y5X2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX8Q9Y5X2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX8Q9Y5X2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX8Q9Y5X2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX8Q9Y5X2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX8Q9Y5X2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX8Q9Y5X2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX8Q9Y5X2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX8Q9Y5X2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX8Q9Y5X2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX8Q9Y5X2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX8Q9Y5X2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX8Q9Y5X2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX8Q9Y5X2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX8Q9Y5X2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX8Q9Y5X2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX8Q9Y5X2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX8Q9Y5X2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX8Q9Y5X2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX8Q9Y5X2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX8Q9Y5X2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX8Q9Y5X2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX8Q9Y5X2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX8Q9Y5X2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX8Q9Y5X2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX8Q9Y5X2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX8Q9Y5X2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX8Q9Y5X2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX8Q9Y5X2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX8Q9Y5X2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX8Q9Y5X2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX8Q9Y5X2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX8Q9Y5X2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX8Q9Y5X2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX8Q9Y5X2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX8Q9Y5X2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX8Q9Y5X2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX8Q9Y5X2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX8Q9Y5X2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX8Q9Y5X2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX8Q9Y5X2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX8Q9Y5X2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX8Q9Y5X2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX8Q9Y5X2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX8Q9Y5X2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX8Q9Y5X2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX8Q9Y5X2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX8Q9Y5X2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms