Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKAB1Q9Y478 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKAB1Q9Y478 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKAB1Q9Y478 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKAB1Q9Y478 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKAB1Q9Y478 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKAB1Q9Y478 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKAB1Q9Y478 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKAB1Q9Y478 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKAB1Q9Y478 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKAB1Q9Y478 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKAB1Q9Y478 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKAB1Q9Y478 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKAB1Q9Y478 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKAB1Q9Y478 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKAB1Q9Y478 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRKAB1Q9Y478 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKAB1Q9Y478 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKAB1Q9Y478 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKAB1Q9Y478 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKAB1Q9Y478 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKAB1Q9Y478 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKAB1Q9Y478 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKAB1Q9Y478 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKAB1Q9Y478 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKAB1Q9Y478 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKAB1Q9Y478 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKAB1Q9Y478 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKAB1Q9Y478 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKAB1Q9Y478 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKAB1Q9Y478 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKAB1Q9Y478 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKAB1Q9Y478 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKAB1Q9Y478 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKAB1Q9Y478 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKAB1Q9Y478 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKAB1Q9Y478 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKAB1Q9Y478 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKAB1Q9Y478 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKAB1Q9Y478 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKAB1Q9Y478 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKAB1Q9Y478 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKAB1Q9Y478 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKAB1Q9Y478 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKAB1Q9Y478 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKAB1Q9Y478 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKAB1Q9Y478 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKAB1Q9Y478 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKAB1Q9Y478 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKAB1Q9Y478 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKAB1Q9Y478 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKAB1Q9Y478 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKAB1Q9Y478 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKAB1Q9Y478 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKAB1Q9Y478 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKAB1Q9Y478 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PRKAB1Q9Y478 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PRKAB1Q9Y478 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKAB1Q9Y478 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKAB1Q9Y478 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKAB1Q9Y478 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKAB1Q9Y478 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKAB1Q9Y478 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKAB1Q9Y478 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKAB1Q9Y478 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKAB1Q9Y478 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKAB1Q9Y478 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKAB1Q9Y478 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKAB1Q9Y478 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKAB1Q9Y478 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAB1Q9Y478 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAB1Q9Y478 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAB1Q9Y478 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKAB1Q9Y478 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRKAB1Q9Y478 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKAB1Q9Y478 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKAB1Q9Y478 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKAB1Q9Y478 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKAB1Q9Y478 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB1Q9Y478 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB1Q9Y478 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB1Q9Y478 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKAB1Q9Y478 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKAB1Q9Y478 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKAB1Q9Y478 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKAB1Q9Y478 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKAB1Q9Y478 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKAB1Q9Y478 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKAB1Q9Y478 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKAB1Q9Y478 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRKAB1Q9Y478 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKAB1Q9Y478 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKAB1Q9Y478 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKAB1Q9Y478 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKAB1Q9Y478 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAB1Q9Y478 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAB1Q9Y478 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKAB1Q9Y478 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAB1Q9Y478 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAB1Q9Y478 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms