Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD3Q9UJU5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD3Q9UJU5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD3Q9UJU5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD3Q9UJU5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD3Q9UJU5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD3Q9UJU5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD3Q9UJU5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD3Q9UJU5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD3Q9UJU5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD3Q9UJU5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD3Q9UJU5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD3Q9UJU5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD3Q9UJU5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD3Q9UJU5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD3Q9UJU5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD3Q9UJU5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD3Q9UJU5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD3Q9UJU5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD3Q9UJU5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD3Q9UJU5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD3Q9UJU5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD3Q9UJU5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD3Q9UJU5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD3Q9UJU5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD3Q9UJU5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD3Q9UJU5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD3Q9UJU5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXD3Q9UJU5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXD3Q9UJU5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD3Q9UJU5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXD3Q9UJU5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD3Q9UJU5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD3Q9UJU5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD3Q9UJU5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD3Q9UJU5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD3Q9UJU5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD3Q9UJU5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD3Q9UJU5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD3Q9UJU5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD3Q9UJU5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD3Q9UJU5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD3Q9UJU5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD3Q9UJU5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD3Q9UJU5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD3Q9UJU5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD3Q9UJU5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD3Q9UJU5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD3Q9UJU5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD3Q9UJU5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD3Q9UJU5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD3Q9UJU5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD3Q9UJU5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD3Q9UJU5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD3Q9UJU5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD3Q9UJU5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD3Q9UJU5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD3Q9UJU5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD3Q9UJU5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD3Q9UJU5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD3Q9UJU5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD3Q9UJU5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD3Q9UJU5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD3Q9UJU5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD3Q9UJU5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD3Q9UJU5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD3Q9UJU5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD3Q9UJU5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD3Q9UJU5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD3Q9UJU5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD3Q9UJU5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD3Q9UJU5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD3Q9UJU5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD3Q9UJU5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD3Q9UJU5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD3Q9UJU5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms