Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGAP28Q9P2N2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARHGAP28Q9P2N2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARHGAP28Q9P2N2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARHGAP28Q9P2N2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARHGAP28Q9P2N2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARHGAP28Q9P2N2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARHGAP28Q9P2N2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGAP28Q9P2N2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGAP28Q9P2N2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGAP28Q9P2N2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARHGAP28Q9P2N2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGAP28Q9P2N2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGAP28Q9P2N2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGAP28Q9P2N2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGAP28Q9P2N2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGAP28Q9P2N2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGAP28Q9P2N2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGAP28Q9P2N2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP28Q9P2N2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP28Q9P2N2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP28Q9P2N2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP28Q9P2N2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP28Q9P2N2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP28Q9P2N2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGAP28Q9P2N2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGAP28Q9P2N2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGAP28Q9P2N2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP28Q9P2N2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP28Q9P2N2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP28Q9P2N2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGAP28Q9P2N2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARHGAP28Q9P2N2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARHGAP28Q9P2N2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARHGAP28Q9P2N2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARHGAP28Q9P2N2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARHGAP28Q9P2N2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARHGAP28Q9P2N2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARHGAP28Q9P2N2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGAP28Q9P2N2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGAP28Q9P2N2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGAP28Q9P2N2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGAP28Q9P2N2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGAP28Q9P2N2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARHGAP28Q9P2N2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARHGAP28Q9P2N2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARHGAP28Q9P2N2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARHGAP28Q9P2N2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARHGAP28Q9P2N2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ARHGAP28Q9P2N2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARHGAP28Q9P2N2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARHGAP28Q9P2N2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARHGAP28Q9P2N2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARHGAP28Q9P2N2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARHGAP28Q9P2N2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARHGAP28Q9P2N2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARHGAP28Q9P2N2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARHGAP28Q9P2N2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARHGAP28Q9P2N2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGAP28Q9P2N2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGAP28Q9P2N2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGAP28Q9P2N2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGAP28Q9P2N2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGAP28Q9P2N2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGAP28Q9P2N2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGAP28Q9P2N2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGAP28Q9P2N2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGAP28Q9P2N2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGAP28Q9P2N2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGAP28Q9P2N2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGAP28Q9P2N2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGAP28Q9P2N2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGAP28Q9P2N2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGAP28Q9P2N2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGAP28Q9P2N2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGAP28Q9P2N2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGAP28Q9P2N2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms