Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RTEL1Q9NZ71 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RTEL1Q9NZ71 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RTEL1Q9NZ71 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RTEL1Q9NZ71 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RTEL1Q9NZ71 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RTEL1Q9NZ71 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RTEL1Q9NZ71 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RTEL1Q9NZ71 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RTEL1Q9NZ71 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RTEL1Q9NZ71 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RTEL1Q9NZ71 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RTEL1Q9NZ71 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RTEL1Q9NZ71 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RTEL1Q9NZ71 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RTEL1Q9NZ71 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RTEL1Q9NZ71 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
RTEL1Q9NZ71 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RTEL1Q9NZ71 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RTEL1Q9NZ71 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RTEL1Q9NZ71 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RTEL1Q9NZ71 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RTEL1Q9NZ71 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
RTEL1Q9NZ71 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RTEL1Q9NZ71 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
RTEL1Q9NZ71 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RTEL1Q9NZ71 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RTEL1Q9NZ71 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RTEL1Q9NZ71 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RTEL1Q9NZ71 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RTEL1Q9NZ71 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
RTEL1Q9NZ71 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RTEL1Q9NZ71 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RTEL1Q9NZ71 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RTEL1Q9NZ71 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RTEL1Q9NZ71 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RTEL1Q9NZ71 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RTEL1Q9NZ71 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RTEL1Q9NZ71 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RTEL1Q9NZ71 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RTEL1Q9NZ71 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RTEL1Q9NZ71 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RTEL1Q9NZ71 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RTEL1Q9NZ71 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RTEL1Q9NZ71 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RTEL1Q9NZ71 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RTEL1Q9NZ71 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
RTEL1Q9NZ71 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RTEL1Q9NZ71 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RTEL1Q9NZ71 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RTEL1Q9NZ71 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RTEL1Q9NZ71 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RTEL1Q9NZ71 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RTEL1Q9NZ71 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RTEL1Q9NZ71 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RTEL1Q9NZ71 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RTEL1Q9NZ71 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RTEL1Q9NZ71 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
RTEL1Q9NZ71 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
RTEL1Q9NZ71 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RTEL1Q9NZ71 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RTEL1Q9NZ71 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RTEL1Q9NZ71 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RTEL1Q9NZ71 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RTEL1Q9NZ71 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RTEL1Q9NZ71 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RTEL1Q9NZ71 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RTEL1Q9NZ71 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RTEL1Q9NZ71 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RTEL1Q9NZ71 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RTEL1Q9NZ71 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RTEL1Q9NZ71 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RTEL1Q9NZ71 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
RTEL1Q9NZ71 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RTEL1Q9NZ71 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RTEL1Q9NZ71 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RTEL1Q9NZ71 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RTEL1Q9NZ71 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RTEL1Q9NZ71 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RTEL1Q9NZ71 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
RTEL1Q9NZ71 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RTEL1Q9NZ71 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RTEL1Q9NZ71 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RTEL1Q9NZ71 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
RTEL1Q9NZ71 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RTEL1Q9NZ71 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RTEL1Q9NZ71 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RTEL1Q9NZ71 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RTEL1Q9NZ71 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RTEL1Q9NZ71 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
RTEL1Q9NZ71 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RTEL1Q9NZ71 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RTEL1Q9NZ71 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RTEL1Q9NZ71 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RTEL1Q9NZ71 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RTEL1Q9NZ71 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RTEL1Q9NZ71 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RTEL1Q9NZ71 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RTEL1Q9NZ71 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RTEL1Q9NZ71 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms